More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0383 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0383  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 381 aa  773    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.2777  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0412  DNA protecting protein DprA  57.22 
 
 		 383 aa  425  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0314  DNA protecting protein DprA  57.67 
 
 		 392 aa  396  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  53.85 
 
 		 382 aa  376  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1447  SMF protein  52.86 
 
 		 385 aa  374  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0415  DNA protecting protein DprA  51.22 
 
 		 382 aa  371  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1766  SMF protein  59.92 
 
 		 286 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.273008 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  39.07 
 
 		 385 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  38.57 
 
 		 359 aa  237  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  38.02 
 
 		 358 aa  228  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  37.74 
 
 		 370 aa  227  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  36.99 
 
 		 359 aa  226  6e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  37.26 
 
 		 359 aa  225  9e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  35.52 
 
 		 371 aa  224  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  36.26 
 
 		 356 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  40.27 
 
 		 361 aa  222  9e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  38.4 
 
 		 386 aa  219  5e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  40.36 
 
 		 331 aa  219  5e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  38.44 
 
 		 406 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  36.39 
 
 		 362 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  37.43 
 
 		 364 aa  216  7e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  37.23 
 
 		 409 aa  216  8e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  38.73 
 
 		 385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  39.5 
 
 		 373 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  41.06 
 
 		 364 aa  211  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  36.51 
 
 		 368 aa  209  5e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  38.95 
 
 		 374 aa  209  7e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  37.4 
 
 		 368 aa  208  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  36.31 
 
 		 360 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  34.42 
 
 		 369 aa  207  3e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  38.84 
 
 		 362 aa  206  4e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  37.84 
 
 		 338 aa  206  7e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  37.22 
 
 		 364 aa  205  8e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  37.54 
 
 		 338 aa  205  9e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0026  DNA protecting protein DprA  39.6 
 
 		 338 aa  205  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  36.19 
 
 		 360 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  38.92 
 
 		 338 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  37.54 
 
 		 338 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  38.51 
 
 		 338 aa  203  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  35.47 
 
 		 365 aa  203  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  37.54 
 
 		 338 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  38.51 
 
 		 338 aa  203  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  38.96 
 
 		 362 aa  202  7e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  37 
 
 		 374 aa  202  9.999999999999999e-51  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  41.24 
 
 		 361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0026  DNA protecting protein DprA  38.44 
 
 		 340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  42.21 
 
 		 373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  41.24 
 
 		 361 aa  200  3e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  36.07 
 
 		 388 aa  200  3e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  38.14 
 
 		 338 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  34.15 
 
 		 369 aa  200  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  34.85 
 
 		 379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  41.67 
 
 		 336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1444  DNA processing protein  34.23 
 
 		 364 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  37.2 
 
 		 366 aa  197  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  41.3 
 
 		 352 aa  197  3e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  34.97 
 
 		 399 aa  197  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0214  DNA protecting protein DprA  34.32 
 
 		 372 aa  196  5.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000401852  normal  0.0161041 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  35.95 
 
 		 375 aa  196  7e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0883  putative DNA processing protein DprA  37 
 
 		 375 aa  196  7e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.430936  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  35.19 
 
 		 369 aa  196  8.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  38.97 
 
 		 369 aa  195  9e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  37.47 
 
 		 389 aa  195  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  36.57 
 
 		 364 aa  194  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  35.22 
 
 		 369 aa  194  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  32.37 
 
 		 372 aa  193  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  35.25 
 
 		 382 aa  192  6e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0033  DNA protecting protein DprA  44.27 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  35.99 
 
 		 372 aa  191  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0045  DNA processing protein DprA, putative  39.38 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.064372  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  35.11 
 
 		 402 aa  191  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  34.58 
 
 		 366 aa  190  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0440  DNA protecting protein DprA  37.8 
 
 		 377 aa  190  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.303838  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  35.19 
 
 		 374 aa  189  5e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  39.44 
 
 		 308 aa  188  1e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  35.95 
 
 		 365 aa  188  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  35.95 
 
 		 365 aa  188  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1230  hypothetical protein  33.87 
 
 		 374 aa  187  4e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0232015 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  35.92 
 
 		 365 aa  186  8e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  39.08 
 
 		 296 aa  186  8e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  35.99 
 
 		 365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  37.21 
 
 		 320 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  39.93 
 
 		 369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3734  DNA protecting protein DprA  40.93 
 
 		 339 aa  184  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.242141  hitchhiker  0.0022522 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0357  DNA protecting protein DprA  34.55 
 
 		 377 aa  184  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0657137  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1433  DNA protecting protein DprA  33.33 
 
 		 363 aa  184  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2471  Smf/DprA family protein  39.55 
 
 		 371 aa  183  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  35.97 
 
 		 377 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  35.71 
 
 		 365 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0663  DNA protecting protein DprA  32.44 
 
 		 364 aa  183  5.0000000000000004e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.802271  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  34.15 
 
 		 367 aa  182  6e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  34.97 
 
 		 356 aa  182  7e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  37.83 
 
 		 383 aa  182  9.000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  33.25 
 
 		 395 aa  182  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1610  DNA protecting protein DprA  35.12 
 
 		 370 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  38.94 
 
 		 386 aa  181  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  36.42 
 
 		 358 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  34.43 
 
 		 366 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 386 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4510  DNA protecting protein DprA  35.29 
 
 		 373 aa  180  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00273954  hitchhiker  0.000201451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>