More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_23650 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_23650  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 399 aa  748    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0566962  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1177  DNA protecting protein DprA  51.91 
 
 		 402 aa  310  2e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1480  DNA protecting protein DprA  50.9 
 
 		 402 aa  288  8e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173906  normal  0.04573 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2211  DNA protecting protein DprA  48.25 
 
 		 402 aa  288  8e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000321708 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2511  DNA protecting protein DprA  48.74 
 
 		 386 aa  286  4e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2472  DNA protecting protein DprA  46.37 
 
 		 394 aa  283  5.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156193  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09260  DNA protecting protein DprA  46.46 
 
 		 424 aa  275  1.0000000000000001e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.180441  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1000  DNA protecting protein DprA  42.36 
 
 		 395 aa  244  9.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1858  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  42.31 
 
 		 396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  hitchhiker  0.00651172 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1409  DNA protecting protein DprA  47.61 
 
 		 395 aa  243  3.9999999999999997e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.79779  normal  0.0660954 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11160  DNA protecting protein DprA  45.15 
 
 		 371 aa  234  3e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0892181  normal  0.950847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1987  DNA processing protein DprA, putative  42.14 
 
 		 376 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1967  DNA protecting protein DprA  42.29 
 
 		 376 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2033  DNA protecting protein DprA  42.14 
 
 		 376 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.677839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1548  DNA protecting protein DprA  44.22 
 
 		 391 aa  225  1e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.20886 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0990  DNA protecting protein DprA  43.7 
 
 		 475 aa  224  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638055  normal  0.0748697 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1524  DNA protecting protein DprA  48.58 
 
 		 600 aa  223  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  hitchhiker  0.00583447 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0671  SMF protein  42.75 
 
 		 394 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09850  DNA protecting protein DprA  46.39 
 
 		 383 aa  218  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2204  transcriptional regulator, TrmB  42.61 
 
 		 379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382652 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4138  DNA protecting protein DprA  44.69 
 
 		 388 aa  216  4e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10090  DNA protecting protein DprA  45.16 
 
 		 428 aa  216  5e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2097  DNA protecting protein DprA  44.9 
 
 		 374 aa  215  9e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3415  DNA protecting protein DprA  46.95 
 
 		 387 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1643  DNA protecting protein DprA  40.79 
 
 		 388 aa  213  7e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0293529  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3996  DNA protecting protein DprA  42.44 
 
 		 422 aa  211  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3121  DNA protecting protein DprA  46.27 
 
 		 423 aa  209  5e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0011897  normal  0.148234 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12910  hypothetical protein  40.66 
 
 		 389 aa  207  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000201466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1318  DNA protecting protein DprA  39.85 
 
 		 444 aa  206  4e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1209  DNA protecting protein DprA  38.63 
 
 		 452 aa  206  7e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1158  DNA protecting protein DprA  43.05 
 
 		 408 aa  201  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134749  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3246  DNA protecting protein DprA  44.04 
 
 		 378 aa  199  5e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.261915  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3584  DNA processing protein DprA, putative  45.37 
 
 		 446 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2268  DNA protecting protein DprA  41.85 
 
 		 349 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2191  DNA protecting protein DprA  43.52 
 
 		 384 aa  185  9e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0946717  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5401  SMF family protein  43.23 
 
 		 310 aa  166  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.219936  normal  0.277255 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0233  DNA protecting protein DprA  43.13 
 
 		 400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  34.21 
 
 		 370 aa  159  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  37.47 
 
 		 379 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  31.91 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  37.25 
 
 		 360 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  33.65 
 
 		 366 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  37.23 
 
 		 366 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  35.07 
 
 		 385 aa  153  7e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  38.12 
 
 		 363 aa  152  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  37.74 
 
 		 360 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  33.98 
 
 		 374 aa  150  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4729  DNA processing chain A (DprA/Smf)  39.33 
 
 		 372 aa  150  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  31.28 
 
 		 372 aa  149  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  37.22 
 
 		 394 aa  147  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  39.09 
 
 		 377 aa  147  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  30.97 
 
 		 389 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  33.68 
 
 		 369 aa  146  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  43.3 
 
 		 358 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  29.41 
 
 		 349 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2383  DNA protecting protein DprA  34.98 
 
 		 370 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0295  DNA processing protein DprA, putative  34.68 
 
 		 374 aa  145  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.332984 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  36.01 
 
 		 369 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  32.78 
 
 		 365 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  32.14 
 
 		 364 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  35.9 
 
 		 361 aa  140  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1759  DNA protecting protein DprA  36.68 
 
 		 383 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.582182  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  34.41 
 
 		 336 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  37.23 
 
 		 375 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  36.45 
 
 		 356 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3031  DNA processing protein DprA, putative  36.36 
 
 		 422 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.461494  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  37.82 
 
 		 386 aa  140  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0637  DNA protecting protein DprA  33.33 
 
 		 514 aa  140  6e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.3144 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0157  DNA protecting protein DprA  29.81 
 
 		 372 aa  139  7e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.835588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  29.69 
 
 		 409 aa  139  7e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0033  DNA protecting protein DprA  37.45 
 
 		 339 aa  139  7e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1317  DNA protecting protein DprA  35.86 
 
 		 330 aa  139  7e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  35.56 
 
 		 364 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3531  DNA protecting protein DprA  36.6 
 
 		 378 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0638  DNA protecting protein DprA  30.79 
 
 		 375 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3158  DNA processing protein DprA, putative  38.59 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  32.59 
 
 		 373 aa  139  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  34.29 
 
 		 375 aa  139  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0660  DNA protecting protein DprA  30.79 
 
 		 375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137383  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2088  DNA protecting protein DprA  36.95 
 
 		 384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.972888  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  38.33 
 
 		 388 aa  137  4e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1766  SMF protein  40.81 
 
 		 286 aa  137  4e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.273008 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  37.79 
 
 		 408 aa  137  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  43.3 
 
 		 422 aa  137  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4323  DNA protecting protein DprA  41.45 
 
 		 418 aa  137  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3825  DNA protecting protein DprA  39.93 
 
 		 592 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188675  normal  0.0366246 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  42.92 
 
 		 421 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  38.04 
 
 		 389 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  28.66 
 
 		 362 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3673  DNA protecting protein DprA  41.44 
 
 		 366 aa  136  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.917953  normal  0.236598 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  39.81 
 
 		 358 aa  136  7.000000000000001e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0412  DNA processing chain A  33.47 
 
 		 368 aa  135  9e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.232612  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2421  DNA processing protein DprA, putative  35.22 
 
 		 378 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3567  DNA processing protein DprA, putative  41.02 
 
 		 371 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3717  DNA protecting protein DprA  32.88 
 
 		 374 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00862167  decreased coverage  0.00279195 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5115  DNA protecting protein DprA  38.29 
 
 		 382 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  34.92 
 
 		 371 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3916  DNA protecting protein DprA  38.46 
 
 		 378 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  31.9 
 
 		 406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1433  DNA protecting protein DprA  27.15 
 
 		 363 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  0.644688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>