More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1222 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  100 
 
 
366 aa  749    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  51.21 
 
 
394 aa  359  4e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  49.03 
 
 
364 aa  345  8.999999999999999e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  46.69 
 
 
361 aa  325  1e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  45.15 
 
 
375 aa  305  7e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  45.87 
 
 
365 aa  290  3e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  43.3 
 
 
362 aa  290  4e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  46.56 
 
 
386 aa  287  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  42.78 
 
 
360 aa  284  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  43.26 
 
 
373 aa  282  8.000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  45.43 
 
 
370 aa  280  4e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  43.22 
 
 
362 aa  277  2e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  44.67 
 
 
359 aa  277  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  41.57 
 
 
373 aa  275  6e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  43.7 
 
 
359 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  44.38 
 
 
359 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  43.8 
 
 
360 aa  271  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  41.01 
 
 
406 aa  269  5e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  41.76 
 
 
371 aa  269  7e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  44.71 
 
 
356 aa  267  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  43.44 
 
 
358 aa  267  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  47.32 
 
 
364 aa  260  3e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  42.52 
 
 
385 aa  259  7e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  37.67 
 
 
409 aa  258  1e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  43.71 
 
 
389 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  44.28 
 
 
372 aa  247  2e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  38.89 
 
 
374 aa  246  3e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  42 
 
 
389 aa  246  4e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  45.1 
 
 
361 aa  244  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  40.93 
 
 
368 aa  244  1.9999999999999999e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  37.84 
 
 
372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  40.33 
 
 
385 aa  243  3e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  42.55 
 
 
362 aa  242  6e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  44.77 
 
 
361 aa  241  1e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  40.4 
 
 
399 aa  237  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  36.64 
 
 
369 aa  237  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  37.85 
 
 
369 aa  238  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  40.72 
 
 
388 aa  236  4e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  38.87 
 
 
349 aa  235  9e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  44.25 
 
 
320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  39.61 
 
 
382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  47.04 
 
 
375 aa  233  4.0000000000000004e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  39.56 
 
 
364 aa  233  5e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  39.58 
 
 
336 aa  230  3e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  38.87 
 
 
367 aa  230  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  41.23 
 
 
366 aa  229  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  37.2 
 
 
402 aa  229  5e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  43 
 
 
434 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  43 
 
 
434 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  38.11 
 
 
379 aa  226  5.0000000000000005e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  37.33 
 
 
377 aa  225  9e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  39.7 
 
 
401 aa  225  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  37.4 
 
 
365 aa  225  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  40.17 
 
 
374 aa  225  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  37.4 
 
 
365 aa  225  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  45.29 
 
 
308 aa  224  1e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  43.58 
 
 
358 aa  224  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  42.07 
 
 
369 aa  224  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0638  DNA protecting protein DprA  37.27 
 
 
375 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  47.41 
 
 
402 aa  223  4e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  40 
 
 
360 aa  223  4e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  44.17 
 
 
369 aa  223  6e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  44.68 
 
 
368 aa  223  6e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  39.23 
 
 
365 aa  222  7e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  40.42 
 
 
379 aa  222  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0141  DNA processing protein DprA, putative  40.71 
 
 
396 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2273  DNA protecting protein DprA  40.71 
 
 
396 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  43.93 
 
 
296 aa  222  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  40 
 
 
360 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2808  DNA protecting protein DprA  40.71 
 
 
434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2350  DNA protecting protein DprA  40.71 
 
 
434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  47.41 
 
 
401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  43.82 
 
 
338 aa  220  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2933  DNA protecting protein DprA  36.8 
 
 
380 aa  219  5e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.608648  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0660  DNA protecting protein DprA  36.73 
 
 
375 aa  218  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137383  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  41.2 
 
 
337 aa  218  1e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  42.91 
 
 
338 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  42.91 
 
 
338 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  43.82 
 
 
338 aa  218  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3601  DNA protecting protein DprA  45.61 
 
 
374 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000541333  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3772  DNA protecting protein DprA  45.61 
 
 
374 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0345  SMF family protein  40.41 
 
 
434 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3674  DNA protecting protein DprA  45.61 
 
 
374 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3709  DNA protecting protein DprA  45.61 
 
 
374 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.0813608 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  43.82 
 
 
338 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  42.55 
 
 
331 aa  217  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  43.97 
 
 
338 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  37.97 
 
 
389 aa  216  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  41.2 
 
 
337 aa  216  4e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  42.91 
 
 
338 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0026  DNA protecting protein DprA  43.46 
 
 
340 aa  216  7e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  42.55 
 
 
338 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0415  DNA protecting protein DprA  37.57 
 
 
382 aa  216  7e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0127  DNA processing protein DprA, putative  49.54 
 
 
433 aa  215  9e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  43.82 
 
 
369 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  41.58 
 
 
374 aa  215  9.999999999999999e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3673  DNA protecting protein DprA  39.11 
 
 
366 aa  214  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.917953  normal  0.236598 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  37.5 
 
 
372 aa  213  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3602  DNA protecting protein DprA  45.26 
 
 
374 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.62233 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2083  transcriptional regulator TrmB  41.92 
 
 
337 aa  213  3.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>