More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1801 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  100 
 
 		 375 aa  734    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1209  DNA processing protein DprA, putative  58.2 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3825  DNA protecting protein DprA  57.75 
 
 		 592 aa  324  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188675  normal  0.0366246 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  48.12 
 
 		 372 aa  300  3e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3669  DNA protecting protein DprA  44.47 
 
 		 388 aa  292  6e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215267  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3194  SMF protein  46.3 
 
 		 374 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0730  DNA protecting protein DprA  48.37 
 
 		 373 aa  278  8e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0602  DNA processing protein DprA, putative  42.64 
 
 		 393 aa  278  1e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  45.38 
 
 		 387 aa  277  2e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0567  SMF protein  42.12 
 
 		 393 aa  272  7e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1759  DNA protecting protein DprA  41.98 
 
 		 383 aa  267  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.582182  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1508  DNA protecting protein DprA  47.79 
 
 		 366 aa  266  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.300262 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1296  DNA protecting protein DprA  45.87 
 
 		 380 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.857359  decreased coverage  0.000779051 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0933  DNA protecting protein DprA  43.04 
 
 		 383 aa  265  7e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339365  normal  0.657052 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3857  DNA protecting protein DprA  43.46 
 
 		 422 aa  263  3e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2285  DNA processing protein DprA, putative  45.01 
 
 		 372 aa  263  3e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1356  DNA protecting protein DprA  46.28 
 
 		 378 aa  263  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1388  DNA protecting protein DprA  45.99 
 
 		 380 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0842  DNA protecting protein DprA  43.41 
 
 		 396 aa  261  1e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0234041  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2338  DNA processing protein DprA, putative  42.63 
 
 		 382 aa  261  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1138  DNA protecting protein DprA  44.23 
 
 		 379 aa  259  7e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.823359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3916  DNA protecting protein DprA  46.54 
 
 		 378 aa  257  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2010  SMF protein  45.18 
 
 		 372 aa  256  3e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.272582 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1644  DNA protecting protein DprA  44.36 
 
 		 395 aa  255  9e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.263138 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4729  DNA processing chain A (DprA/Smf)  46.77 
 
 		 372 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3313  DNA protecting protein DprA  44.86 
 
 		 391 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2244  DNA processing protein DprA, putative  43.5 
 
 		 372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441275  normal  0.282732 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3421  DNA protecting protein DprA  40.42 
 
 		 429 aa  251  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.143035  normal  0.697351 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3158  DNA processing protein DprA, putative  45.04 
 
 		 402 aa  249  8e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3031  DNA processing protein DprA, putative  44.5 
 
 		 422 aa  248  9e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.461494  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3638  DNA protecting protein DprA  43.48 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  36.29 
 
 		 374 aa  247  2e-64  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3315  DNA protecting protein DprA  42.75 
 
 		 397 aa  248  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451996  normal  0.725027 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2317  DNA protecting protein DprA  46.26 
 
 		 369 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0883  putative DNA processing protein DprA  35.31 
 
 		 375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.430936  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3515  DNA protecting protein DprA  41.75 
 
 		 397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.567424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3531  DNA protecting protein DprA  43.43 
 
 		 378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2421  DNA processing protein DprA, putative  43.39 
 
 		 378 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4345  DNA protecting protein DprA  43.89 
 
 		 391 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.61785 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4323  DNA protecting protein DprA  41.03 
 
 		 418 aa  239  5e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  42.78 
 
 		 371 aa  233  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0849  DNA protecting protein DprA  46.32 
 
 		 372 aa  233  6e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0474  DNA protecting protein DprA  42.2 
 
 		 403 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652717  normal  0.262413 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  47.31 
 
 		 377 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  41.99 
 
 		 379 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2177  hypothetical protein  46.05 
 
 		 372 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.809736  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  42.17 
 
 		 359 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  45.38 
 
 		 356 aa  224  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  42.66 
 
 		 364 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  45.08 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  37.91 
 
 		 365 aa  219  6e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  40.33 
 
 		 366 aa  216  7e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  43.31 
 
 		 358 aa  216  8e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_002978  WD0092  DNA processing chain A  38.1 
 
 		 362 aa  215  9.999999999999999e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1867  DNA protecting protein DprA  45.14 
 
 		 381 aa  215  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  41.51 
 
 		 365 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1931  DNA processing chain A  45.14 
 
 		 381 aa  215  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  45.39 
 
 		 336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  37.86 
 
 		 388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  39.95 
 
 		 367 aa  212  7e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  35.1 
 
 		 362 aa  212  7e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0088  DNA protecting protein DprA  39.68 
 
 		 365 aa  212  7e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  hitchhiker  0.00000226151 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  42.15 
 
 		 365 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  41.51 
 
 		 365 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  48.21 
 
 		 366 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04053  DNA protecting protein DprA  45.36 
 
 		 311 aa  210  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  38.79 
 
 		 331 aa  210  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  42.78 
 
 		 368 aa  210  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  42.75 
 
 		 369 aa  209  5e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  40.83 
 
 		 394 aa  209  6e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  40.05 
 
 		 359 aa  209  9e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  40.33 
 
 		 368 aa  209  9e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0069  DNA protecting protein DprA  40.65 
 
 		 365 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0131518  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  40.11 
 
 		 375 aa  208  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  41.69 
 
 		 338 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  41.36 
 
 		 338 aa  207  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  35.11 
 
 		 399 aa  206  4e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  41.36 
 
 		 338 aa  206  4e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  38.68 
 
 		 362 aa  206  6e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  40 
 
 		 359 aa  206  7e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  40.56 
 
 		 364 aa  205  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  38.23 
 
 		 365 aa  205  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  40.15 
 
 		 399 aa  205  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0097  DNA protecting protein DprA  45.62 
 
 		 387 aa  205  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  39.42 
 
 		 379 aa  204  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  39.66 
 
 		 366 aa  204  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  40.65 
 
 		 361 aa  204  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0022  DNA-processing protein smf chain A  45.7 
 
 		 362 aa  203  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638184  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0045  DNA processing protein DprA, putative  44.33 
 
 		 338 aa  202  5e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.064372  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0771  DNA protecting protein DprA  45.33 
 
 		 553 aa  202  6e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0319665 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  40.2 
 
 		 338 aa  202  7e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  38.44 
 
 		 386 aa  202  7e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  43.93 
 
 		 372 aa  202  8e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3862  DNA processing protein DprA, putative  36.7 
 
 		 409 aa  202  8e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  42.62 
 
 		 389 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  43.19 
 
 		 320 aa  202  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  39.1 
 
 		 408 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2080  DNA protecting protein DprA  52.4 
 
 		 229 aa  201  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  38.02 
 
 		 369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1159  DNA protecting protein DprA  43.55 
 
 		 668 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.20942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>