More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0529 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 371 aa  749    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  62.12 
 
 		 359 aa  451  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  59.89 
 
 		 364 aa  412  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  55.71 
 
 		 359 aa  395  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  59.94 
 
 		 356 aa  393  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  55.43 
 
 		 359 aa  391  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  57.54 
 
 		 358 aa  388  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  44.57 
 
 		 362 aa  293  3e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  43.4 
 
 		 409 aa  291  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  45.75 
 
 		 386 aa  291  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  42.62 
 
 		 370 aa  288  1e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  45.23 
 
 		 372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  41.76 
 
 		 366 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  43.56 
 
 		 366 aa  270  4e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  43.75 
 
 		 361 aa  268  8.999999999999999e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  40 
 
 		 374 aa  267  2e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  44.75 
 
 		 375 aa  266  4e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  37.12 
 
 		 356 aa  265  8.999999999999999e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  42.86 
 
 		 389 aa  264  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  44.83 
 
 		 360 aa  260  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  44.38 
 
 		 362 aa  259  5.0000000000000005e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  44.2 
 
 		 367 aa  258  8e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  43.3 
 
 		 406 aa  256  4e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  42.74 
 
 		 373 aa  255  9e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  41.8 
 
 		 388 aa  253  5.000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  42.51 
 
 		 373 aa  252  7e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  41.83 
 
 		 365 aa  251  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  41.91 
 
 		 385 aa  251  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  43.39 
 
 		 394 aa  250  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  37.84 
 
 		 372 aa  249  5e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  41.26 
 
 		 382 aa  244  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  38.08 
 
 		 389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  41.76 
 
 		 379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  43.99 
 
 		 368 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  39.61 
 
 		 364 aa  243  5e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  44.23 
 
 		 336 aa  243  5e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0966  DNA protecting protein DprA  38.64 
 
 		 442 aa  242  6e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  40.44 
 
 		 365 aa  242  7e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  44.02 
 
 		 385 aa  241  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  42.78 
 
 		 379 aa  241  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  38.59 
 
 		 425 aa  240  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  40.96 
 
 		 369 aa  240  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  48.28 
 
 		 320 aa  240  4e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  42.82 
 
 		 360 aa  239  5e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  39.36 
 
 		 364 aa  239  5e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1041  DNA protecting protein DprA  43.79 
 
 		 338 aa  239  5e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.367593  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  41.8 
 
 		 377 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  41.51 
 
 		 399 aa  237  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  38.99 
 
 		 395 aa  236  4e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  36.87 
 
 		 369 aa  236  4e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  40.81 
 
 		 369 aa  236  5.0000000000000005e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  43.94 
 
 		 358 aa  236  7e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  43.91 
 
 		 375 aa  235  8e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  42.66 
 
 		 372 aa  235  9e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  40.92 
 
 		 369 aa  234  3e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  43.21 
 
 		 362 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  38.92 
 
 		 374 aa  233  5e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  38.56 
 
 		 401 aa  230  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  39.58 
 
 		 387 aa  230  3e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5115  DNA protecting protein DprA  40.8 
 
 		 382 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  38.31 
 
 		 421 aa  229  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  42.03 
 
 		 389 aa  229  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  39.44 
 
 		 369 aa  229  7e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  40.54 
 
 		 375 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  39.73 
 
 		 360 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  41.85 
 
 		 365 aa  227  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  41.85 
 
 		 365 aa  227  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  39.4 
 
 		 408 aa  228  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  39.7 
 
 		 377 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0097  DNA protecting protein DprA  44.15 
 
 		 387 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  39.05 
 
 		 365 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  39.06 
 
 		 360 aa  226  7e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  50.23 
 
 		 363 aa  225  9e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2083  transcriptional regulator TrmB  46.37 
 
 		 337 aa  224  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0383  DNA protecting protein DprA  35.52 
 
 		 381 aa  224  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.2777  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1610  DNA protecting protein DprA  38.27 
 
 		 370 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 386 aa  222  8e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3307  DNA protecting protein DprA  37.27 
 
 		 374 aa  222  9e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  37.36 
 
 		 368 aa  221  9.999999999999999e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0314  DNA protecting protein DprA  39.78 
 
 		 392 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  44.25 
 
 		 361 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  47.1 
 
 		 366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  42.28 
 
 		 748 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  39.74 
 
 		 386 aa  220  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  37.5 
 
 		 399 aa  219  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  44.52 
 
 		 401 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  42.42 
 
 		 399 aa  219  7e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0730  DNA protecting protein DprA  41.62 
 
 		 373 aa  218  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  43.9 
 
 		 361 aa  217  2e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  41.48 
 
 		 368 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0412  DNA protecting protein DprA  42.38 
 
 		 383 aa  217  2e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3669  DNA protecting protein DprA  39.3 
 
 		 388 aa  218  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215267  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  40.72 
 
 		 364 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0602  DNA processing protein DprA, putative  38.16 
 
 		 393 aa  217  2.9999999999999998e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0348  DNA protecting protein DprA  42.26 
 
 		 379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.083083 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  45.05 
 
 		 402 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3734  DNA protecting protein DprA  54.23 
 
 		 339 aa  216  4e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.242141  hitchhiker  0.0022522 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  36.36 
 
 		 382 aa  216  4e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  38.46 
 
 		 422 aa  216  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2088  DNA protecting protein DprA  42.66 
 
 		 384 aa  216  5e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.972888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>