More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1209 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1209  DNA processing protein DprA, putative  100 
 
 		 360 aa  702    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  58.2 
 
 		 375 aa  390  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3825  DNA protecting protein DprA  64.15 
 
 		 592 aa  375  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188675  normal  0.0366246 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3194  SMF protein  50.69 
 
 		 374 aa  323  3e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  50.68 
 
 		 372 aa  318  1e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3669  DNA protecting protein DprA  46.11 
 
 		 388 aa  316  4e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215267  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0602  DNA processing protein DprA, putative  46.11 
 
 		 393 aa  307  1.0000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0933  DNA protecting protein DprA  45.78 
 
 		 383 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339365  normal  0.657052 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0567  SMF protein  45.58 
 
 		 393 aa  302  6.000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1296  DNA protecting protein DprA  48.11 
 
 		 380 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.857359  decreased coverage  0.000779051 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1388  DNA protecting protein DprA  47.03 
 
 		 380 aa  295  6e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0730  DNA protecting protein DprA  51.87 
 
 		 373 aa  293  4e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4729  DNA processing chain A (DprA/Smf)  48.37 
 
 		 372 aa  292  7e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2244  DNA processing protein DprA, putative  47.93 
 
 		 372 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441275  normal  0.282732 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2285  DNA processing protein DprA, putative  46.56 
 
 		 372 aa  291  1e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3916  DNA protecting protein DprA  48.77 
 
 		 378 aa  290  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1759  DNA protecting protein DprA  44.14 
 
 		 383 aa  290  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.582182  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3031  DNA processing protein DprA, putative  48.91 
 
 		 422 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.461494  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1356  DNA protecting protein DprA  46.56 
 
 		 378 aa  282  5.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3531  DNA protecting protein DprA  47.7 
 
 		 378 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2421  DNA processing protein DprA, putative  48.91 
 
 		 378 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2010  SMF protein  45.18 
 
 		 372 aa  271  1e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.272582 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3315  DNA protecting protein DprA  44.42 
 
 		 397 aa  270  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451996  normal  0.725027 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3515  DNA protecting protein DprA  45.43 
 
 		 397 aa  271  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.567424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3638  DNA protecting protein DprA  44.67 
 
 		 397 aa  271  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  44.23 
 
 		 387 aa  266  5.999999999999999e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3313  DNA protecting protein DprA  46.27 
 
 		 391 aa  265  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0849  DNA protecting protein DprA  49.16 
 
 		 372 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2317  DNA protecting protein DprA  48.34 
 
 		 369 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4345  DNA protecting protein DprA  46.53 
 
 		 391 aa  260  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.61785 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1138  DNA protecting protein DprA  45.07 
 
 		 379 aa  260  3e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.823359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0474  DNA protecting protein DprA  46.04 
 
 		 403 aa  259  4e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652717  normal  0.262413 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0842  DNA protecting protein DprA  40.74 
 
 		 396 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0234041  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3158  DNA processing protein DprA, putative  45.8 
 
 		 402 aa  258  8e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1508  DNA protecting protein DprA  46.13 
 
 		 366 aa  257  3e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.300262 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2338  DNA processing protein DprA, putative  42.62 
 
 		 382 aa  256  6e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3857  DNA protecting protein DprA  41.46 
 
 		 422 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4323  DNA protecting protein DprA  44.78 
 
 		 418 aa  254  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2177  hypothetical protein  48.88 
 
 		 372 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.809736  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3421  DNA protecting protein DprA  39.13 
 
 		 429 aa  248  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.143035  normal  0.697351 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1644  DNA protecting protein DprA  45.33 
 
 		 395 aa  244  9.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.263138 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  35.69 
 
 		 374 aa  241  2e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0883  putative DNA processing protein DprA  34.51 
 
 		 375 aa  238  1e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.430936  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0092  DNA processing chain A  40 
 
 		 362 aa  228  2e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  42.32 
 
 		 375 aa  225  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  41.13 
 
 		 358 aa  222  7e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  39.06 
 
 		 365 aa  218  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  39.73 
 
 		 379 aa  218  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  41.55 
 
 		 377 aa  216  4e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  33.98 
 
 		 362 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  40.28 
 
 		 388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  39.61 
 
 		 359 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  40.26 
 
 		 401 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  39.72 
 
 		 364 aa  212  9e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  40.17 
 
 		 379 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0388  putative DNA processing protein DprA  36.1 
 
 		 378 aa  210  3e-53  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  40.97 
 
 		 356 aa  210  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1867  DNA protecting protein DprA  38.42 
 
 		 381 aa  209  7e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  41.16 
 
 		 364 aa  208  1e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  34.05 
 
 		 409 aa  208  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1931  DNA processing chain A  38.42 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  36.7 
 
 		 395 aa  206  4e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  39.11 
 
 		 359 aa  205  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  42.23 
 
 		 394 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  43.45 
 
 		 377 aa  204  2e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  40.56 
 
 		 386 aa  202  9e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  40.51 
 
 		 366 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  39.78 
 
 		 365 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  37.19 
 
 		 369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  40.28 
 
 		 336 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  41 
 
 		 365 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  39.39 
 
 		 359 aa  199  5e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  36.16 
 
 		 367 aa  199  9e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  38.75 
 
 		 371 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  38.83 
 
 		 368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  39.39 
 
 		 366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  35.28 
 
 		 399 aa  196  4.0000000000000005e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  36.1 
 
 		 448 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  38.32 
 
 		 386 aa  195  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2083  transcriptional regulator TrmB  39.08 
 
 		 337 aa  195  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  40.67 
 
 		 402 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  35.36 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3128  DNA protecting protein DprA  38.06 
 
 		 475 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0348  DNA protecting protein DprA  37.93 
 
 		 379 aa  194  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.083083 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  39.37 
 
 		 401 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 386 aa  194  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  33.43 
 
 		 370 aa  193  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2514  DNA processing protein DprA, putative  38.06 
 
 		 475 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  39.89 
 
 		 365 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  39 
 
 		 365 aa  193  5e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  38.44 
 
 		 385 aa  192  7e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  36.68 
 
 		 366 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  35.83 
 
 		 382 aa  192  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  37.53 
 
 		 374 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04053  DNA protecting protein DprA  41.3 
 
 		 311 aa  191  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  37.22 
 
 		 422 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2088  DNA protecting protein DprA  39.94 
 
 		 384 aa  190  4e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.972888  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  42.44 
 
 		 320 aa  189  4e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2471  Smf/DprA family protein  42.31 
 
 		 371 aa  189  4e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  38.08 
 
 		 360 aa  189  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>