More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1701 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  100 
 
 
362 aa  722    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  49.45 
 
 
370 aa  316  3e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  47.35 
 
 
362 aa  313  2.9999999999999996e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  46.31 
 
 
359 aa  299  6e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  43.3 
 
 
366 aa  290  4e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  44.57 
 
 
371 aa  290  4e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  44.2 
 
 
374 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  44.83 
 
 
359 aa  286  4e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  44.57 
 
 
359 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  43.09 
 
 
361 aa  284  2.0000000000000002e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  45.07 
 
 
364 aa  280  3e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  43.34 
 
 
356 aa  278  9e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  43.54 
 
 
364 aa  277  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  41.76 
 
 
358 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  42.34 
 
 
372 aa  267  2e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  42.24 
 
 
365 aa  266  4e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  40.28 
 
 
394 aa  262  8e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  39.83 
 
 
373 aa  260  2e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  38.94 
 
 
406 aa  260  3e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  39.89 
 
 
409 aa  260  3e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  41.16 
 
 
386 aa  256  4e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  38.87 
 
 
373 aa  255  8e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  39.71 
 
 
360 aa  254  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  40.69 
 
 
361 aa  253  4.0000000000000004e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  40.29 
 
 
361 aa  253  4.0000000000000004e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  39.53 
 
 
360 aa  253  5.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  39.78 
 
 
389 aa  252  6e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  40.82 
 
 
389 aa  251  1e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  39 
 
 
369 aa  248  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  39.34 
 
 
366 aa  246  4e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  42.6 
 
 
364 aa  245  9e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  42.12 
 
 
336 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  37.57 
 
 
374 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  44.37 
 
 
320 aa  243  5e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0883  putative DNA processing protein DprA  41.64 
 
 
375 aa  241  2e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.430936  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  39.44 
 
 
362 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  40.16 
 
 
358 aa  239  4e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  42.35 
 
 
374 aa  239  5e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  45.45 
 
 
352 aa  237  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  48.79 
 
 
365 aa  236  3e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  41.44 
 
 
375 aa  236  7e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  43.13 
 
 
363 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  35.98 
 
 
368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  33.88 
 
 
388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  39.5 
 
 
385 aa  232  6e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  35.42 
 
 
369 aa  232  9e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  44.71 
 
 
349 aa  232  1e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  38.1 
 
 
389 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  45.85 
 
 
308 aa  229  4e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  45.85 
 
 
296 aa  229  6e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  37.16 
 
 
364 aa  228  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  35.14 
 
 
395 aa  228  1e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  40.64 
 
 
375 aa  227  2e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  37.13 
 
 
399 aa  227  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0966  DNA protecting protein DprA  40.94 
 
 
442 aa  227  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  42.67 
 
 
386 aa  227  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  36.67 
 
 
368 aa  226  4e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  40.29 
 
 
356 aa  226  7e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  43.68 
 
 
425 aa  225  9e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0357  DNA protecting protein DprA  40.22 
 
 
377 aa  225  9e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0657137  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  40.74 
 
 
399 aa  224  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0771  DNA protecting protein DprA  40.96 
 
 
553 aa  224  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0319665 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  41.55 
 
 
386 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  37.6 
 
 
748 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  36.07 
 
 
365 aa  223  4e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1159  DNA protecting protein DprA  40.64 
 
 
668 aa  223  4e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.20942 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0314  DNA protecting protein DprA  38.87 
 
 
392 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0663  DNA protecting protein DprA  34.53 
 
 
364 aa  223  4.9999999999999996e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.802271  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  33.97 
 
 
379 aa  222  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  41.07 
 
 
337 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  41.16 
 
 
369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  39.86 
 
 
434 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  41.41 
 
 
377 aa  220  3e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  39.86 
 
 
434 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3602  DNA protecting protein DprA  43.21 
 
 
374 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.62233 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3772  DNA protecting protein DprA  41.89 
 
 
374 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  39.12 
 
 
377 aa  219  7e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3601  DNA protecting protein DprA  42.86 
 
 
374 aa  219  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000541333  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3709  DNA protecting protein DprA  42.86 
 
 
374 aa  219  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.0813608 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3674  DNA protecting protein DprA  42.86 
 
 
374 aa  219  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2471  Smf/DprA family protein  53.23 
 
 
371 aa  218  8.999999999999998e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  40.71 
 
 
337 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  43.06 
 
 
369 aa  218  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  35.83 
 
 
379 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0730  DNA protecting protein DprA  36.59 
 
 
373 aa  218  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0415  DNA protecting protein DprA  36.39 
 
 
382 aa  217  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  35.44 
 
 
372 aa  217  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0141  DNA processing protein DprA, putative  39.52 
 
 
396 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  42.96 
 
 
368 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2808  DNA protecting protein DprA  39.52 
 
 
434 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2273  DNA protecting protein DprA  39.52 
 
 
396 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2350  DNA protecting protein DprA  39.52 
 
 
434 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  35.1 
 
 
385 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  49.3 
 
 
421 aa  216  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  34.4 
 
 
401 aa  216  5e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  36.89 
 
 
368 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  35.81 
 
 
365 aa  215  9e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  35.81 
 
 
365 aa  215  9e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  33.69 
 
 
372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0025  DNA protecting protein DprA  41.78 
 
 
379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>