More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0214 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0214  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 372 aa  773    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000401852  normal  0.0161041 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2383  DNA protecting protein DprA  53.97 
 
 		 370 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1444  DNA processing protein  46.72 
 
 		 364 aa  351  1e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1433  DNA protecting protein DprA  41.8 
 
 		 363 aa  301  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6935  DNA protecting protein DprA  40.72 
 
 		 378 aa  293  3e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.482636 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0663  DNA protecting protein DprA  41.55 
 
 		 364 aa  290  3e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.802271  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0295  DNA processing protein DprA, putative  41.6 
 
 		 374 aa  288  2e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.332984 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0995  DNA protecting protein DprA  37.5 
 
 		 366 aa  286  5e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1230  hypothetical protein  40.8 
 
 		 374 aa  280  3e-74  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0232015 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03515  Smf protein DNA processing chain A  37.78 
 
 		 366 aa  259  7e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  36.46 
 
 		 385 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0412  DNA protecting protein DprA  35.22 
 
 		 383 aa  199  7e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  34.86 
 
 		 386 aa  198  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  34.17 
 
 		 358 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0383  DNA protecting protein DprA  34.32 
 
 		 381 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.2777  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  33.15 
 
 		 359 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  34.53 
 
 		 361 aa  192  5e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  34.24 
 
 		 371 aa  192  5e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  36.68 
 
 		 369 aa  192  7e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  35.22 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  34.53 
 
 		 364 aa  191  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  33.24 
 
 		 370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  32.01 
 
 		 402 aa  190  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0415  DNA protecting protein DprA  31.65 
 
 		 382 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  34.79 
 
 		 394 aa  189  5e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  33.33 
 
 		 388 aa  189  7e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  34.79 
 
 		 379 aa  186  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  34 
 
 		 360 aa  186  7e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  32.77 
 
 		 356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  36.55 
 
 		 356 aa  184  3e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  33.15 
 
 		 389 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  33.72 
 
 		 375 aa  182  6e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  32.31 
 
 		 372 aa  182  6e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  30.6 
 
 		 366 aa  182  7e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  34.78 
 
 		 360 aa  182  7e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  30.91 
 
 		 382 aa  182  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  34.06 
 
 		 364 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  33.88 
 
 		 385 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  33.99 
 
 		 337 aa  180  4e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  31.75 
 
 		 359 aa  179  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  30.56 
 
 		 409 aa  179  9e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  31.92 
 
 		 448 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1447  SMF protein  32.55 
 
 		 385 aa  178  1e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  35.45 
 
 		 364 aa  178  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  34.99 
 
 		 367 aa  177  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  31.48 
 
 		 395 aa  177  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  33.66 
 
 		 337 aa  178  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  31.34 
 
 		 364 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  31.51 
 
 		 362 aa  177  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  33.45 
 
 		 349 aa  177  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  32.76 
 
 		 365 aa  177  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  33.61 
 
 		 368 aa  177  4e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  31.77 
 
 		 359 aa  177  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  32.41 
 
 		 382 aa  176  5e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0314  DNA protecting protein DprA  32.63 
 
 		 392 aa  176  6e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  35.48 
 
 		 320 aa  176  6e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  39.34 
 
 		 362 aa  176  7e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  32.94 
 
 		 336 aa  176  8e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1041  DNA protecting protein DprA  34.64 
 
 		 338 aa  176  9e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.367593  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  30.56 
 
 		 372 aa  175  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  30.71 
 
 		 372 aa  172  5.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  30.7 
 
 		 360 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3669  DNA protecting protein DprA  32.72 
 
 		 388 aa  172  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215267  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  33.14 
 
 		 406 aa  171  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  31.3 
 
 		 360 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  32.75 
 
 		 408 aa  170  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0097  DNA protecting protein DprA  32.27 
 
 		 387 aa  170  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3307  DNA protecting protein DprA  31.64 
 
 		 374 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2083  transcriptional regulator TrmB  34.65 
 
 		 337 aa  170  4e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  31.22 
 
 		 401 aa  170  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  31.91 
 
 		 373 aa  170  5e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2345  DNA processing protein DprA, putative  33.61 
 
 		 358 aa  169  5e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  33.24 
 
 		 365 aa  169  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  33.24 
 
 		 365 aa  169  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0835  DNA protecting protein DprA  33.85 
 
 		 405 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  29.8 
 
 		 369 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  32.05 
 
 		 422 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3183  DNA protecting protein DprA  31.38 
 
 		 422 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0883  putative DNA processing protein DprA  31.75 
 
 		 375 aa  167  4e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.430936  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  31.14 
 
 		 373 aa  166  4e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0966  DNA protecting protein DprA  29.68 
 
 		 442 aa  166  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  31.61 
 
 		 375 aa  166  5e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  31.77 
 
 		 368 aa  166  5e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0602  DNA processing protein DprA, putative  32.46 
 
 		 393 aa  166  6.9999999999999995e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  30.56 
 
 		 377 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  32.02 
 
 		 365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  31.13 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  31.88 
 
 		 362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0567  SMF protein  32.2 
 
 		 393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  32.69 
 
 		 366 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  33.52 
 
 		 375 aa  163  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  32.75 
 
 		 434 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3128  DNA protecting protein DprA  31.58 
 
 		 475 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  32.75 
 
 		 434 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  30.89 
 
 		 387 aa  163  5.0000000000000005e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0141  DNA processing protein DprA, putative  32.94 
 
 		 396 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2273  DNA protecting protein DprA  32.94 
 
 		 396 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0771  DNA protecting protein DprA  35.96 
 
 		 553 aa  162  7e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0319665 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1209  DNA processing protein DprA, putative  34.58 
 
 		 360 aa  162  8.000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2514  DNA processing protein DprA, putative  31.58 
 
 		 475 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>