More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3158 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3158  DNA processing protein DprA, putative  100 
 
 		 402 aa  793    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2317  DNA protecting protein DprA  61.16 
 
 		 369 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0849  DNA protecting protein DprA  61.68 
 
 		 372 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2338  DNA processing protein DprA, putative  52.94 
 
 		 382 aa  360  3e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2177  hypothetical protein  61.41 
 
 		 372 aa  350  2e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.809736  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4323  DNA protecting protein DprA  53.32 
 
 		 418 aa  350  3e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1138  DNA protecting protein DprA  54.37 
 
 		 379 aa  344  1e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.823359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  50 
 
 		 372 aa  305  8.000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  47.88 
 
 		 387 aa  292  7e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2010  SMF protein  47.88 
 
 		 372 aa  290  3e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.272582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4729  DNA processing chain A (DprA/Smf)  48.5 
 
 		 372 aa  289  6e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2285  DNA processing protein DprA, putative  47.4 
 
 		 372 aa  287  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3194  SMF protein  49.58 
 
 		 374 aa  281  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1209  DNA processing protein DprA, putative  46.39 
 
 		 360 aa  281  2e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3531  DNA protecting protein DprA  47.24 
 
 		 378 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3857  DNA protecting protein DprA  42.55 
 
 		 422 aa  277  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3669  DNA protecting protein DprA  44.18 
 
 		 388 aa  276  4e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215267  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3031  DNA processing protein DprA, putative  46.69 
 
 		 422 aa  275  9e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.461494  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0933  DNA protecting protein DprA  47.24 
 
 		 383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339365  normal  0.657052 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  44.96 
 
 		 375 aa  275  1.0000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1296  DNA protecting protein DprA  48.89 
 
 		 380 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.857359  decreased coverage  0.000779051 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1508  DNA protecting protein DprA  46.74 
 
 		 366 aa  273  3e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.300262 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2244  DNA processing protein DprA, putative  46.3 
 
 		 372 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441275  normal  0.282732 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1388  DNA protecting protein DprA  47.92 
 
 		 380 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1356  DNA protecting protein DprA  45.95 
 
 		 378 aa  270  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1759  DNA protecting protein DprA  45.73 
 
 		 383 aa  271  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.582182  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3825  DNA protecting protein DprA  49.45 
 
 		 592 aa  267  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188675  normal  0.0366246 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3313  DNA protecting protein DprA  45.78 
 
 		 391 aa  266  5e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0602  DNA processing protein DprA, putative  44.92 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3515  DNA protecting protein DprA  44.39 
 
 		 397 aa  263  4e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.567424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3916  DNA protecting protein DprA  48.18 
 
 		 378 aa  262  6.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4345  DNA protecting protein DprA  46.91 
 
 		 391 aa  262  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.61785 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2421  DNA processing protein DprA, putative  46.81 
 
 		 378 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3315  DNA protecting protein DprA  44.39 
 
 		 397 aa  262  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451996  normal  0.725027 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0474  DNA protecting protein DprA  46.72 
 
 		 403 aa  262  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652717  normal  0.262413 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3421  DNA protecting protein DprA  42.4 
 
 		 429 aa  260  3e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.143035  normal  0.697351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3638  DNA protecting protein DprA  43.88 
 
 		 397 aa  259  6e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0567  SMF protein  44.39 
 
 		 393 aa  259  9e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0842  DNA protecting protein DprA  39.89 
 
 		 396 aa  253  3e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0234041  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  36.62 
 
 		 374 aa  252  9.000000000000001e-66  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1644  DNA protecting protein DprA  43.82 
 
 		 395 aa  250  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.263138 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0730  DNA protecting protein DprA  44.47 
 
 		 373 aa  245  8e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0092  DNA processing chain A  39.51 
 
 		 362 aa  241  1e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0883  putative DNA processing protein DprA  35.49 
 
 		 375 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.430936  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  44.95 
 
 		 394 aa  219  7e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  41.69 
 
 		 388 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  42.76 
 
 		 336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  39.95 
 
 		 365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  42.4 
 
 		 373 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  39.6 
 
 		 358 aa  210  4e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  38.73 
 
 		 362 aa  209  5e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  41.75 
 
 		 406 aa  208  1e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  39.89 
 
 		 356 aa  208  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  39.47 
 
 		 379 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0388  putative DNA processing protein DprA  37.08 
 
 		 378 aa  207  2e-52  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  41.34 
 
 		 373 aa  207  3e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  39.26 
 
 		 359 aa  206  4e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  39.55 
 
 		 395 aa  206  5e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  39.6 
 
 		 369 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  42.01 
 
 		 377 aa  203  4e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  40.23 
 
 		 364 aa  203  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  39.29 
 
 		 386 aa  203  5e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  39.4 
 
 		 365 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  42.38 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  39.23 
 
 		 368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  41.55 
 
 		 377 aa  200  3e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  39.42 
 
 		 371 aa  200  5e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  37.22 
 
 		 368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  42.21 
 
 		 399 aa  196  5.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  41.04 
 
 		 320 aa  195  9e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  38.65 
 
 		 349 aa  195  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  38.9 
 
 		 401 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  36.9 
 
 		 364 aa  194  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  39.17 
 
 		 365 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  39.68 
 
 		 394 aa  193  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  37.25 
 
 		 359 aa  193  5e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  38.83 
 
 		 370 aa  193  5e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  39.17 
 
 		 365 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  41.49 
 
 		 365 aa  192  9e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  41.49 
 
 		 365 aa  192  9e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  38.38 
 
 		 359 aa  191  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  37.62 
 
 		 408 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  39.38 
 
 		 360 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  41.67 
 
 		 361 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  40.79 
 
 		 389 aa  191  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  37.46 
 
 		 366 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0033  DNA protecting protein DprA  46.95 
 
 		 339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  38.86 
 
 		 385 aa  189  5e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  39.61 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  38.67 
 
 		 374 aa  188  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  40.57 
 
 		 361 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  44.55 
 
 		 363 aa  188  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  40.57 
 
 		 361 aa  187  3e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  43.25 
 
 		 366 aa  187  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2083  transcriptional regulator TrmB  41.84 
 
 		 337 aa  187  4e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  36.48 
 
 		 364 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  37.25 
 
 		 360 aa  186  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  42.14 
 
 		 382 aa  186  6e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  40.12 
 
 		 358 aa  186  7e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  38.83 
 
 		 372 aa  186  7e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>