More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1356 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1356  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 378 aa  734    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1759  DNA protecting protein DprA  56.88 
 
 		 383 aa  405  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.582182  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0933  DNA protecting protein DprA  56.51 
 
 		 383 aa  401  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339365  normal  0.657052 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1296  DNA protecting protein DprA  60.22 
 
 		 380 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.857359  decreased coverage  0.000779051 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1388  DNA protecting protein DprA  59.41 
 
 		 380 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0602  DNA processing protein DprA, putative  54.57 
 
 		 393 aa  383  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3669  DNA protecting protein DprA  53.14 
 
 		 388 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215267  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2010  SMF protein  56.44 
 
 		 372 aa  377  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.272582 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2244  DNA processing protein DprA, putative  56.56 
 
 		 372 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441275  normal  0.282732 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0567  SMF protein  53.79 
 
 		 393 aa  376  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4729  DNA processing chain A (DprA/Smf)  58.08 
 
 		 372 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3916  DNA protecting protein DprA  55.68 
 
 		 378 aa  362  5.0000000000000005e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2285  DNA processing protein DprA, putative  55.89 
 
 		 372 aa  361  1e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0842  DNA protecting protein DprA  49.61 
 
 		 396 aa  348  7e-95  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0234041  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3031  DNA processing protein DprA, putative  53.23 
 
 		 422 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.461494  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2421  DNA processing protein DprA, putative  54.03 
 
 		 378 aa  333  4e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3531  DNA protecting protein DprA  53.74 
 
 		 378 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3315  DNA protecting protein DprA  50.13 
 
 		 397 aa  330  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451996  normal  0.725027 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3515  DNA protecting protein DprA  50 
 
 		 397 aa  331  2e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.567424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  51.76 
 
 		 372 aa  330  3e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3638  DNA protecting protein DprA  49.62 
 
 		 397 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3194  SMF protein  51.94 
 
 		 374 aa  319  6e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0474  DNA protecting protein DprA  49.75 
 
 		 403 aa  318  7e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652717  normal  0.262413 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3313  DNA protecting protein DprA  49.1 
 
 		 391 aa  318  9e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3421  DNA protecting protein DprA  45.73 
 
 		 429 aa  311  1e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.143035  normal  0.697351 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4345  DNA protecting protein DprA  49.23 
 
 		 391 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.61785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1508  DNA protecting protein DprA  50.55 
 
 		 366 aa  300  4e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.300262 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3825  DNA protecting protein DprA  51.89 
 
 		 592 aa  293  4e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188675  normal  0.0366246 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1209  DNA processing protein DprA, putative  46.56 
 
 		 360 aa  290  3e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2338  DNA processing protein DprA, putative  43.4 
 
 		 382 aa  288  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  47.11 
 
 		 375 aa  286  2.9999999999999996e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0730  DNA protecting protein DprA  48.37 
 
 		 373 aa  278  9e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  45.05 
 
 		 387 aa  278  9e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3857  DNA protecting protein DprA  42.65 
 
 		 422 aa  275  7e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2317  DNA protecting protein DprA  45.65 
 
 		 369 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  35.87 
 
 		 374 aa  261  2e-68  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3158  DNA processing protein DprA, putative  45.95 
 
 		 402 aa  260  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1138  DNA protecting protein DprA  43.66 
 
 		 379 aa  257  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.823359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0883  putative DNA processing protein DprA  36.76 
 
 		 375 aa  255  9e-67  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.430936  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1644  DNA protecting protein DprA  45.87 
 
 		 395 aa  251  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.263138 
 
 
-
 
NC_002978  WD0092  DNA processing chain A  38.04 
 
 		 362 aa  243  3.9999999999999997e-63  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0849  DNA protecting protein DprA  46.65 
 
 		 372 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2177  hypothetical protein  47.03 
 
 		 372 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.809736  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4323  DNA protecting protein DprA  40.65 
 
 		 418 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0388  putative DNA processing protein DprA  35.44 
 
 		 378 aa  223  3e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  41.42 
 
 		 401 aa  217  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  37.6 
 
 		 365 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  37.6 
 
 		 365 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  40.67 
 
 		 386 aa  213  5.999999999999999e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  42.96 
 
 		 336 aa  212  7e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  42.22 
 
 		 366 aa  211  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  38.12 
 
 		 371 aa  211  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  34.95 
 
 		 409 aa  211  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  40.82 
 
 		 364 aa  210  4e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  38.7 
 
 		 359 aa  209  8e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  36.61 
 
 		 369 aa  209  9e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  40.16 
 
 		 375 aa  208  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  39.34 
 
 		 368 aa  208  1e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  39.6 
 
 		 356 aa  208  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  37.13 
 
 		 389 aa  207  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  36.36 
 
 		 421 aa  206  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  35.28 
 
 		 369 aa  206  6e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  37.23 
 
 		 358 aa  206  6e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  36.21 
 
 		 448 aa  205  9e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  40.26 
 
 		 402 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  40.83 
 
 		 365 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  37.72 
 
 		 422 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  37.3 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  38.57 
 
 		 408 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  37.46 
 
 		 377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3128  DNA protecting protein DprA  37.47 
 
 		 475 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  36.02 
 
 		 365 aa  200  3.9999999999999996e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  35.03 
 
 		 385 aa  199  5e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2514  DNA processing protein DprA, putative  37.47 
 
 		 475 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  40 
 
 		 365 aa  199  9e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  35.5 
 
 		 377 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  40.41 
 
 		 401 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0835  DNA protecting protein DprA  37.28 
 
 		 405 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  34.84 
 
 		 356 aa  197  3e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  37.19 
 
 		 359 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  40.34 
 
 		 331 aa  196  7e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  38.08 
 
 		 372 aa  196  7e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  41.91 
 
 		 320 aa  195  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  34.06 
 
 		 369 aa  195  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  37.19 
 
 		 359 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  37.29 
 
 		 379 aa  193  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  38.44 
 
 		 379 aa  193  5e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  38.62 
 
 		 422 aa  193  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  44.44 
 
 		 366 aa  193  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  40.51 
 
 		 389 aa  192  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  32.87 
 
 		 364 aa  192  8e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0069  DNA protecting protein DprA  40.28 
 
 		 365 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0131518  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  37.83 
 
 		 388 aa  191  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  37.67 
 
 		 374 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  35.25 
 
 		 362 aa  190  4e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  36.8 
 
 		 385 aa  189  5e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  35.81 
 
 		 364 aa  189  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  32.78 
 
 		 362 aa  190  5e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  39.59 
 
 		 338 aa  189  5e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3066  DNA protecting protein DprA  37.78 
 
 		 422 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>