More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1766 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1766  SMF protein  100 
 
 		 286 aa  578  1e-164  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.273008 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0412  DNA protecting protein DprA  63.91 
 
 		 383 aa  352  4e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1447  SMF protein  59.31 
 
 		 385 aa  333  2e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0383  DNA protecting protein DprA  59.92 
 
 		 381 aa  308  6.999999999999999e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.2777  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  54.35 
 
 		 382 aa  301  7.000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0314  DNA protecting protein DprA  58.85 
 
 		 392 aa  299  3e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0415  DNA protecting protein DprA  53.73 
 
 		 382 aa  280  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  44.92 
 
 		 385 aa  210  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  42.7 
 
 		 356 aa  204  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  43.21 
 
 		 370 aa  202  7e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  42.75 
 
 		 358 aa  201  8e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  49.12 
 
 		 377 aa  200  3e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  41.3 
 
 		 359 aa  199  6e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  43.37 
 
 		 373 aa  191  1e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  43.48 
 
 		 406 aa  190  2e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  43.01 
 
 		 374 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  47.01 
 
 		 361 aa  190  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0026  DNA protecting protein DprA  47.42 
 
 		 338 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  43.12 
 
 		 373 aa  189  4e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  42.75 
 
 		 359 aa  189  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  45.9 
 
 		 385 aa  188  7e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  43.04 
 
 		 362 aa  188  8e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  42.03 
 
 		 359 aa  188  8e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  44.53 
 
 		 394 aa  187  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0045  DNA processing protein DprA, putative  45.12 
 
 		 338 aa  187  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.064372  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  45.24 
 
 		 364 aa  186  4e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  46.15 
 
 		 368 aa  186  4e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  46.58 
 
 		 386 aa  186  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  45.31 
 
 		 375 aa  185  7e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  46.19 
 
 		 352 aa  185  9e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  43.4 
 
 		 363 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  43.53 
 
 		 366 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  42.7 
 
 		 364 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0966  DNA protecting protein DprA  43.91 
 
 		 442 aa  183  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  46.79 
 
 		 387 aa  183  3e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  44.21 
 
 		 375 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  45.25 
 
 		 365 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  44.86 
 
 		 338 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  44.39 
 
 		 338 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  44.19 
 
 		 362 aa  181  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  42.12 
 
 		 364 aa  181  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  44.44 
 
 		 338 aa  181  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  44.86 
 
 		 338 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  49.55 
 
 		 366 aa  180  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  44.86 
 
 		 338 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  44.44 
 
 		 338 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  44.44 
 
 		 338 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  47.34 
 
 		 360 aa  180  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  43.72 
 
 		 372 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0033  DNA protecting protein DprA  44.93 
 
 		 339 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  42.79 
 
 		 362 aa  180  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  44.39 
 
 		 368 aa  179  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  43.19 
 
 		 331 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  46.26 
 
 		 362 aa  179  4.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  47.39 
 
 		 361 aa  179  7e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  47.39 
 
 		 361 aa  178  8e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  41.07 
 
 		 389 aa  178  8e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  45.41 
 
 		 336 aa  178  9e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  43.04 
 
 		 379 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  42.19 
 
 		 371 aa  177  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  42.17 
 
 		 399 aa  176  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  43.17 
 
 		 337 aa  176  4e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0026  DNA protecting protein DprA  42.99 
 
 		 340 aa  176  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  46.4 
 
 		 360 aa  176  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4510  DNA protecting protein DprA  45.8 
 
 		 373 aa  176  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00273954  hitchhiker  0.000201451 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  47.87 
 
 		 308 aa  175  7e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  43.46 
 
 		 338 aa  175  8e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  42.73 
 
 		 337 aa  175  8e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  42.6 
 
 		 364 aa  174  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  43.66 
 
 		 369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  43.66 
 
 		 369 aa  173  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4323  DNA protecting protein DprA  44.25 
 
 		 418 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  40.15 
 
 		 383 aa  173  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  41.79 
 
 		 358 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  36.48 
 
 		 360 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  46.89 
 
 		 365 aa  172  5.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  47.39 
 
 		 296 aa  172  6.999999999999999e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  44.83 
 
 		 388 aa  172  6.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  42.04 
 
 		 374 aa  171  9e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  38.37 
 
 		 369 aa  171  9e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  45.74 
 
 		 374 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  36.48 
 
 		 360 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  46.19 
 
 		 377 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3066  DNA protecting protein DprA  43.53 
 
 		 422 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  42.92 
 
 		 356 aa  170  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2471  Smf/DprA family protein  46.73 
 
 		 371 aa  170  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0440  DNA protecting protein DprA  44.93 
 
 		 377 aa  171  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.303838  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3128  DNA protecting protein DprA  44.34 
 
 		 475 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  43.1 
 
 		 434 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0357  DNA protecting protein DprA  42.92 
 
 		 377 aa  168  7e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0657137  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3717  DNA protecting protein DprA  43.7 
 
 		 374 aa  169  7e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00862167  decreased coverage  0.00279195 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3183  DNA protecting protein DprA  44.39 
 
 		 422 aa  168  8e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0141  DNA processing protein DprA, putative  43.1 
 
 		 396 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  43.1 
 
 		 434 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0883  putative DNA processing protein DprA  39.37 
 
 		 375 aa  168  1e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.430936  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  47.6 
 
 		 365 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2865  DNA processing protein DprA, putative  45.75 
 
 		 371 aa  168  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  47.6 
 
 		 365 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  40.67 
 
 		 349 aa  168  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2808  DNA protecting protein DprA  43.1 
 
 		 434 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>