More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2444 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  100 
 
 
389 aa  786    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  47.55 
 
 
358 aa  315  8e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  47.68 
 
 
356 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  45.5 
 
 
359 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  47.55 
 
 
386 aa  295  7e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  43.32 
 
 
359 aa  286  5e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  43.6 
 
 
359 aa  285  7e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  41.58 
 
 
370 aa  281  1e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  43.48 
 
 
364 aa  281  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  42.86 
 
 
371 aa  267  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  41.4 
 
 
361 aa  262  6e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  41.96 
 
 
389 aa  261  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  43.71 
 
 
366 aa  256  7e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  38.54 
 
 
374 aa  253  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  40.82 
 
 
362 aa  252  7e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  43.46 
 
 
374 aa  252  8.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  39.61 
 
 
409 aa  251  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  42.59 
 
 
385 aa  250  3e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  41.42 
 
 
364 aa  250  4e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  42.51 
 
 
366 aa  249  4e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  42.22 
 
 
373 aa  249  6e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  47.99 
 
 
399 aa  241  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  39.73 
 
 
375 aa  240  4e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  41.05 
 
 
365 aa  238  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  41.05 
 
 
365 aa  238  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  40.38 
 
 
372 aa  237  2e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  41.19 
 
 
375 aa  238  2e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  41.46 
 
 
388 aa  236  7e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  39.44 
 
 
373 aa  235  9e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  38.86 
 
 
425 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5115  DNA protecting protein DprA  41.71 
 
 
382 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  40.55 
 
 
399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  42.12 
 
 
379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  41.27 
 
 
365 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  40.84 
 
 
408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  39.44 
 
 
406 aa  233  3e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  39.41 
 
 
369 aa  232  7.000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  40 
 
 
360 aa  232  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  39.47 
 
 
394 aa  231  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  37.16 
 
 
382 aa  231  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  40.92 
 
 
375 aa  230  3e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  38.63 
 
 
360 aa  230  4e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  37.24 
 
 
367 aa  229  7e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0348  DNA protecting protein DprA  42.02 
 
 
379 aa  229  9e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.083083 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  41.38 
 
 
336 aa  228  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  42.7 
 
 
358 aa  227  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  40.37 
 
 
401 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  40.27 
 
 
379 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  40.58 
 
 
368 aa  224  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  38.83 
 
 
385 aa  224  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  38.48 
 
 
448 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0097  DNA protecting protein DprA  42.78 
 
 
387 aa  223  4e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  39.94 
 
 
362 aa  223  4.9999999999999996e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  44.14 
 
 
308 aa  223  6e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  39.68 
 
 
368 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  39.51 
 
 
399 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  38.27 
 
 
368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  43.79 
 
 
296 aa  221  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  38.32 
 
 
377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  36.86 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  38.33 
 
 
421 aa  219  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  40.97 
 
 
386 aa  219  7e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0835  DNA protecting protein DprA  37.28 
 
 
405 aa  219  7.999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  41.62 
 
 
402 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  39.67 
 
 
382 aa  218  1e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  36.19 
 
 
365 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  41.16 
 
 
401 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  38.89 
 
 
422 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  40.05 
 
 
386 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0415  DNA protecting protein DprA  36.44 
 
 
382 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  34.42 
 
 
356 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  37.24 
 
 
364 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  41.96 
 
 
372 aa  213  5.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  40.85 
 
 
434 aa  213  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0412  DNA protecting protein DprA  37.79 
 
 
383 aa  212  7.999999999999999e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  40.85 
 
 
434 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  38.54 
 
 
389 aa  212  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  42.59 
 
 
320 aa  211  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  35.65 
 
 
349 aa  211  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3128  DNA protecting protein DprA  38.75 
 
 
475 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3194  SMF protein  40.61 
 
 
374 aa  210  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  37.33 
 
 
369 aa  210  3e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2244  DNA processing protein DprA, putative  41.14 
 
 
372 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441275  normal  0.282732 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  36.65 
 
 
365 aa  209  5e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3421  DNA protecting protein DprA  37.93 
 
 
429 aa  209  6e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.143035  normal  0.697351 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  41.64 
 
 
331 aa  209  6e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1759  DNA protecting protein DprA  37.6 
 
 
383 aa  209  7e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.582182  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2514  DNA processing protein DprA, putative  38.5 
 
 
475 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  38.7 
 
 
387 aa  209  7e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3916  DNA protecting protein DprA  39.94 
 
 
378 aa  209  7e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  40.66 
 
 
422 aa  209  8e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3862  DNA processing protein DprA, putative  37.86 
 
 
409 aa  209  9e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0314  DNA protecting protein DprA  39.52 
 
 
392 aa  208  1e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  38.86 
 
 
364 aa  207  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0602  DNA processing protein DprA, putative  39.15 
 
 
393 aa  208  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  36.31 
 
 
372 aa  207  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  42.18 
 
 
369 aa  207  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  31.72 
 
 
369 aa  206  4e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1610  DNA protecting protein DprA  34.66 
 
 
370 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2285  DNA processing protein DprA, putative  41.1 
 
 
372 aa  206  5e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>