More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2630 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  100 
 
 
379 aa  743    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  55.67 
 
 
375 aa  359  5e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  53.95 
 
 
388 aa  350  3e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  54.5 
 
 
368 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  49.46 
 
 
372 aa  316  4e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2088  DNA protecting protein DprA  51.49 
 
 
384 aa  313  3.9999999999999997e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.972888  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  51.44 
 
 
336 aa  311  9e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  49.47 
 
 
364 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  51.23 
 
 
377 aa  301  2e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  49.08 
 
 
365 aa  289  6e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  54.17 
 
 
320 aa  282  6.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  46.65 
 
 
377 aa  282  9e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  49.33 
 
 
358 aa  281  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  46.22 
 
 
379 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  46.57 
 
 
408 aa  280  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  47.35 
 
 
374 aa  279  5e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  48.52 
 
 
365 aa  279  6e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  48.52 
 
 
365 aa  279  6e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0097  DNA protecting protein DprA  50.92 
 
 
387 aa  278  1e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1931  DNA processing chain A  46.48 
 
 
381 aa  276  6e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  47.24 
 
 
401 aa  273  3e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1867  DNA protecting protein DprA  46.2 
 
 
381 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  46.67 
 
 
366 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  48.31 
 
 
402 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  48.55 
 
 
308 aa  270  2e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  45.04 
 
 
369 aa  270  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  46.33 
 
 
386 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  48.12 
 
 
365 aa  269  7e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  45.34 
 
 
386 aa  269  7e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  47.29 
 
 
401 aa  268  8e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  48.92 
 
 
365 aa  268  8e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  45.04 
 
 
399 aa  268  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5115  DNA protecting protein DprA  48.83 
 
 
382 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  46.74 
 
 
389 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  41.55 
 
 
361 aa  267  2.9999999999999995e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  48.34 
 
 
296 aa  266  4e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  41.67 
 
 
361 aa  266  5.999999999999999e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  46.52 
 
 
394 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  42.43 
 
 
369 aa  261  1e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  53.31 
 
 
405 aa  260  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  46.61 
 
 
356 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  43.53 
 
 
362 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  47.55 
 
 
434 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  51.75 
 
 
366 aa  258  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0835  DNA protecting protein DprA  45.15 
 
 
405 aa  258  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  47.55 
 
 
434 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3128  DNA protecting protein DprA  44.72 
 
 
475 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  43.13 
 
 
448 aa  256  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00230  putative Rossmann fold nucleotide-binding protein  58.89 
 
 
362 aa  256  6e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143604  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0069  DNA protecting protein DprA  47.58 
 
 
365 aa  255  8e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0131518  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  43.7 
 
 
369 aa  255  8e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2514  DNA processing protein DprA, putative  44.72 
 
 
475 aa  255  8e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  40.69 
 
 
406 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  48.26 
 
 
368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  45.12 
 
 
399 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  41.98 
 
 
399 aa  253  6e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0022  DNA-processing protein smf chain A  50.66 
 
 
362 aa  252  7e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638184  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  43.39 
 
 
422 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04053  DNA protecting protein DprA  47.92 
 
 
311 aa  250  3e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  43.73 
 
 
331 aa  250  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0021  SMF protein  45.68 
 
 
372 aa  249  5e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3183  DNA protecting protein DprA  43.83 
 
 
422 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3862  DNA processing protein DprA, putative  41.13 
 
 
409 aa  249  8e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2808  DNA protecting protein DprA  51.29 
 
 
434 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2350  DNA protecting protein DprA  51.29 
 
 
434 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0141  DNA processing protein DprA, putative  51.29 
 
 
396 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3587  DNA protecting protein DprA  48.82 
 
 
375 aa  247  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0345  SMF family protein  50.16 
 
 
434 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  39.42 
 
 
373 aa  247  2e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3066  DNA protecting protein DprA  43.42 
 
 
422 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2273  DNA protecting protein DprA  51.29 
 
 
396 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3567  DNA processing protein DprA, putative  45.93 
 
 
371 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  45.05 
 
 
338 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  44.41 
 
 
338 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0026  DNA protecting protein DprA  45.28 
 
 
338 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  45.05 
 
 
338 aa  245  8e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  45.05 
 
 
338 aa  245  8e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  40.43 
 
 
369 aa  245  8e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  44.73 
 
 
338 aa  245  9e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  44.41 
 
 
338 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0348  DNA protecting protein DprA  44.07 
 
 
379 aa  244  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.083083 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  44.41 
 
 
338 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  40.29 
 
 
421 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  44.41 
 
 
338 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0088  DNA protecting protein DprA  46.77 
 
 
365 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  hitchhiker  0.00000226151 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  39.42 
 
 
373 aa  243  5e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  42.19 
 
 
368 aa  242  7e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  44.57 
 
 
364 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  40.68 
 
 
352 aa  242  1e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0026  DNA protecting protein DprA  44.09 
 
 
340 aa  241  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0127  DNA processing protein DprA, putative  50 
 
 
433 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  45.76 
 
 
383 aa  238  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3967  DNA protecting protein DprA  45.26 
 
 
373 aa  238  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2471  Smf/DprA family protein  41.42 
 
 
371 aa  238  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0025  DNA protecting protein DprA  41.52 
 
 
379 aa  236  4e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  43.12 
 
 
422 aa  236  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3734  DNA protecting protein DprA  45.93 
 
 
339 aa  235  7e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.242141  hitchhiker  0.0022522 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  43.55 
 
 
367 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  41.3 
 
 
359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  42.51 
 
 
371 aa  233  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>