More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1508 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1508  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 366 aa  704    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.300262 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  51.17 
 
 		 387 aa  313  3.9999999999999997e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2244  DNA processing protein DprA, putative  51.77 
 
 		 372 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441275  normal  0.282732 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  50.95 
 
 		 372 aa  301  1e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2285  DNA processing protein DprA, putative  50.14 
 
 		 372 aa  298  1e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0602  DNA processing protein DprA, putative  47.99 
 
 		 393 aa  294  1e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2010  SMF protein  47.86 
 
 		 372 aa  294  1e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.272582 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3669  DNA protecting protein DprA  46.6 
 
 		 388 aa  288  9e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215267  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3421  DNA protecting protein DprA  43.49 
 
 		 429 aa  287  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.143035  normal  0.697351 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0567  SMF protein  47.18 
 
 		 393 aa  287  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4729  DNA processing chain A (DprA/Smf)  50 
 
 		 372 aa  287  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3194  SMF protein  50.54 
 
 		 374 aa  287  2e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3031  DNA processing protein DprA, putative  48.66 
 
 		 422 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.461494  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0730  DNA protecting protein DprA  52.42 
 
 		 373 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1759  DNA protecting protein DprA  44.81 
 
 		 383 aa  281  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.582182  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1356  DNA protecting protein DprA  50.55 
 
 		 378 aa  280  4e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3315  DNA protecting protein DprA  47.45 
 
 		 397 aa  277  3e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451996  normal  0.725027 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0842  DNA protecting protein DprA  40.99 
 
 		 396 aa  276  3e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0234041  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3638  DNA protecting protein DprA  47.19 
 
 		 397 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3515  DNA protecting protein DprA  46.43 
 
 		 397 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.567424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3916  DNA protecting protein DprA  50 
 
 		 378 aa  271  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3531  DNA protecting protein DprA  48.24 
 
 		 378 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3857  DNA protecting protein DprA  46.93 
 
 		 422 aa  271  1e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2421  DNA processing protein DprA, putative  48.38 
 
 		 378 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0933  DNA protecting protein DprA  43.85 
 
 		 383 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339365  normal  0.657052 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3313  DNA protecting protein DprA  48.24 
 
 		 391 aa  267  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  47.79 
 
 		 375 aa  266  2.9999999999999995e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4345  DNA protecting protein DprA  55.32 
 
 		 391 aa  263  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.61785 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1296  DNA protecting protein DprA  45.75 
 
 		 380 aa  259  6e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.857359  decreased coverage  0.000779051 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1388  DNA protecting protein DprA  45.48 
 
 		 380 aa  257  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  36.96 
 
 		 374 aa  255  7e-67  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0883  putative DNA processing protein DprA  36.49 
 
 		 375 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.430936  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1644  DNA protecting protein DprA  47.87 
 
 		 395 aa  253  3e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.263138 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2338  DNA processing protein DprA, putative  43.68 
 
 		 382 aa  253  3e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1138  DNA protecting protein DprA  46.8 
 
 		 379 aa  251  1e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.823359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3158  DNA processing protein DprA, putative  46.74 
 
 		 402 aa  250  2e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0474  DNA protecting protein DprA  45.25 
 
 		 403 aa  249  5e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652717  normal  0.262413 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3825  DNA protecting protein DprA  50.43 
 
 		 592 aa  249  6e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188675  normal  0.0366246 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1209  DNA processing protein DprA, putative  46.13 
 
 		 360 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0388  putative DNA processing protein DprA  36.73 
 
 		 378 aa  233  5e-60  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0092  DNA processing chain A  37.98 
 
 		 362 aa  229  5e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2317  DNA protecting protein DprA  46.94 
 
 		 369 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  39.84 
 
 		 369 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  38.96 
 
 		 369 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  43.63 
 
 		 365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0849  DNA protecting protein DprA  46.41 
 
 		 372 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2471  Smf/DprA family protein  41.64 
 
 		 371 aa  212  7.999999999999999e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  37.5 
 
 		 362 aa  211  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  43.36 
 
 		 364 aa  210  3e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  43.06 
 
 		 394 aa  209  8e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  43.1 
 
 		 331 aa  208  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0045  DNA processing protein DprA, putative  45.21 
 
 		 338 aa  207  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.064372  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  50 
 
 		 366 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  42.78 
 
 		 365 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4323  DNA protecting protein DprA  40.71 
 
 		 418 aa  207  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0033  DNA protecting protein DprA  47.51 
 
 		 339 aa  206  4e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  42.55 
 
 		 371 aa  205  8e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  47.69 
 
 		 377 aa  205  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  46.02 
 
 		 336 aa  205  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0022  DNA-processing protein smf chain A  48.26 
 
 		 362 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638184  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  39.57 
 
 		 369 aa  205  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2177  hypothetical protein  48.61 
 
 		 372 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.809736  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  41.62 
 
 		 386 aa  204  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  40.82 
 
 		 366 aa  203  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0026  DNA protecting protein DprA  43.9 
 
 		 340 aa  203  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0069  DNA protecting protein DprA  43.22 
 
 		 365 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0131518  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  44.1 
 
 		 338 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  44.1 
 
 		 338 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  44.1 
 
 		 338 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  41.18 
 
 		 375 aa  202  9e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  44.33 
 
 		 338 aa  202  9e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  39.67 
 
 		 359 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  43.75 
 
 		 338 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  44.33 
 
 		 338 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  45.33 
 
 		 368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  48.24 
 
 		 365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  48.24 
 
 		 365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  44.33 
 
 		 338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2088  DNA protecting protein DprA  42.55 
 
 		 384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.972888  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  38.82 
 
 		 383 aa  200  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  43.73 
 
 		 366 aa  199  5e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0026  DNA protecting protein DprA  43.1 
 
 		 338 aa  199  6e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  36.96 
 
 		 368 aa  199  9e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0025  DNA protecting protein DprA  36.22 
 
 		 379 aa  199  9e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  42.15 
 
 		 368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  46.98 
 
 		 368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  46.24 
 
 		 356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  39.78 
 
 		 388 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  45.79 
 
 		 399 aa  198  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  41.87 
 
 		 369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  44.1 
 
 		 338 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  45.52 
 
 		 365 aa  196  4.0000000000000005e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  37.85 
 
 		 362 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  41.55 
 
 		 379 aa  196  5.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3602  DNA protecting protein DprA  42.27 
 
 		 374 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.62233 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3772  DNA protecting protein DprA  42.27 
 
 		 374 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  39.68 
 
 		 389 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3601  DNA protecting protein DprA  42.27 
 
 		 374 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000541333  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3674  DNA protecting protein DprA  42.27 
 
 		 374 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3881  DNA protecting protein DprA  42.41 
 
 		 373 aa  193  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000308128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>