More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2933 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2933  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 380 aa  778    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.608648  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  60.26 
 
 		 372 aa  474  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0660  DNA protecting protein DprA  58.84 
 
 		 375 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137383  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0638  DNA protecting protein DprA  58.84 
 
 		 375 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3307  DNA protecting protein DprA  55.94 
 
 		 374 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1610  DNA protecting protein DprA  51.95 
 
 		 370 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  45.62 
 
 		 402 aa  328  1.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  35.31 
 
 		 360 aa  233  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  37.57 
 
 		 364 aa  233  3e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  35.47 
 
 		 409 aa  233  5e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  36.63 
 
 		 359 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  36.8 
 
 		 366 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  36 
 
 		 360 aa  230  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  35.88 
 
 		 406 aa  229  6e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  36.8 
 
 		 373 aa  228  1e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  34.48 
 
 		 371 aa  228  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  38.07 
 
 		 365 aa  226  4e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  35.03 
 
 		 358 aa  224  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  35.29 
 
 		 356 aa  224  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  34.56 
 
 		 373 aa  223  3e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  36.17 
 
 		 370 aa  220  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  34.3 
 
 		 361 aa  220  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  36.51 
 
 		 369 aa  220  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  36.75 
 
 		 394 aa  218  1e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  34.77 
 
 		 359 aa  215  9e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  38.87 
 
 		 336 aa  212  7e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  34.5 
 
 		 359 aa  212  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  33.95 
 
 		 748 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  35.15 
 
 		 365 aa  210  3e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  33.24 
 
 		 368 aa  209  9e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  36.34 
 
 		 372 aa  208  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  36.23 
 
 		 364 aa  207  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  40.26 
 
 		 337 aa  207  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  40.26 
 
 		 337 aa  207  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  35.62 
 
 		 385 aa  207  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  34.57 
 
 		 375 aa  207  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  36.22 
 
 		 385 aa  206  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  36.32 
 
 		 362 aa  206  4e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  34.13 
 
 		 364 aa  206  5e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  35.73 
 
 		 349 aa  206  7e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  35.53 
 
 		 368 aa  206  8e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  34.22 
 
 		 386 aa  205  9e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  35.94 
 
 		 364 aa  205  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  35.11 
 
 		 356 aa  204  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  32.11 
 
 		 362 aa  204  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  34.73 
 
 		 379 aa  203  4e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  31.9 
 
 		 389 aa  203  5e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  36.81 
 
 		 362 aa  203  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  36.24 
 
 		 368 aa  202  8e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  33.25 
 
 		 388 aa  202  9e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  39 
 
 		 361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  32.46 
 
 		 374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  34.2 
 
 		 399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  39 
 
 		 361 aa  201  3e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  38.08 
 
 		 389 aa  201  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  34.99 
 
 		 366 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  35.68 
 
 		 367 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  39.53 
 
 		 320 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  33.33 
 
 		 382 aa  196  5.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  34.46 
 
 		 331 aa  195  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1867  DNA protecting protein DprA  38.56 
 
 		 381 aa  195  1e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  32.22 
 
 		 401 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1931  DNA processing chain A  38.56 
 
 		 381 aa  194  2e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  38.33 
 
 		 365 aa  194  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  34.46 
 
 		 375 aa  194  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  36.67 
 
 		 369 aa  194  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  32.25 
 
 		 399 aa  192  7e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  33.78 
 
 		 375 aa  191  1e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  39.22 
 
 		 377 aa  191  2e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2083  transcriptional regulator TrmB  36.66 
 
 		 337 aa  191  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1444  DNA processing protein  34.13 
 
 		 364 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2471  Smf/DprA family protein  39.12 
 
 		 371 aa  189  5e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0348  DNA protecting protein DprA  34.37 
 
 		 379 aa  189  7e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.083083 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  32.99 
 
 		 387 aa  189  7e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  35.55 
 
 		 374 aa  189  8e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  32.28 
 
 		 369 aa  189  9e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  35.05 
 
 		 421 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0317  DNA protecting protein DprA  32.35 
 
 		 373 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.595486  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  34.3 
 
 		 365 aa  187  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  34.3 
 
 		 365 aa  187  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  34.94 
 
 		 422 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  37.19 
 
 		 352 aa  187  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6935  DNA protecting protein DprA  29.4 
 
 		 378 aa  186  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.482636 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3881  DNA protecting protein DprA  32.08 
 
 		 373 aa  186  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000308128  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  38.11 
 
 		 425 aa  186  7e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  30.79 
 
 		 368 aa  186  8e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  31.81 
 
 		 369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0412  DNA protecting protein DprA  31.96 
 
 		 383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1230  hypothetical protein  32.37 
 
 		 374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0232015 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2088  DNA protecting protein DprA  35.04 
 
 		 384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.972888  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  40 
 
 		 434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0026  DNA protecting protein DprA  32.2 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  32.98 
 
 		 375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1433  DNA protecting protein DprA  34.32 
 
 		 363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  40 
 
 		 434 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  32.9 
 
 		 377 aa  184  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2345  DNA processing protein DprA, putative  33.15 
 
 		 358 aa  183  4.0000000000000006e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  35.17 
 
 		 338 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  34.93 
 
 		 338 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  34.93 
 
 		 338 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>