More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_A0567 on replicon NC_009504
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0602  DNA processing protein DprA, putative  98.47 
 
 
393 aa  764    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0567  SMF protein  100 
 
 
393 aa  777    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3669  DNA protecting protein DprA  79.64 
 
 
388 aa  617  1e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215267  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1759  DNA protecting protein DprA  53.61 
 
 
383 aa  408  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.582182  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0933  DNA protecting protein DprA  54.31 
 
 
383 aa  402  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339365  normal  0.657052 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1296  DNA protecting protein DprA  56.62 
 
 
380 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.857359  decreased coverage  0.000779051 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1388  DNA protecting protein DprA  55.84 
 
 
380 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0842  DNA protecting protein DprA  51.54 
 
 
396 aa  372  1e-102  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0234041  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2244  DNA processing protein DprA, putative  53.66 
 
 
372 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441275  normal  0.282732 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1356  DNA protecting protein DprA  53.37 
 
 
378 aa  350  2e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2285  DNA processing protein DprA, putative  52.27 
 
 
372 aa  347  3e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4729  DNA processing chain A (DprA/Smf)  52.01 
 
 
372 aa  344  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2010  SMF protein  51.87 
 
 
372 aa  344  1e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.272582 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3916  DNA protecting protein DprA  53.83 
 
 
378 aa  343  2.9999999999999997e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3031  DNA processing protein DprA, putative  49.87 
 
 
422 aa  332  5e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.461494  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3315  DNA protecting protein DprA  51.36 
 
 
397 aa  331  1e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451996  normal  0.725027 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3313  DNA protecting protein DprA  49.49 
 
 
391 aa  330  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  49.73 
 
 
372 aa  328  7e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3638  DNA protecting protein DprA  50.87 
 
 
397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3531  DNA protecting protein DprA  50.52 
 
 
378 aa  325  6e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3515  DNA protecting protein DprA  50.88 
 
 
397 aa  324  2e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.567424  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2421  DNA processing protein DprA, putative  50.13 
 
 
378 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4345  DNA protecting protein DprA  50.13 
 
 
391 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.61785 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0474  DNA protecting protein DprA  49.26 
 
 
403 aa  310  4e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652717  normal  0.262413 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3194  SMF protein  47.86 
 
 
374 aa  300  2e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3421  DNA protecting protein DprA  43.51 
 
 
429 aa  293  3e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.143035  normal  0.697351 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1508  DNA protecting protein DprA  47.18 
 
 
366 aa  287  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.300262 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1209  DNA processing protein DprA, putative  45.58 
 
 
360 aa  283  5.000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  45.36 
 
 
387 aa  280  3e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3857  DNA protecting protein DprA  44.84 
 
 
422 aa  278  1e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  42.12 
 
 
375 aa  272  8.000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2338  DNA processing protein DprA, putative  43.99 
 
 
382 aa  270  4e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  37.37 
 
 
374 aa  268  1e-70  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3825  DNA protecting protein DprA  48.28 
 
 
592 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188675  normal  0.0366246 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0883  putative DNA processing protein DprA  37.53 
 
 
375 aa  262  6e-69  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.430936  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0730  DNA protecting protein DprA  44.36 
 
 
373 aa  250  4e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0092  DNA processing chain A  38.26 
 
 
362 aa  246  6e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1644  DNA protecting protein DprA  44.06 
 
 
395 aa  244  9.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.263138 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3158  DNA processing protein DprA, putative  44.01 
 
 
402 aa  237  3e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0388  putative DNA processing protein DprA  38.28 
 
 
378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2317  DNA protecting protein DprA  43.31 
 
 
369 aa  234  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1138  DNA protecting protein DprA  39.34 
 
 
379 aa  233  7.000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.823359  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0849  DNA protecting protein DprA  43.77 
 
 
372 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  39.19 
 
 
368 aa  220  3e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2177  hypothetical protein  41.91 
 
 
372 aa  216  5e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.809736  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  37.8 
 
 
359 aa  216  5e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  38.17 
 
 
379 aa  209  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  37.89 
 
 
371 aa  206  7e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  38.06 
 
 
401 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  35.05 
 
 
362 aa  203  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  38.68 
 
 
386 aa  203  5e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  43.06 
 
 
356 aa  202  9e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4323  DNA protecting protein DprA  38.73 
 
 
418 aa  202  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  38.36 
 
 
389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  39.08 
 
 
365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  40 
 
 
336 aa  200  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  38.15 
 
 
364 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  35.39 
 
 
358 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  39.3 
 
 
375 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0097  DNA protecting protein DprA  38.36 
 
 
387 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  36.39 
 
 
359 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  37.47 
 
 
369 aa  199  9e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  37.17 
 
 
369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  37.63 
 
 
408 aa  197  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0835  DNA protecting protein DprA  35.56 
 
 
405 aa  197  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  36.48 
 
 
385 aa  197  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  34.63 
 
 
388 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  37.66 
 
 
374 aa  196  6e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  36.54 
 
 
364 aa  196  9e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  36.65 
 
 
359 aa  195  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  40.86 
 
 
389 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  43.07 
 
 
394 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  36.22 
 
 
366 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  38.23 
 
 
389 aa  193  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  39.57 
 
 
379 aa  193  5e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  37.12 
 
 
399 aa  193  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  36.81 
 
 
399 aa  192  9e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  36.04 
 
 
370 aa  192  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  36.84 
 
 
369 aa  192  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  41.43 
 
 
366 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1867  DNA protecting protein DprA  39.39 
 
 
381 aa  191  2e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  36.44 
 
 
369 aa  190  2.9999999999999997e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1931  DNA processing chain A  39.39 
 
 
381 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  39.74 
 
 
320 aa  189  7e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  36.19 
 
 
364 aa  189  7e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  44.76 
 
 
375 aa  189  8e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  33.33 
 
 
409 aa  189  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  37.68 
 
 
401 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  41.2 
 
 
365 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  36.87 
 
 
386 aa  188  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  37.33 
 
 
372 aa  187  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0021  SMF protein  41.61 
 
 
372 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  40.85 
 
 
365 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  39.93 
 
 
331 aa  187  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  36.57 
 
 
386 aa  187  4e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  35.85 
 
 
382 aa  187  4e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  35.98 
 
 
365 aa  186  5e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  35.98 
 
 
365 aa  186  5e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  37.07 
 
 
421 aa  186  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04053  DNA protecting protein DprA  39.68 
 
 
311 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>