More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0730 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0730  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 373 aa  711    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  53.53 
 
 		 372 aa  333  2e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1644  DNA protecting protein DprA  56.38 
 
 		 395 aa  331  2e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.263138 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3194  SMF protein  51.74 
 
 		 374 aa  315  6e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1508  DNA protecting protein DprA  52.42 
 
 		 366 aa  298  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.300262 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  48.37 
 
 		 375 aa  289  4e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  48.4 
 
 		 387 aa  290  4e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2285  DNA processing protein DprA, putative  48.78 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1209  DNA processing protein DprA, putative  51.87 
 
 		 360 aa  285  5.999999999999999e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2244  DNA processing protein DprA, putative  50.26 
 
 		 372 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441275  normal  0.282732 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1759  DNA protecting protein DprA  45.68 
 
 		 383 aa  278  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.582182  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3031  DNA processing protein DprA, putative  48.94 
 
 		 422 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.461494  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3531  DNA protecting protein DprA  47.62 
 
 		 378 aa  275  8e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2421  DNA processing protein DprA, putative  49.73 
 
 		 378 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3916  DNA protecting protein DprA  50.54 
 
 		 378 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0933  DNA protecting protein DprA  45.01 
 
 		 383 aa  272  6e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339365  normal  0.657052 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3638  DNA protecting protein DprA  47.84 
 
 		 397 aa  271  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2010  SMF protein  45.12 
 
 		 372 aa  271  2e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.272582 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3315  DNA protecting protein DprA  47.33 
 
 		 397 aa  270  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451996  normal  0.725027 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1356  DNA protecting protein DprA  48.37 
 
 		 378 aa  270  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3669  DNA protecting protein DprA  45.09 
 
 		 388 aa  271  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215267  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0602  DNA processing protein DprA, putative  45.41 
 
 		 393 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  37.5 
 
 		 374 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3515  DNA protecting protein DprA  47.09 
 
 		 397 aa  268  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.567424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4345  DNA protecting protein DprA  50.14 
 
 		 391 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.61785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3313  DNA protecting protein DprA  48.11 
 
 		 391 aa  262  6e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0883  putative DNA processing protein DprA  37.94 
 
 		 375 aa  262  6e-69  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.430936  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4729  DNA processing chain A (DprA/Smf)  48.92 
 
 		 372 aa  262  6.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0567  SMF protein  44.62 
 
 		 393 aa  262  6.999999999999999e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0474  DNA protecting protein DprA  46.8 
 
 		 403 aa  260  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652717  normal  0.262413 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1296  DNA protecting protein DprA  45.68 
 
 		 380 aa  259  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.857359  decreased coverage  0.000779051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3825  DNA protecting protein DprA  52.28 
 
 		 592 aa  258  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188675  normal  0.0366246 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0842  DNA protecting protein DprA  39.9 
 
 		 396 aa  257  3e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0234041  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1388  DNA protecting protein DprA  46.07 
 
 		 380 aa  256  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2338  DNA processing protein DprA, putative  44.17 
 
 		 382 aa  251  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3421  DNA protecting protein DprA  41.65 
 
 		 429 aa  246  4e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.143035  normal  0.697351 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  43.28 
 
 		 377 aa  245  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_002978  WD0092  DNA processing chain A  40.87 
 
 		 362 aa  242  9e-63  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2317  DNA protecting protein DprA  48.11 
 
 		 369 aa  236  6e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  43.13 
 
 		 388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  44.88 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0849  DNA protecting protein DprA  47.92 
 
 		 372 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3857  DNA protecting protein DprA  43.24 
 
 		 422 aa  233  5e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  42.28 
 
 		 372 aa  231  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4323  DNA protecting protein DprA  43.14 
 
 		 418 aa  230  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  41.08 
 
 		 371 aa  230  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  36.59 
 
 		 362 aa  229  6e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3158  DNA processing protein DprA, putative  44.41 
 
 		 402 aa  229  6e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1138  DNA protecting protein DprA  45.58 
 
 		 379 aa  228  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.823359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  42.55 
 
 		 368 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2177  hypothetical protein  47.65 
 
 		 372 aa  225  8e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.809736  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  43.06 
 
 		 358 aa  225  8e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  43.73 
 
 		 386 aa  223  6e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  40.49 
 
 		 359 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  40.53 
 
 		 364 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  42.86 
 
 		 365 aa  220  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  42.4 
 
 		 379 aa  218  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  39.58 
 
 		 367 aa  218  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  44.3 
 
 		 336 aa  216  4e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  40.05 
 
 		 364 aa  215  8e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  39.36 
 
 		 365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  39.36 
 
 		 365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2088  DNA protecting protein DprA  41.08 
 
 		 384 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.972888  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0388  putative DNA processing protein DprA  36.07 
 
 		 378 aa  213  4.9999999999999996e-54  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  38.48 
 
 		 365 aa  213  4.9999999999999996e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  41.39 
 
 		 356 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  40.75 
 
 		 379 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  40.11 
 
 		 375 aa  210  4e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  40.26 
 
 		 399 aa  208  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0966  DNA protecting protein DprA  37.05 
 
 		 442 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  38.52 
 
 		 395 aa  207  3e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  41.19 
 
 		 389 aa  206  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  37.96 
 
 		 389 aa  206  6e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0097  DNA protecting protein DprA  43.88 
 
 		 387 aa  205  9e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04053  DNA protecting protein DprA  45.21 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  38.8 
 
 		 359 aa  205  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  39.18 
 
 		 359 aa  204  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  41.5 
 
 		 408 aa  203  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  36.26 
 
 		 370 aa  204  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5115  DNA protecting protein DprA  41.49 
 
 		 382 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  37.83 
 
 		 338 aa  202  9e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  37.5 
 
 		 338 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  36.91 
 
 		 399 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  40.78 
 
 		 401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2471  Smf/DprA family protein  52.22 
 
 		 371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  37.5 
 
 		 338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  44.97 
 
 		 320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  37.5 
 
 		 338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  37.22 
 
 		 338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  37.22 
 
 		 338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  37.22 
 
 		 338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  36.77 
 
 		 389 aa  201  3e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  41.81 
 
 		 369 aa  199  7e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  37.82 
 
 		 366 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  38.16 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  39.04 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0026  DNA protecting protein DprA  48.8 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0026  DNA protecting protein DprA  38.51 
 
 		 340 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  39.3 
 
 		 374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1931  DNA processing chain A  39.78 
 
 		 381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>