More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1388 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1296  DNA protecting protein DprA  93.95 
 
 		 380 aa  680    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.857359  decreased coverage  0.000779051 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1388  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 380 aa  744    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1759  DNA protecting protein DprA  72.63 
 
 		 383 aa  558  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.582182  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0933  DNA protecting protein DprA  72.7 
 
 		 383 aa  543  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339365  normal  0.657052 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3669  DNA protecting protein DprA  58.4 
 
 		 388 aa  427  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215267  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0602  DNA processing protein DprA, putative  56.1 
 
 		 393 aa  408  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0567  SMF protein  55.84 
 
 		 393 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2244  DNA processing protein DprA, putative  58.04 
 
 		 372 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441275  normal  0.282732 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0842  DNA protecting protein DprA  51.44 
 
 		 396 aa  385  1e-106  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0234041  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1356  DNA protecting protein DprA  59.41 
 
 		 378 aa  382  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3031  DNA processing protein DprA, putative  57.52 
 
 		 422 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.461494  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4729  DNA processing chain A (DprA/Smf)  56.73 
 
 		 372 aa  375  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3531  DNA protecting protein DprA  59.03 
 
 		 378 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2010  SMF protein  56.56 
 
 		 372 aa  369  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.272582 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3916  DNA protecting protein DprA  57.03 
 
 		 378 aa  370  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2421  DNA processing protein DprA, putative  56.43 
 
 		 378 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2285  DNA processing protein DprA, putative  58.04 
 
 		 372 aa  367  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3315  DNA protecting protein DprA  52.41 
 
 		 397 aa  340  4e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451996  normal  0.725027 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  53.24 
 
 		 372 aa  338  9.999999999999999e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3638  DNA protecting protein DprA  52.15 
 
 		 397 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3313  DNA protecting protein DprA  50.64 
 
 		 391 aa  332  9e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3515  DNA protecting protein DprA  50 
 
 		 397 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.567424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0474  DNA protecting protein DprA  48.52 
 
 		 403 aa  317  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652717  normal  0.262413 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3421  DNA protecting protein DprA  45.08 
 
 		 429 aa  314  1.9999999999999998e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.143035  normal  0.697351 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3857  DNA protecting protein DprA  47.12 
 
 		 422 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4345  DNA protecting protein DprA  51.27 
 
 		 391 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.61785 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1209  DNA processing protein DprA, putative  47.03 
 
 		 360 aa  297  2e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3194  SMF protein  46.26 
 
 		 374 aa  296  4e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  45.99 
 
 		 375 aa  280  3e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1508  DNA protecting protein DprA  45.48 
 
 		 366 aa  276  4e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.300262 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3825  DNA protecting protein DprA  50.95 
 
 		 592 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188675  normal  0.0366246 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  37.5 
 
 		 374 aa  270  2e-71  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3158  DNA processing protein DprA, putative  47.56 
 
 		 402 aa  267  2e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2338  DNA processing protein DprA, putative  44.23 
 
 		 382 aa  265  1e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  43.95 
 
 		 387 aa  265  1e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0883  putative DNA processing protein DprA  37.27 
 
 		 375 aa  263  4e-69  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.430936  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0730  DNA protecting protein DprA  45.8 
 
 		 373 aa  261  1e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1138  DNA protecting protein DprA  45.25 
 
 		 379 aa  249  6e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.823359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2317  DNA protecting protein DprA  45.11 
 
 		 369 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1644  DNA protecting protein DprA  43.92 
 
 		 395 aa  241  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.263138 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0388  putative DNA processing protein DprA  37.37 
 
 		 378 aa  239  4e-62  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0092  DNA processing chain A  37.84 
 
 		 362 aa  236  4e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0849  DNA protecting protein DprA  47.11 
 
 		 372 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4323  DNA protecting protein DprA  41.65 
 
 		 418 aa  225  8e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2177  hypothetical protein  46.63 
 
 		 372 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.809736  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  40.22 
 
 		 371 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  39.51 
 
 		 389 aa  209  8e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  38.48 
 
 		 365 aa  207  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  39.78 
 
 		 386 aa  204  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  40.4 
 
 		 359 aa  204  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  39.83 
 
 		 359 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  39.24 
 
 		 394 aa  199  5e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  37.16 
 
 		 365 aa  199  5e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  39.66 
 
 		 359 aa  199  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  37.6 
 
 		 379 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  39.89 
 
 		 366 aa  197  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  37.94 
 
 		 422 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  38.07 
 
 		 364 aa  196  7e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  36.69 
 
 		 373 aa  195  9e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  36.92 
 
 		 448 aa  195  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  34.51 
 
 		 409 aa  195  9e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  38.98 
 
 		 356 aa  195  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  38.14 
 
 		 358 aa  195  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  37.3 
 
 		 365 aa  194  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  37.3 
 
 		 365 aa  194  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  35.98 
 
 		 399 aa  193  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  36.02 
 
 		 370 aa  192  6e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  38.06 
 
 		 388 aa  192  6e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  36.62 
 
 		 406 aa  192  9e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  36.9 
 
 		 373 aa  191  1e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  36.36 
 
 		 364 aa  191  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3128  DNA protecting protein DprA  37.69 
 
 		 475 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  37.75 
 
 		 377 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  39.93 
 
 		 336 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  38.24 
 
 		 360 aa  190  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  40 
 
 		 374 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  36.36 
 
 		 368 aa  189  8e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  38.25 
 
 		 369 aa  189  8e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  35.55 
 
 		 395 aa  189  9e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2514  DNA processing protein DprA, putative  37.44 
 
 		 475 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  39.58 
 
 		 365 aa  188  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0835  DNA protecting protein DprA  37.05 
 
 		 405 aa  188  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0097  DNA protecting protein DprA  38.98 
 
 		 387 aa  187  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  35.61 
 
 		 425 aa  187  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  42.86 
 
 		 320 aa  186  4e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  38.06 
 
 		 389 aa  186  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  33.24 
 
 		 362 aa  186  5e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0348  DNA protecting protein DprA  39.73 
 
 		 379 aa  186  5e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.083083 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  38.69 
 
 		 379 aa  186  6e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  40.27 
 
 		 331 aa  186  6e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  35.51 
 
 		 356 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  33.88 
 
 		 372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  39.41 
 
 		 401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  40.27 
 
 		 338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  36.57 
 
 		 368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  33.96 
 
 		 385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  40.27 
 
 		 338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  35.28 
 
 		 389 aa  184  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  40.27 
 
 		 338 aa  184  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  36.26 
 
 		 372 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>