More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3313 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3313  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 391 aa  748    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4345  DNA protecting protein DprA  81.33 
 
 		 391 aa  550  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.61785 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3638  DNA protecting protein DprA  67.42 
 
 		 397 aa  472  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3515  DNA protecting protein DprA  67.68 
 
 		 397 aa  473  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.567424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3315  DNA protecting protein DprA  67.68 
 
 		 397 aa  473  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451996  normal  0.725027 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0474  DNA protecting protein DprA  65.09 
 
 		 403 aa  442  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652717  normal  0.262413 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3421  DNA protecting protein DprA  52.04 
 
 		 429 aa  379  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.143035  normal  0.697351 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2010  SMF protein  55.75 
 
 		 372 aa  373  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.272582 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2244  DNA processing protein DprA, putative  55.44 
 
 		 372 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441275  normal  0.282732 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2285  DNA processing protein DprA, putative  57.4 
 
 		 372 aa  366  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3531  DNA protecting protein DprA  56.03 
 
 		 378 aa  362  8e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4729  DNA processing chain A (DprA/Smf)  55.36 
 
 		 372 aa  360  3e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3031  DNA processing protein DprA, putative  54.14 
 
 		 422 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.461494  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0602  DNA processing protein DprA, putative  50.26 
 
 		 393 aa  350  3e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0933  DNA protecting protein DprA  50.77 
 
 		 383 aa  348  1e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339365  normal  0.657052 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0842  DNA protecting protein DprA  46.62 
 
 		 396 aa  348  1e-94  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0234041  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2421  DNA processing protein DprA, putative  55.47 
 
 		 378 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3857  DNA protecting protein DprA  50.59 
 
 		 422 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0567  SMF protein  49.49 
 
 		 393 aa  343  4e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3669  DNA protecting protein DprA  51.14 
 
 		 388 aa  340  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215267  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3916  DNA protecting protein DprA  54.71 
 
 		 378 aa  334  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1759  DNA protecting protein DprA  46.84 
 
 		 383 aa  329  5.0000000000000004e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.582182  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1388  DNA protecting protein DprA  50.26 
 
 		 380 aa  327  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1296  DNA protecting protein DprA  50.26 
 
 		 380 aa  322  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.857359  decreased coverage  0.000779051 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  50 
 
 		 372 aa  310  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1356  DNA protecting protein DprA  49.1 
 
 		 378 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  46.33 
 
 		 387 aa  288  1e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3194  SMF protein  46.67 
 
 		 374 aa  276  4e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1508  DNA protecting protein DprA  47.69 
 
 		 366 aa  274  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.300262 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  44.86 
 
 		 375 aa  267  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0730  DNA protecting protein DprA  46.56 
 
 		 373 aa  262  6e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1209  DNA processing protein DprA, putative  46.27 
 
 		 360 aa  262  8e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2338  DNA processing protein DprA, putative  44.04 
 
 		 382 aa  257  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3825  DNA protecting protein DprA  49.1 
 
 		 592 aa  253  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188675  normal  0.0366246 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  43.86 
 
 		 374 aa  250  3e-65  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3158  DNA processing protein DprA, putative  44.95 
 
 		 402 aa  248  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1138  DNA protecting protein DprA  44.65 
 
 		 379 aa  246  4e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.823359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2317  DNA protecting protein DprA  47.67 
 
 		 369 aa  245  9e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0883  putative DNA processing protein DprA  35.88 
 
 		 375 aa  245  9.999999999999999e-64  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.430936  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1644  DNA protecting protein DprA  45.19 
 
 		 395 aa  233  6e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.263138 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0849  DNA protecting protein DprA  47.93 
 
 		 372 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4323  DNA protecting protein DprA  45.96 
 
 		 418 aa  228  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  41.07 
 
 		 364 aa  223  7e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2177  hypothetical protein  48.19 
 
 		 372 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.809736  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  48.09 
 
 		 366 aa  219  3.9999999999999997e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0388  putative DNA processing protein DprA  33.5 
 
 		 378 aa  217  2.9999999999999998e-55  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  35.54 
 
 		 399 aa  216  4e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  44.39 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  39.9 
 
 		 389 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0440  DNA protecting protein DprA  38.54 
 
 		 377 aa  210  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.303838  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0092  DNA processing chain A  41.58 
 
 		 362 aa  209  5e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  37.92 
 
 		 369 aa  209  5e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3602  DNA protecting protein DprA  43.75 
 
 		 374 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.62233 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  40.66 
 
 		 386 aa  208  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  39.42 
 
 		 377 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3772  DNA protecting protein DprA  43.75 
 
 		 374 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3601  DNA protecting protein DprA  43.75 
 
 		 374 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000541333  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3674  DNA protecting protein DprA  43.75 
 
 		 374 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3709  DNA protecting protein DprA  43.75 
 
 		 374 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.0813608 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  35.42 
 
 		 362 aa  206  4e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  40.33 
 
 		 408 aa  206  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  39.79 
 
 		 371 aa  206  5e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  38.05 
 
 		 369 aa  206  5e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  38.05 
 
 		 369 aa  204  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  39.16 
 
 		 394 aa  203  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  40.98 
 
 		 365 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  40.05 
 
 		 358 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  40.98 
 
 		 365 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  39.01 
 
 		 356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  37.34 
 
 		 377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  37.93 
 
 		 369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  40.73 
 
 		 365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4510  DNA protecting protein DprA  42.22 
 
 		 373 aa  199  7e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00273954  hitchhiker  0.000201451 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  37.7 
 
 		 359 aa  199  7e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  38.82 
 
 		 379 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  37.81 
 
 		 388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  38.64 
 
 		 365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  40.1 
 
 		 375 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  41.01 
 
 		 336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3967  DNA protecting protein DprA  41.96 
 
 		 373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  38.73 
 
 		 366 aa  197  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  39.69 
 
 		 365 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3128  DNA protecting protein DprA  40.94 
 
 		 475 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  31.74 
 
 		 409 aa  196  5.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  37.4 
 
 		 372 aa  196  6e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2514  DNA processing protein DprA, putative  40.94 
 
 		 475 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  33.42 
 
 		 370 aa  195  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  36.1 
 
 		 365 aa  195  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  40.15 
 
 		 422 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0357  DNA protecting protein DprA  41.25 
 
 		 377 aa  194  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0657137  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  42.25 
 
 		 385 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  40.05 
 
 		 448 aa  193  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  37.43 
 
 		 359 aa  192  7e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  37.56 
 
 		 361 aa  191  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  38.44 
 
 		 389 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0021  SMF protein  40.36 
 
 		 372 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  43.4 
 
 		 395 aa  191  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  36.84 
 
 		 360 aa  190  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3581  DNA protecting protein DprA  41.59 
 
 		 374 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0315496  normal  0.18869 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  36.52 
 
 		 368 aa  190  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>