More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0049 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 368 aa  731    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  43.63 
 
 		 369 aa  261  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  41.5 
 
 		 361 aa  245  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  40.93 
 
 		 366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  43.65 
 
 		 385 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0025  DNA protecting protein DprA  43.81 
 
 		 379 aa  242  7e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  39.44 
 
 		 406 aa  242  9e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  41.06 
 
 		 361 aa  242  9e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  41.06 
 
 		 361 aa  241  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  40.38 
 
 		 388 aa  241  1e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  39.44 
 
 		 373 aa  241  1e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  38.55 
 
 		 373 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  40.7 
 
 		 365 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  39.04 
 
 		 369 aa  238  1e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  39.89 
 
 		 374 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  43.3 
 
 		 359 aa  237  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  40.17 
 
 		 375 aa  237  2e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  40.86 
 
 		 360 aa  236  7e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  37.47 
 
 		 370 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  35.98 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  39.83 
 
 		 358 aa  231  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  42.8 
 
 		 352 aa  230  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2471  Smf/DprA family protein  41.16 
 
 		 371 aa  229  4e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  39.52 
 
 		 379 aa  229  7e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  42.15 
 
 		 360 aa  228  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  37.46 
 
 		 364 aa  227  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  41.86 
 
 		 308 aa  227  3e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  40.66 
 
 		 362 aa  225  8e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  40.11 
 
 		 385 aa  225  8e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  41.64 
 
 		 359 aa  224  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  34.56 
 
 		 409 aa  224  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  37.96 
 
 		 372 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  39.33 
 
 		 356 aa  223  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  41.53 
 
 		 296 aa  223  4e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0022  DNA-processing protein smf chain A  42.28 
 
 		 362 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638184  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  38.25 
 
 		 369 aa  222  7e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  38.94 
 
 		 359 aa  222  9e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  42.02 
 
 		 338 aa  222  9e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  42.02 
 
 		 338 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  42.02 
 
 		 338 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0440  DNA protecting protein DprA  40 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.303838  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  40.05 
 
 		 386 aa  220  3e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  39.6 
 
 		 336 aa  219  5e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  39.78 
 
 		 362 aa  219  5e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  36.06 
 
 		 364 aa  218  8.999999999999998e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  37.37 
 
 		 375 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  39.94 
 
 		 375 aa  218  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  41.46 
 
 		 338 aa  218  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  40.82 
 
 		 338 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  39.7 
 
 		 331 aa  218  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  40.82 
 
 		 338 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  39.04 
 
 		 364 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0412  DNA processing chain A  42.86 
 
 		 368 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.232612  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  44.13 
 
 		 389 aa  216  4e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  37.93 
 
 		 371 aa  216  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  36.91 
 
 		 367 aa  216  5e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  40.82 
 
 		 338 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  40.82 
 
 		 338 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4608  DNA protecting protein DprA  41.57 
 
 		 374 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0168836  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03136  hypothetical protein  42.51 
 
 		 374 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.393563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0428  DNA protecting protein DprA  42.51 
 
 		 374 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03087  hypothetical protein  42.51 
 
 		 374 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0428  DNA protecting protein DprA  42.51 
 
 		 374 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0030328  hitchhiker  0.00135165 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0314  DNA protecting protein DprA  40.48 
 
 		 392 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0026  DNA protecting protein DprA  40.94 
 
 		 338 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3479  DNA protecting protein DprA  42.51 
 
 		 374 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000661668  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  40.93 
 
 		 360 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  38.67 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  35.11 
 
 		 362 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  36.68 
 
 		 374 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  33.94 
 
 		 399 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3581  DNA protecting protein DprA  41.27 
 
 		 374 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0315496  normal  0.18869 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  37.67 
 
 		 369 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3670  DNA protecting protein DprA  42.22 
 
 		 374 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.206561  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  37.79 
 
 		 399 aa  212  7.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  38.03 
 
 		 364 aa  211  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  40.43 
 
 		 360 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3768  DNA protecting protein DprA  41.99 
 
 		 374 aa  210  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00137702  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3772  DNA protecting protein DprA  41.05 
 
 		 374 aa  210  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0357  DNA protecting protein DprA  39.51 
 
 		 377 aa  209  5e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0657137  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  40.17 
 
 		 365 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0383  DNA protecting protein DprA  36.51 
 
 		 381 aa  209  5e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.2777  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0045  DNA processing protein DprA, putative  41.3 
 
 		 338 aa  209  5e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.064372  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  36.64 
 
 		 372 aa  209  6e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  38 
 
 		 377 aa  209  7e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  38.13 
 
 		 368 aa  209  7e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  39.38 
 
 		 383 aa  209  8e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  37.6 
 
 		 372 aa  209  8e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  35.01 
 
 		 349 aa  208  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3674  DNA protecting protein DprA  41.05 
 
 		 374 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3709  DNA protecting protein DprA  41.05 
 
 		 374 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.0813608 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0026  DNA protecting protein DprA  39.24 
 
 		 340 aa  208  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  35.5 
 
 		 395 aa  208  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3601  DNA protecting protein DprA  41.05 
 
 		 374 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000541333  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  40.66 
 
 		 365 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  40.66 
 
 		 366 aa  208  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  37.57 
 
 		 365 aa  207  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3602  DNA protecting protein DprA  41.05 
 
 		 374 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.62233 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  36.96 
 
 		 365 aa  208  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  36.96 
 
 		 365 aa  208  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>