More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0314 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0314  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 392 aa  789    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0383  DNA protecting protein DprA  57.67 
 
 		 381 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.2777  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0412  DNA protecting protein DprA  55.84 
 
 		 383 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  51.77 
 
 		 382 aa  362  7.0000000000000005e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0415  DNA protecting protein DprA  50.13 
 
 		 382 aa  352  8.999999999999999e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1447  SMF protein  49.34 
 
 		 385 aa  332  5e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1766  SMF protein  58.85 
 
 		 286 aa  299  5e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.273008 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  42.12 
 
 		 385 aa  265  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  38.86 
 
 		 370 aa  248  1e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  41.1 
 
 		 359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  40.44 
 
 		 359 aa  239  9e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  40.22 
 
 		 356 aa  238  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  40.44 
 
 		 359 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  39.67 
 
 		 358 aa  233  5e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  40.47 
 
 		 386 aa  229  5e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  38.87 
 
 		 362 aa  228  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  39.51 
 
 		 371 aa  227  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  40.16 
 
 		 361 aa  225  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  42.33 
 
 		 364 aa  225  1e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  38.61 
 
 		 406 aa  222  9e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  40.48 
 
 		 368 aa  222  9.999999999999999e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  37.8 
 
 		 373 aa  216  7e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  39.2 
 
 		 389 aa  216  7e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  38.8 
 
 		 360 aa  216  8e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  39.45 
 
 		 364 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  37.53 
 
 		 373 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  36.31 
 
 		 365 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  38.33 
 
 		 369 aa  213  5.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  40.27 
 
 		 385 aa  212  7.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  36.26 
 
 		 409 aa  212  9e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  35.6 
 
 		 399 aa  211  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  37.94 
 
 		 366 aa  210  4e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  41.52 
 
 		 374 aa  210  4e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0440  DNA protecting protein DprA  36.03 
 
 		 377 aa  208  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.303838  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1444  DNA processing protein  36.83 
 
 		 364 aa  207  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  40.8 
 
 		 366 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  38.67 
 
 		 360 aa  206  6e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  36.48 
 
 		 387 aa  206  6e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  37.87 
 
 		 361 aa  206  7e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  36.58 
 
 		 388 aa  205  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  37.53 
 
 		 372 aa  205  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  38.07 
 
 		 375 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  37.6 
 
 		 361 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  37.71 
 
 		 364 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  41.81 
 
 		 336 aa  203  4e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  36.1 
 
 		 369 aa  203  5e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  43.4 
 
 		 377 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  40.13 
 
 		 331 aa  200  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  37.77 
 
 		 374 aa  200  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  34.69 
 
 		 379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  35.95 
 
 		 362 aa  199  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  37.58 
 
 		 369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  34.9 
 
 		 402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1230  hypothetical protein  35.12 
 
 		 374 aa  197  3e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0232015 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0883  putative DNA processing protein DprA  34.78 
 
 		 375 aa  197  3e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.430936  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0026  DNA protecting protein DprA  41.04 
 
 		 340 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0026  DNA protecting protein DprA  41.3 
 
 		 338 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  37.2 
 
 		 379 aa  196  6e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  36.66 
 
 		 382 aa  196  8.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  39.54 
 
 		 374 aa  195  9e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  39.15 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  40.61 
 
 		 394 aa  195  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  39.09 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  35.03 
 
 		 362 aa  194  3e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  35.87 
 
 		 369 aa  193  4e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  40.58 
 
 		 338 aa  193  6e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  37.03 
 
 		 375 aa  192  7e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  36.26 
 
 		 349 aa  192  7e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  39.87 
 
 		 338 aa  192  7e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  39.94 
 
 		 338 aa  192  8e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  40.26 
 
 		 338 aa  192  9e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  39.94 
 
 		 338 aa  192  9e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2865  DNA processing protein DprA, putative  40 
 
 		 371 aa  191  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0357  DNA protecting protein DprA  34.79 
 
 		 377 aa  191  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0657137  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  36.61 
 
 		 365 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  40.26 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  40.26 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0663  DNA protecting protein DprA  33.96 
 
 		 364 aa  191  2e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.802271  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  36.94 
 
 		 363 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  38.79 
 
 		 352 aa  190  4e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  33.69 
 
 		 375 aa  189  5e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0045  DNA processing protein DprA, putative  39.16 
 
 		 338 aa  189  5e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.064372  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4510  DNA protecting protein DprA  39.46 
 
 		 373 aa  189  7e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00273954  hitchhiker  0.000201451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2383  DNA protecting protein DprA  33.33 
 
 		 370 aa  189  8e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  39.94 
 
 		 338 aa  189  8e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2471  Smf/DprA family protein  37.53 
 
 		 371 aa  189  8e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  36.34 
 
 		 365 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  35.79 
 
 		 366 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  35.83 
 
 		 365 aa  188  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0214  DNA protecting protein DprA  32.63 
 
 		 372 aa  188  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000401852  normal  0.0161041 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  36.89 
 
 		 364 aa  188  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0069  DNA protecting protein DprA  39.87 
 
 		 365 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0131518  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3967  DNA protecting protein DprA  37.87 
 
 		 373 aa  186  5e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  32.43 
 
 		 369 aa  186  6e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  38.57 
 
 		 394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  41.87 
 
 		 377 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0088  DNA protecting protein DprA  40.19 
 
 		 365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  hitchhiker  0.00000226151 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  38.64 
 
 		 368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  31.91 
 
 		 395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  34.3 
 
 		 389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>