More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0388 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0388  putative DNA processing protein DprA  100 
 
 		 378 aa  768    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0092  DNA processing chain A  41.44 
 
 		 362 aa  258  1e-67  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  39.79 
 
 		 374 aa  256  4e-67  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  39.63 
 
 		 372 aa  250  3e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0883  putative DNA processing protein DprA  39.11 
 
 		 375 aa  247  3e-64  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.430936  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0933  DNA protecting protein DprA  37.53 
 
 		 383 aa  237  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339365  normal  0.657052 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0602  DNA processing protein DprA, putative  38.28 
 
 		 393 aa  237  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3669  DNA protecting protein DprA  37.76 
 
 		 388 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215267  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0567  SMF protein  38.28 
 
 		 393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1508  DNA protecting protein DprA  36.73 
 
 		 366 aa  233  5e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.300262 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1388  DNA protecting protein DprA  37.37 
 
 		 380 aa  227  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2285  DNA processing protein DprA, putative  35.47 
 
 		 372 aa  223  4e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1296  DNA protecting protein DprA  36.56 
 
 		 380 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.857359  decreased coverage  0.000779051 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2010  SMF protein  35.2 
 
 		 372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.272582 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2244  DNA processing protein DprA, putative  35.56 
 
 		 372 aa  219  7e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441275  normal  0.282732 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1138  DNA protecting protein DprA  38.11 
 
 		 379 aa  219  8.999999999999998e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.823359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3315  DNA protecting protein DprA  36.8 
 
 		 397 aa  217  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451996  normal  0.725027 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0842  DNA protecting protein DprA  35.96 
 
 		 396 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0234041  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3638  DNA protecting protein DprA  36.29 
 
 		 397 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3421  DNA protecting protein DprA  34.29 
 
 		 429 aa  212  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.143035  normal  0.697351 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3515  DNA protecting protein DprA  34.26 
 
 		 397 aa  211  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.567424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1759  DNA protecting protein DprA  35.48 
 
 		 383 aa  210  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.582182  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0474  DNA protecting protein DprA  34.58 
 
 		 403 aa  210  4e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652717  normal  0.262413 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  36.75 
 
 		 387 aa  209  5e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2338  DNA processing protein DprA, putative  38.2 
 
 		 382 aa  208  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4729  DNA processing chain A (DprA/Smf)  42.76 
 
 		 372 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1356  DNA protecting protein DprA  35.15 
 
 		 378 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3313  DNA protecting protein DprA  39.6 
 
 		 391 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3916  DNA protecting protein DprA  36.73 
 
 		 378 aa  207  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0730  DNA protecting protein DprA  36.07 
 
 		 373 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1209  DNA processing protein DprA, putative  36.1 
 
 		 360 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1644  DNA protecting protein DprA  37.16 
 
 		 395 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.263138 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3194  SMF protein  35.11 
 
 		 374 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3531  DNA protecting protein DprA  34.48 
 
 		 378 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4345  DNA protecting protein DprA  39.8 
 
 		 391 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.61785 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3031  DNA processing protein DprA, putative  34.04 
 
 		 422 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.461494  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  32.81 
 
 		 375 aa  195  9e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2421  DNA processing protein DprA, putative  34.31 
 
 		 378 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3857  DNA protecting protein DprA  40.2 
 
 		 422 aa  192  9e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3158  DNA processing protein DprA, putative  36.83 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  35.48 
 
 		 369 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  40.41 
 
 		 359 aa  186  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  42.21 
 
 		 371 aa  186  9e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  39.72 
 
 		 362 aa  184  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  35.52 
 
 		 386 aa  183  5.0000000000000004e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  39.73 
 
 		 352 aa  182  9.000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  39.79 
 
 		 366 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  41.49 
 
 		 358 aa  181  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  44.98 
 
 		 394 aa  182  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  33.07 
 
 		 399 aa  179  4.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3825  DNA protecting protein DprA  42.05 
 
 		 592 aa  179  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188675  normal  0.0366246 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  38.89 
 
 		 358 aa  179  8e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0157  DNA protecting protein DprA  38.08 
 
 		 372 aa  177  2e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.835588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2317  DNA protecting protein DprA  36.77 
 
 		 369 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  33.52 
 
 		 366 aa  176  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  35.18 
 
 		 364 aa  176  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  32.11 
 
 		 379 aa  176  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  33.78 
 
 		 369 aa  175  9e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4323  DNA protecting protein DprA  33.42 
 
 		 418 aa  175  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  45.07 
 
 		 405 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  42.45 
 
 		 365 aa  175  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  37.21 
 
 		 356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  34.04 
 
 		 434 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 386 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  34.04 
 
 		 434 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  36.49 
 
 		 336 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  36.33 
 
 		 383 aa  173  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  39.58 
 
 		 359 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  36 
 
 		 320 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  33.15 
 
 		 366 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  32.65 
 
 		 386 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  32.63 
 
 		 365 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  38.55 
 
 		 364 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  40.56 
 
 		 385 aa  172  7.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0849  DNA protecting protein DprA  36.53 
 
 		 372 aa  172  9e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2471  Smf/DprA family protein  42.02 
 
 		 371 aa  171  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  36.15 
 
 		 401 aa  171  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  38.31 
 
 		 375 aa  170  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2177  hypothetical protein  36.27 
 
 		 372 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.809736  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  38.08 
 
 		 372 aa  170  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0141  DNA processing protein DprA, putative  33.6 
 
 		 396 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2273  DNA protecting protein DprA  33.6 
 
 		 396 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  35.96 
 
 		 337 aa  170  4e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2350  DNA protecting protein DprA  33.6 
 
 		 434 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2808  DNA protecting protein DprA  33.6 
 
 		 434 aa  169  6e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  36.46 
 
 		 401 aa  169  7e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  36.62 
 
 		 368 aa  169  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  38.95 
 
 		 359 aa  169  9e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  36.33 
 
 		 402 aa  169  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  36.42 
 
 		 361 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  35.65 
 
 		 337 aa  168  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  38.25 
 
 		 356 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  37.46 
 
 		 385 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  36.03 
 
 		 366 aa  167  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  35.09 
 
 		 365 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  33.24 
 
 		 379 aa  167  4e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  35.42 
 
 		 361 aa  166  5.9999999999999996e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0345  SMF family protein  35.96 
 
 		 434 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2088  DNA protecting protein DprA  43.9 
 
 		 384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.972888  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  33.16 
 
 		 399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>