More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2057 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  100 
 
 
374 aa  757    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  46.61 
 
 
370 aa  316  4e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  43.6 
 
 
359 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  44.2 
 
 
362 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  43.6 
 
 
359 aa  286  4e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  41.85 
 
 
359 aa  279  5e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  41.8 
 
 
356 aa  279  6e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  41.78 
 
 
361 aa  279  7e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  42.82 
 
 
409 aa  278  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  42.23 
 
 
366 aa  268  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  39.45 
 
 
358 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  40 
 
 
371 aa  266  5.999999999999999e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  40.64 
 
 
394 aa  265  8.999999999999999e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  42.47 
 
 
386 aa  261  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  38.54 
 
 
389 aa  252  8.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  41.3 
 
 
385 aa  251  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  37.7 
 
 
364 aa  249  7e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  40.94 
 
 
389 aa  248  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  39.07 
 
 
364 aa  247  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  38.89 
 
 
366 aa  246  3e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  42.94 
 
 
363 aa  242  6e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  36.99 
 
 
369 aa  239  8e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  48.06 
 
 
362 aa  237  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  38.46 
 
 
365 aa  235  9e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  37.7 
 
 
360 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  36.84 
 
 
375 aa  230  3e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  36.99 
 
 
364 aa  229  4e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  38.89 
 
 
364 aa  227  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  37.43 
 
 
360 aa  227  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  36.03 
 
 
374 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  43.75 
 
 
406 aa  223  4e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0440  DNA protecting protein DprA  37.74 
 
 
377 aa  222  7e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.303838  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  41.53 
 
 
375 aa  222  8e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  41.07 
 
 
368 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  45.64 
 
 
349 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  39.84 
 
 
358 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  38.04 
 
 
373 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  37.39 
 
 
382 aa  219  5e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03136  hypothetical protein  38.03 
 
 
374 aa  219  7e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.393563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0428  DNA protecting protein DprA  38.03 
 
 
374 aa  219  7e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0428  DNA protecting protein DprA  38.03 
 
 
374 aa  219  7e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0030328  hitchhiker  0.00135165 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3479  DNA protecting protein DprA  38.03 
 
 
374 aa  219  7e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000661668  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03087  hypothetical protein  38.03 
 
 
374 aa  219  7e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3768  DNA protecting protein DprA  38.03 
 
 
374 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00137702  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  39.67 
 
 
352 aa  219  7.999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3581  DNA protecting protein DprA  37.77 
 
 
374 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0315496  normal  0.18869 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  40.71 
 
 
748 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3670  DNA protecting protein DprA  40.6 
 
 
374 aa  218  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.206561  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  37.43 
 
 
382 aa  218  1e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  43.67 
 
 
296 aa  218  1e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  43.67 
 
 
308 aa  218  1e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  36.48 
 
 
367 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1101  DNA protecting protein DprA  43.21 
 
 
294 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00287455  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  35.41 
 
 
385 aa  216  5e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  35.85 
 
 
372 aa  216  5e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4608  DNA protecting protein DprA  37.77 
 
 
374 aa  216  5e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0168836  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  36.72 
 
 
399 aa  216  5e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  38.56 
 
 
369 aa  216  5.9999999999999996e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0157  DNA protecting protein DprA  35.54 
 
 
372 aa  216  7e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.835588  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  38.53 
 
 
337 aa  216  7e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  36.68 
 
 
368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1433  DNA protecting protein DprA  36.78 
 
 
363 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  43.66 
 
 
361 aa  213  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  38.23 
 
 
337 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  35.81 
 
 
401 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  36.53 
 
 
399 aa  213  3.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  38.63 
 
 
369 aa  213  5.999999999999999e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0025  DNA protecting protein DprA  39.13 
 
 
379 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3602  DNA protecting protein DprA  37.4 
 
 
374 aa  212  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.62233 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  39.52 
 
 
425 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  35.9 
 
 
383 aa  211  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0357  DNA protecting protein DprA  37.23 
 
 
377 aa  211  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0657137  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  43.31 
 
 
361 aa  212  1e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3709  DNA protecting protein DprA  37.14 
 
 
374 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.0813608 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3772  DNA protecting protein DprA  37.14 
 
 
374 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3601  DNA protecting protein DprA  37.14 
 
 
374 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000541333  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  35.41 
 
 
386 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3674  DNA protecting protein DprA  37.14 
 
 
374 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  37.36 
 
 
373 aa  211  1e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  43.69 
 
 
365 aa  211  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  37.11 
 
 
336 aa  211  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3717  DNA protecting protein DprA  37.97 
 
 
374 aa  211  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00862167  decreased coverage  0.00279195 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  36.12 
 
 
356 aa  210  3e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2486  DNA protecting protein DprA  45.28 
 
 
291 aa  210  4e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000522014  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  34.55 
 
 
365 aa  209  6e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0383  DNA protecting protein DprA  38.95 
 
 
381 aa  209  6e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.2777  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  34.6 
 
 
388 aa  209  9e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3967  DNA protecting protein DprA  37.04 
 
 
373 aa  208  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  35.73 
 
 
386 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3932  DNA processing Smf protein  43.73 
 
 
289 aa  207  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000528379  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  39.4 
 
 
377 aa  206  4e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3657  DNA protecting protein DprA  44.87 
 
 
289 aa  206  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00245639  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1311  DNA processing Smf protein  43.35 
 
 
289 aa  205  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  40.6 
 
 
399 aa  205  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2083  transcriptional regulator TrmB  36.7 
 
 
337 aa  204  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  35.28 
 
 
360 aa  204  3e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  38.36 
 
 
369 aa  203  4e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2088  DNA protecting protein DprA  36.66 
 
 
384 aa  202  8e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.972888  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  37.2 
 
 
362 aa  202  9e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  36.59 
 
 
369 aa  202  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>