More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2317 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2317  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 369 aa  708    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0849  DNA protecting protein DprA  84.37 
 
 		 372 aa  537  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2177  hypothetical protein  84.64 
 
 		 372 aa  524  1e-147  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.809736  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2338  DNA processing protein DprA, putative  56.4 
 
 		 382 aa  376  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3158  DNA processing protein DprA, putative  61.85 
 
 		 402 aa  366  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4323  DNA protecting protein DprA  53.4 
 
 		 418 aa  324  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1138  DNA protecting protein DprA  53.23 
 
 		 379 aa  320  3e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.823359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  49.18 
 
 		 372 aa  298  8e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2010  SMF protein  48.17 
 
 		 372 aa  290  2e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.272582 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3194  SMF protein  51.81 
 
 		 374 aa  290  4e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4729  DNA processing chain A (DprA/Smf)  49.58 
 
 		 372 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2285  DNA processing protein DprA, putative  48.67 
 
 		 372 aa  281  9e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1209  DNA processing protein DprA, putative  48.6 
 
 		 360 aa  278  1e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3515  DNA protecting protein DprA  46.68 
 
 		 397 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.567424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3531  DNA protecting protein DprA  47.97 
 
 		 378 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2244  DNA processing protein DprA, putative  46.81 
 
 		 372 aa  272  7e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441275  normal  0.282732 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3669  DNA protecting protein DprA  44.47 
 
 		 388 aa  270  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215267  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2421  DNA processing protein DprA, putative  50 
 
 		 378 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1759  DNA protecting protein DprA  45.05 
 
 		 383 aa  268  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.582182  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3857  DNA protecting protein DprA  43.2 
 
 		 422 aa  268  1e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1356  DNA protecting protein DprA  46.07 
 
 		 378 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3031  DNA processing protein DprA, putative  48.89 
 
 		 422 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.461494  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0602  DNA processing protein DprA, putative  44.13 
 
 		 393 aa  266  5e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  45.95 
 
 		 387 aa  265  8e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  46.56 
 
 		 375 aa  265  1e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3638  DNA protecting protein DprA  43.81 
 
 		 397 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3315  DNA protecting protein DprA  43.56 
 
 		 397 aa  260  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451996  normal  0.725027 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0567  SMF protein  43.6 
 
 		 393 aa  261  2e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0933  DNA protecting protein DprA  45.26 
 
 		 383 aa  261  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339365  normal  0.657052 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3313  DNA protecting protein DprA  48.19 
 
 		 391 aa  256  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3916  DNA protecting protein DprA  48.6 
 
 		 378 aa  256  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0730  DNA protecting protein DprA  48.11 
 
 		 373 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1388  DNA protecting protein DprA  46.59 
 
 		 380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1296  DNA protecting protein DprA  46.28 
 
 		 380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.857359  decreased coverage  0.000779051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3825  DNA protecting protein DprA  50.99 
 
 		 592 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188675  normal  0.0366246 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1508  DNA protecting protein DprA  46.94 
 
 		 366 aa  252  9.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.300262 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0474  DNA protecting protein DprA  46.97 
 
 		 403 aa  250  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652717  normal  0.262413 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4345  DNA protecting protein DprA  46.53 
 
 		 391 aa  249  6e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.61785 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0842  DNA protecting protein DprA  39.26 
 
 		 396 aa  248  1e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0234041  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3421  DNA protecting protein DprA  41.65 
 
 		 429 aa  246  4e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.143035  normal  0.697351 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  36.46 
 
 		 374 aa  246  6e-64  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0883  putative DNA processing protein DprA  36.14 
 
 		 375 aa  238  1e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.430936  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1644  DNA protecting protein DprA  42.02 
 
 		 395 aa  228  9e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.263138 
 
 
-
 
NC_002978  WD0092  DNA processing chain A  40.17 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  48.04 
 
 		 377 aa  219  6e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  47.77 
 
 		 364 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  41.93 
 
 		 364 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  42.74 
 
 		 394 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  41.74 
 
 		 368 aa  212  7e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  40.26 
 
 		 379 aa  212  7.999999999999999e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  42.51 
 
 		 377 aa  211  1e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  38.59 
 
 		 368 aa  209  4e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  43.73 
 
 		 320 aa  208  9e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  40 
 
 		 401 aa  208  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  44.07 
 
 		 336 aa  208  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  37.93 
 
 		 365 aa  207  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0388  putative DNA processing protein DprA  36.77 
 
 		 378 aa  207  3e-52  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  42.01 
 
 		 369 aa  207  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  38.34 
 
 		 395 aa  207  3e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  42.78 
 
 		 394 aa  205  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  38.73 
 
 		 359 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  43.89 
 
 		 365 aa  204  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  42.55 
 
 		 386 aa  204  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  46.33 
 
 		 402 aa  203  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  39.72 
 
 		 366 aa  203  4e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  45.55 
 
 		 434 aa  202  8e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  41.14 
 
 		 360 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2350  DNA protecting protein DprA  45.55 
 
 		 434 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  42.36 
 
 		 369 aa  200  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0141  DNA processing protein DprA, putative  45.55 
 
 		 396 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2273  DNA protecting protein DprA  45.55 
 
 		 396 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  39.54 
 
 		 358 aa  200  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2808  DNA protecting protein DprA  45.55 
 
 		 434 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  45.21 
 
 		 434 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  40.16 
 
 		 379 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  40.94 
 
 		 386 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  40.27 
 
 		 388 aa  199  7e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  40.72 
 
 		 365 aa  199  9e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  42.61 
 
 		 360 aa  199  9e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  36.87 
 
 		 361 aa  198  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  45.48 
 
 		 401 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  34.34 
 
 		 365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  36.87 
 
 		 361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0345  SMF family protein  45.55 
 
 		 434 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  40.11 
 
 		 375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  41.22 
 
 		 406 aa  197  3e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0021  SMF protein  41.21 
 
 		 372 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  45.49 
 
 		 366 aa  197  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0045  DNA processing protein DprA, putative  43.45 
 
 		 338 aa  197  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.064372  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  39.66 
 
 		 356 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  35.93 
 
 		 362 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  40.86 
 
 		 373 aa  196  6e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  41.79 
 
 		 373 aa  196  6e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  43.1 
 
 		 372 aa  196  8.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  38.24 
 
 		 399 aa  195  9e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  38.94 
 
 		 425 aa  195  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  43.99 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  39.07 
 
 		 408 aa  194  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  40.75 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>