More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0599 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 394 aa  780    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  51.21 
 
 		 366 aa  359  4e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  48.06 
 
 		 375 aa  291  1e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  43.41 
 
 		 364 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  46.41 
 
 		 361 aa  276  3e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  43.25 
 
 		 370 aa  276  5e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  41.19 
 
 		 409 aa  273  5.000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  44.22 
 
 		 406 aa  266  4e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  40.64 
 
 		 374 aa  265  1e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  44.41 
 
 		 356 aa  264  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  43.64 
 
 		 373 aa  263  4e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  40.28 
 
 		 362 aa  262  8.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  43.35 
 
 		 373 aa  262  1e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  45.96 
 
 		 359 aa  261  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  45.96 
 
 		 359 aa  260  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  44.65 
 
 		 386 aa  259  5.0000000000000005e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  41.78 
 
 		 365 aa  258  1e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  43.13 
 
 		 359 aa  256  4e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  43.02 
 
 		 360 aa  255  7e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  43.53 
 
 		 360 aa  253  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  43.48 
 
 		 362 aa  253  5.000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  43.16 
 
 		 371 aa  253  6e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  42.12 
 
 		 385 aa  249  4e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  45.07 
 
 		 364 aa  248  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  42.62 
 
 		 358 aa  247  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  38.08 
 
 		 349 aa  240  4e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  41.29 
 
 		 366 aa  238  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  40.82 
 
 		 382 aa  238  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  42.74 
 
 		 364 aa  233  5e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  41.35 
 
 		 372 aa  233  5e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  40.37 
 
 		 369 aa  232  7.000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  40.52 
 
 		 336 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  41.64 
 
 		 362 aa  232  9e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  40.74 
 
 		 374 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  39.78 
 
 		 389 aa  231  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  46 
 
 		 385 aa  231  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  36.89 
 
 		 369 aa  229  6e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  44.71 
 
 		 320 aa  229  6e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  41.6 
 
 		 365 aa  229  8e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  41.6 
 
 		 365 aa  229  8e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  40.36 
 
 		 364 aa  229  9e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  39.46 
 
 		 389 aa  227  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  41.62 
 
 		 399 aa  227  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0157  DNA protecting protein DprA  37.5 
 
 		 372 aa  225  1e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.835588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2088  DNA protecting protein DprA  41.85 
 
 		 384 aa  224  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.972888  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  37.03 
 
 		 372 aa  222  8e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1041  DNA protecting protein DprA  43.53 
 
 		 338 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.367593  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  39.39 
 
 		 375 aa  221  1.9999999999999999e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  42.78 
 
 		 367 aa  220  3e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  41.7 
 
 		 361 aa  219  6e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  41.7 
 
 		 361 aa  219  7.999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2083  transcriptional regulator TrmB  44.78 
 
 		 337 aa  219  8.999999999999998e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  39.5 
 
 		 374 aa  218  1e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  41.64 
 
 		 389 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  46.78 
 
 		 405 aa  216  4e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5115  DNA protecting protein DprA  45.82 
 
 		 382 aa  216  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  43.91 
 
 		 363 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0638  DNA protecting protein DprA  38.01 
 
 		 375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1610  DNA protecting protein DprA  36.56 
 
 		 370 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  44.67 
 
 		 365 aa  214  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  43.04 
 
 		 399 aa  213  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  37.63 
 
 		 402 aa  213  4.9999999999999996e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0660  DNA protecting protein DprA  37.74 
 
 		 375 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137383  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  39.46 
 
 		 388 aa  213  7e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  45.36 
 
 		 399 aa  212  7.999999999999999e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  39.45 
 
 		 408 aa  212  9e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  41.69 
 
 		 368 aa  212  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  43 
 
 		 377 aa  212  1e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3862  DNA processing protein DprA, putative  37.06 
 
 		 409 aa  212  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0966  DNA protecting protein DprA  44.79 
 
 		 442 aa  210  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  46.78 
 
 		 386 aa  209  5e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  43.73 
 
 		 372 aa  209  7e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2933  DNA protecting protein DprA  40 
 
 		 380 aa  209  7e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.608648  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  45.76 
 
 		 386 aa  209  9e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1101  DNA protecting protein DprA  47.25 
 
 		 294 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00287455  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  39.49 
 
 		 369 aa  208  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  42.99 
 
 		 434 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3673  DNA protecting protein DprA  44.08 
 
 		 366 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.917953  normal  0.236598 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  42.69 
 
 		 434 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1572  DNA protecting protein DprA  40.41 
 
 		 333 aa  207  3e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  40 
 
 		 379 aa  207  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2486  DNA protecting protein DprA  44.49 
 
 		 291 aa  207  4e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000522014  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  50.43 
 
 		 421 aa  206  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  39.94 
 
 		 368 aa  206  6e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  39.02 
 
 		 337 aa  206  6e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  39.51 
 
 		 375 aa  206  6e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  39.1 
 
 		 366 aa  206  7e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0883  putative DNA processing protein DprA  39.53 
 
 		 375 aa  206  8e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.430936  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  39.95 
 
 		 379 aa  205  9e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  41.75 
 
 		 368 aa  205  9e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  50.43 
 
 		 422 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  41.55 
 
 		 358 aa  204  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  40.73 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1159  DNA protecting protein DprA  45.22 
 
 		 668 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.20942 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1305  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  47.71 
 
 		 282 aa  204  2e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.203251  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  39.02 
 
 		 337 aa  204  2e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3158  DNA processing protein DprA, putative  44.95 
 
 		 402 aa  204  3e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  40.33 
 
 		 377 aa  204  3e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  41.78 
 
 		 401 aa  203  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  40.73 
 
 		 296 aa  203  4e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>