More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4138 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4138  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 388 aa  759    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1967  DNA protecting protein DprA  64.97 
 
 		 376 aa  448  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1987  DNA processing protein DprA, putative  64.71 
 
 		 376 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2033  DNA protecting protein DprA  64.71 
 
 		 376 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.677839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2204  transcriptional regulator, TrmB  63.37 
 
 		 379 aa  419  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12910  hypothetical protein  63.1 
 
 		 389 aa  387  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000201466  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1643  DNA protecting protein DprA  51.19 
 
 		 388 aa  318  2e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0293529  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2097  DNA protecting protein DprA  49.73 
 
 		 374 aa  313  2.9999999999999996e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09850  DNA protecting protein DprA  49.34 
 
 		 383 aa  298  1e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3996  DNA protecting protein DprA  47.44 
 
 		 422 aa  271  2e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1548  DNA protecting protein DprA  47.24 
 
 		 391 aa  256  7e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.20886 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1209  DNA protecting protein DprA  42.56 
 
 		 452 aa  248  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1318  DNA protecting protein DprA  42.56 
 
 		 444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1858  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  42.04 
 
 		 396 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  hitchhiker  0.00651172 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3121  DNA protecting protein DprA  42.36 
 
 		 423 aa  239  5.999999999999999e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0011897  normal  0.148234 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3415  DNA protecting protein DprA  43.43 
 
 		 387 aa  238  9e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2191  DNA protecting protein DprA  46.25 
 
 		 384 aa  235  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0946717  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1409  DNA protecting protein DprA  44.68 
 
 		 395 aa  229  7e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.79779  normal  0.0660954 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1158  DNA protecting protein DprA  43.39 
 
 		 408 aa  228  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134749  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1177  DNA protecting protein DprA  47.5 
 
 		 402 aa  226  4e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0671  SMF protein  46.39 
 
 		 394 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1524  DNA protecting protein DprA  47 
 
 		 600 aa  225  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  hitchhiker  0.00583447 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0990  DNA protecting protein DprA  47.12 
 
 		 475 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638055  normal  0.0748697 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2472  DNA protecting protein DprA  44.48 
 
 		 394 aa  220  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156193  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2211  DNA protecting protein DprA  45.71 
 
 		 402 aa  219  7e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000321708 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2511  DNA protecting protein DprA  46.11 
 
 		 386 aa  217  2.9999999999999998e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3584  DNA processing protein DprA, putative  46.82 
 
 		 446 aa  217  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23650  DNA protecting protein DprA  44.69 
 
 		 399 aa  216  4e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0566962  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3246  DNA protecting protein DprA  46.73 
 
 		 378 aa  216  5e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.261915  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09260  DNA protecting protein DprA  44.69 
 
 		 424 aa  205  1e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.180441  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0233  DNA protecting protein DprA  47.19 
 
 		 400 aa  203  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11160  DNA protecting protein DprA  41.62 
 
 		 371 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0892181  normal  0.950847 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1480  DNA protecting protein DprA  48.96 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173906  normal  0.04573 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5401  SMF family protein  45.08 
 
 		 310 aa  189  9e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.219936  normal  0.277255 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2268  DNA protecting protein DprA  46.84 
 
 		 349 aa  186  8e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10090  DNA protecting protein DprA  46.2 
 
 		 428 aa  182  8.000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1000  DNA protecting protein DprA  36.87 
 
 		 395 aa  179  5.999999999999999e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  40.54 
 
 		 360 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  42.12 
 
 		 365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  38.14 
 
 		 366 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  43.31 
 
 		 361 aa  166  5.9999999999999996e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  39.63 
 
 		 360 aa  166  9e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  41.51 
 
 		 365 aa  159  7e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  40.22 
 
 		 405 aa  158  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1317  DNA protecting protein DprA  32.38 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  32.28 
 
 		 370 aa  157  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  36.13 
 
 		 406 aa  155  8e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0026  DNA protecting protein DprA  38.99 
 
 		 338 aa  155  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  33.13 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  40.68 
 
 		 387 aa  154  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_002950  PG0295  DNA processing protein DprA, putative  33.99 
 
 		 374 aa  154  2.9999999999999998e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.332984 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  36.59 
 
 		 386 aa  154  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  33.13 
 
 		 337 aa  153  5e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  40.41 
 
 		 362 aa  153  5e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0663  DNA protecting protein DprA  31.17 
 
 		 364 aa  152  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.802271  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  35.48 
 
 		 373 aa  152  1e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  33.87 
 
 		 362 aa  151  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  36.05 
 
 		 375 aa  150  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  44.16 
 
 		 374 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  35.13 
 
 		 748 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  37.93 
 
 		 364 aa  150  4e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  37.32 
 
 		 374 aa  150  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  37.41 
 
 		 336 aa  149  9e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  38.49 
 
 		 359 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  35.16 
 
 		 373 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  37.23 
 
 		 368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  40.29 
 
 		 365 aa  149  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  34.32 
 
 		 364 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  39.26 
 
 		 367 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  33.06 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  33.7 
 
 		 356 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2345  DNA processing protein DprA, putative  40.15 
 
 		 358 aa  148  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  44.16 
 
 		 399 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  30.36 
 
 		 360 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  35.74 
 
 		 368 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  36.91 
 
 		 366 aa  147  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0995  DNA protecting protein DprA  32.56 
 
 		 366 aa  147  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  37.55 
 
 		 368 aa  147  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  36.36 
 
 		 331 aa  147  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  38.49 
 
 		 359 aa  147  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  35.76 
 
 		 375 aa  147  4.0000000000000006e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  38.95 
 
 		 394 aa  146  7.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1348  DNA protecting protein DprA  38.72 
 
 		 361 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0122196  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  37.62 
 
 		 356 aa  145  9e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  34.95 
 
 		 383 aa  145  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  43.08 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  36.86 
 
 		 338 aa  145  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  48.37 
 
 		 366 aa  145  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  30 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0637  DNA protecting protein DprA  30.06 
 
 		 514 aa  145  2e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.3144 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  36.86 
 
 		 338 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  40.55 
 
 		 434 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  40.55 
 
 		 434 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  42.74 
 
 		 372 aa  143  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  36.5 
 
 		 338 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0345  SMF family protein  44.5 
 
 		 434 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  36.39 
 
 		 371 aa  143  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2808  DNA protecting protein DprA  44.5 
 
 		 434 aa  143  6e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  35.24 
 
 		 364 aa  143  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  36.5 
 
 		 338 aa  143  6e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>