More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2204 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2204  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 379 aa  729    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382652 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4138  DNA protecting protein DprA  63.37 
 
 		 388 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1967  DNA protecting protein DprA  64.17 
 
 		 376 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1987  DNA processing protein DprA, putative  63.9 
 
 		 376 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2033  DNA protecting protein DprA  63.9 
 
 		 376 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.677839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12910  hypothetical protein  66.31 
 
 		 389 aa  413  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000201466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2097  DNA protecting protein DprA  51.21 
 
 		 374 aa  324  2e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1643  DNA protecting protein DprA  51.84 
 
 		 388 aa  321  9.999999999999999e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0293529  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09850  DNA protecting protein DprA  51.3 
 
 		 383 aa  314  9.999999999999999e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3996  DNA protecting protein DprA  49.61 
 
 		 422 aa  290  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1548  DNA protecting protein DprA  46.92 
 
 		 391 aa  268  1e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.20886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1858  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  44.95 
 
 		 396 aa  250  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  hitchhiker  0.00651172 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1409  DNA protecting protein DprA  49.73 
 
 		 395 aa  246  4e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.79779  normal  0.0660954 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1318  DNA protecting protein DprA  44.96 
 
 		 444 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1209  DNA protecting protein DprA  43.46 
 
 		 452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0990  DNA protecting protein DprA  42.96 
 
 		 475 aa  241  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638055  normal  0.0748697 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1158  DNA protecting protein DprA  46.42 
 
 		 408 aa  239  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134749  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3121  DNA protecting protein DprA  44.2 
 
 		 423 aa  239  5.999999999999999e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0011897  normal  0.148234 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3415  DNA protecting protein DprA  43.96 
 
 		 387 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1177  DNA protecting protein DprA  45.05 
 
 		 402 aa  238  1e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2191  DNA protecting protein DprA  47.57 
 
 		 384 aa  236  6e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0946717  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09260  DNA protecting protein DprA  46.94 
 
 		 424 aa  236  7e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.180441  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3584  DNA processing protein DprA, putative  49.21 
 
 		 446 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1524  DNA protecting protein DprA  43.88 
 
 		 600 aa  234  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  hitchhiker  0.00583447 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23650  DNA protecting protein DprA  42.61 
 
 		 399 aa  229  6e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0566962  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0671  SMF protein  43.8 
 
 		 394 aa  228  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2472  DNA protecting protein DprA  42.08 
 
 		 394 aa  226  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156193  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3246  DNA protecting protein DprA  43.65 
 
 		 378 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.261915  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2511  DNA protecting protein DprA  44.35 
 
 		 386 aa  215  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2211  DNA protecting protein DprA  44.02 
 
 		 402 aa  213  5.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000321708 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1480  DNA protecting protein DprA  51.24 
 
 		 402 aa  212  9e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173906  normal  0.04573 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2268  DNA protecting protein DprA  44.22 
 
 		 349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0233  DNA protecting protein DprA  47.06 
 
 		 400 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10090  DNA protecting protein DprA  50.17 
 
 		 428 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11160  DNA protecting protein DprA  40.38 
 
 		 371 aa  186  6e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0892181  normal  0.950847 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5401  SMF family protein  42.69 
 
 		 310 aa  184  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.219936  normal  0.277255 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1000  DNA protecting protein DprA  39.01 
 
 		 395 aa  182  6e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  36.6 
 
 		 360 aa  169  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0295  DNA processing protein DprA, putative  40.07 
 
 		 374 aa  163  5.0000000000000005e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.332984 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  40.29 
 
 		 365 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  33.99 
 
 		 362 aa  159  6e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  36.54 
 
 		 366 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  35.71 
 
 		 368 aa  157  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  36.99 
 
 		 360 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  34.18 
 
 		 337 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0663  DNA protecting protein DprA  30.54 
 
 		 364 aa  154  2.9999999999999998e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.802271  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1317  DNA protecting protein DprA  32.7 
 
 		 330 aa  153  4e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  34.18 
 
 		 337 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  35.11 
 
 		 386 aa  152  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2345  DNA processing protein DprA, putative  41.01 
 
 		 358 aa  150  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  31.45 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  32.83 
 
 		 370 aa  150  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  28.79 
 
 		 360 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  37.34 
 
 		 394 aa  150  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  31.67 
 
 		 374 aa  150  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  38.03 
 
 		 367 aa  150  4e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1230  hypothetical protein  34.69 
 
 		 374 aa  149  9e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0232015 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  31.06 
 
 		 748 aa  149  9e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  35.22 
 
 		 406 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  33.48 
 
 		 360 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  34.38 
 
 		 373 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1572  DNA protecting protein DprA  30.34 
 
 		 333 aa  147  4.0000000000000006e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1867  DNA protecting protein DprA  34.86 
 
 		 381 aa  146  6e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6935  DNA protecting protein DprA  32.35 
 
 		 378 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.482636 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  32.2 
 
 		 364 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1931  DNA processing chain A  34.86 
 
 		 381 aa  145  9e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  37.89 
 
 		 356 aa  145  9e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  37.54 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  35.91 
 
 		 385 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  38.01 
 
 		 361 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  40.29 
 
 		 434 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0141  DNA processing protein DprA, putative  40.29 
 
 		 396 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0345  SMF family protein  40.29 
 
 		 434 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  40.29 
 
 		 434 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2350  DNA protecting protein DprA  40.29 
 
 		 434 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0995  DNA protecting protein DprA  30.22 
 
 		 366 aa  144  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0026  DNA protecting protein DprA  37.77 
 
 		 338 aa  144  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2273  DNA protecting protein DprA  40.29 
 
 		 396 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2808  DNA protecting protein DprA  40.29 
 
 		 434 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  35.16 
 
 		 374 aa  143  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  40.23 
 
 		 372 aa  143  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  34.71 
 
 		 336 aa  142  7e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  35.61 
 
 		 387 aa  142  8e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  36.75 
 
 		 389 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  34.76 
 
 		 369 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  40.76 
 
 		 366 aa  142  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  36.33 
 
 		 373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  36.81 
 
 		 375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0127  DNA processing protein DprA, putative  39.36 
 
 		 433 aa  140  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1348  DNA protecting protein DprA  38.38 
 
 		 361 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0122196  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  34.09 
 
 		 382 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1020  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  40 
 
 		 295 aa  140  4.999999999999999e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.274867  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1277  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  37.44 
 
 		 288 aa  140  4.999999999999999e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  33.76 
 
 		 369 aa  139  6e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  31.18 
 
 		 349 aa  139  7.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  38.35 
 
 		 365 aa  138  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2083  transcriptional regulator TrmB  35 
 
 		 337 aa  138  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  31.39 
 
 		 372 aa  138  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  34.27 
 
 		 389 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  40.64 
 
 		 399 aa  138  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>