More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3638 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3315  DNA protecting protein DprA  97.98 
 
 		 397 aa  737    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451996  normal  0.725027 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3638  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 397 aa  774    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3515  DNA protecting protein DprA  87.66 
 
 		 397 aa  646    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.567424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0474  DNA protecting protein DprA  70.47 
 
 		 403 aa  512  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652717  normal  0.262413 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3313  DNA protecting protein DprA  67.42 
 
 		 391 aa  475  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4345  DNA protecting protein DprA  67.18 
 
 		 391 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.61785 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2244  DNA processing protein DprA, putative  52.64 
 
 		 372 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441275  normal  0.282732 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2010  SMF protein  52.66 
 
 		 372 aa  371  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.272582 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3531  DNA protecting protein DprA  52.72 
 
 		 378 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3031  DNA processing protein DprA, putative  51.76 
 
 		 422 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.461494  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2285  DNA processing protein DprA, putative  51.25 
 
 		 372 aa  361  1e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4729  DNA processing chain A (DprA/Smf)  53.42 
 
 		 372 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0933  DNA protecting protein DprA  49.75 
 
 		 383 aa  355  8.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339365  normal  0.657052 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2421  DNA processing protein DprA, putative  51.89 
 
 		 378 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3916  DNA protecting protein DprA  54.2 
 
 		 378 aa  352  7e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3421  DNA protecting protein DprA  48.46 
 
 		 429 aa  352  7e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.143035  normal  0.697351 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3669  DNA protecting protein DprA  51.51 
 
 		 388 aa  348  8e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215267  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0602  DNA processing protein DprA, putative  51.12 
 
 		 393 aa  347  2e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3857  DNA protecting protein DprA  50.48 
 
 		 422 aa  345  6e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0567  SMF protein  50.87 
 
 		 393 aa  344  2e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1759  DNA protecting protein DprA  47.85 
 
 		 383 aa  337  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.582182  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1388  DNA protecting protein DprA  52.15 
 
 		 380 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0842  DNA protecting protein DprA  46.19 
 
 		 396 aa  333  3e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0234041  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1296  DNA protecting protein DprA  51.65 
 
 		 380 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.857359  decreased coverage  0.000779051 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1356  DNA protecting protein DprA  49.62 
 
 		 378 aa  315  9e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  47.46 
 
 		 372 aa  306  5.0000000000000004e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  45.93 
 
 		 387 aa  283  3.0000000000000004e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3194  SMF protein  45.91 
 
 		 374 aa  281  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1508  DNA protecting protein DprA  47.21 
 
 		 366 aa  281  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.300262 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0730  DNA protecting protein DprA  48.6 
 
 		 373 aa  266  5e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3825  DNA protecting protein DprA  49.36 
 
 		 592 aa  263  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188675  normal  0.0366246 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1209  DNA processing protein DprA, putative  45.43 
 
 		 360 aa  263  4e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  43.48 
 
 		 375 aa  257  3e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  35.26 
 
 		 374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0883  putative DNA processing protein DprA  35.52 
 
 		 375 aa  247  2e-64  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.430936  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3158  DNA processing protein DprA, putative  44.03 
 
 		 402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2317  DNA protecting protein DprA  53.5 
 
 		 369 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2338  DNA processing protein DprA, putative  40.51 
 
 		 382 aa  241  2e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0849  DNA protecting protein DprA  46.48 
 
 		 372 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1138  DNA protecting protein DprA  41.19 
 
 		 379 aa  235  9e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.823359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2177  hypothetical protein  46.12 
 
 		 372 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.809736  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  40.68 
 
 		 364 aa  229  6e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0388  putative DNA processing protein DprA  36.29 
 
 		 378 aa  224  1e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4323  DNA protecting protein DprA  43.36 
 
 		 418 aa  225  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1644  DNA protecting protein DprA  42.6 
 
 		 395 aa  224  3e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.263138 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  40.1 
 
 		 365 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  40.85 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0092  DNA processing chain A  36.36 
 
 		 362 aa  213  3.9999999999999995e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  39.84 
 
 		 394 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  39.06 
 
 		 365 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  41.13 
 
 		 386 aa  208  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  34.59 
 
 		 399 aa  207  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  38.9 
 
 		 366 aa  207  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0021  SMF protein  40.67 
 
 		 372 aa  206  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  39.27 
 
 		 365 aa  204  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  39.27 
 
 		 365 aa  204  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  39.43 
 
 		 379 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  40.42 
 
 		 368 aa  204  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  38.64 
 
 		 359 aa  203  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  38.72 
 
 		 366 aa  203  5e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  38.04 
 
 		 364 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  38.07 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  36.39 
 
 		 371 aa  199  7.999999999999999e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0069  DNA protecting protein DprA  38.54 
 
 		 365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0131518  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  37.32 
 
 		 408 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  36.32 
 
 		 369 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  40.38 
 
 		 385 aa  197  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  37.59 
 
 		 369 aa  197  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  33.16 
 
 		 370 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  38.58 
 
 		 372 aa  195  9e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  44.17 
 
 		 358 aa  195  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0022  DNA-processing protein smf chain A  41.99 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638184  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  36.22 
 
 		 369 aa  194  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  36.68 
 
 		 377 aa  194  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0097  DNA protecting protein DprA  38.9 
 
 		 387 aa  194  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  40.21 
 
 		 362 aa  194  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  39.58 
 
 		 375 aa  194  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  38.78 
 
 		 365 aa  194  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  40.52 
 
 		 379 aa  193  4e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  42.09 
 
 		 399 aa  193  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  42.16 
 
 		 365 aa  193  5e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0088  DNA protecting protein DprA  40.5 
 
 		 365 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  hitchhiker  0.00000226151 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  36.03 
 
 		 368 aa  191  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0412  DNA processing chain A  37.3 
 
 		 368 aa  192  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.232612  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  40.76 
 
 		 389 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  36.06 
 
 		 389 aa  191  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  37.37 
 
 		 377 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3602  DNA protecting protein DprA  50 
 
 		 374 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.62233 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  38.5 
 
 		 422 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0440  DNA protecting protein DprA  35.98 
 
 		 377 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.303838  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3709  DNA protecting protein DprA  50 
 
 		 374 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.0813608 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3601  DNA protecting protein DprA  50 
 
 		 374 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000541333  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2471  Smf/DprA family protein  41.2 
 
 		 371 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3772  DNA protecting protein DprA  50 
 
 		 374 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0835  DNA protecting protein DprA  36.99 
 
 		 405 aa  191  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4510  DNA protecting protein DprA  52.53 
 
 		 373 aa  191  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00273954  hitchhiker  0.000201451 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3674  DNA protecting protein DprA  50 
 
 		 374 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1931  DNA processing chain A  37.91 
 
 		 381 aa  190  4e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  42.12 
 
 		 368 aa  190  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  37.82 
 
 		 360 aa  189  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>