More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3307 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3307  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 374 aa  761    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0638  DNA protecting protein DprA  69.52 
 
 		 375 aa  522  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0660  DNA protecting protein DprA  69.52 
 
 		 375 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137383  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  59.95 
 
 		 372 aa  457  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2933  DNA protecting protein DprA  55.94 
 
 		 380 aa  438  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.608648  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1610  DNA protecting protein DprA  54.62 
 
 		 370 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  47.34 
 
 		 402 aa  332  8e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  37.53 
 
 		 359 aa  243  5e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  37.84 
 
 		 364 aa  237  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  41.53 
 
 		 336 aa  235  9e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  38.36 
 
 		 360 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  37.27 
 
 		 371 aa  231  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  34.67 
 
 		 358 aa  230  4e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  36.22 
 
 		 356 aa  228  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  36.34 
 
 		 365 aa  226  3e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  34.57 
 
 		 409 aa  226  4e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  39.93 
 
 		 389 aa  226  7e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  35.25 
 
 		 370 aa  224  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  36.49 
 
 		 359 aa  223  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  36.22 
 
 		 359 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  37.63 
 
 		 369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  35.36 
 
 		 382 aa  219  3.9999999999999997e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  41.87 
 
 		 369 aa  219  5e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  37.54 
 
 		 331 aa  219  6e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  36.71 
 
 		 360 aa  219  7.999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  37.91 
 
 		 368 aa  218  2e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  37.67 
 
 		 375 aa  216  4e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  36.6 
 
 		 361 aa  215  8e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  34.77 
 
 		 366 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  35.85 
 
 		 389 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  36.17 
 
 		 374 aa  213  5.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  35.62 
 
 		 388 aa  212  7e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  35.73 
 
 		 372 aa  212  7.999999999999999e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  34.77 
 
 		 406 aa  209  7e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  34.6 
 
 		 356 aa  208  1e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  32.89 
 
 		 362 aa  208  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  35.95 
 
 		 421 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  33.6 
 
 		 373 aa  207  2e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  35.54 
 
 		 422 aa  208  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  35.03 
 
 		 368 aa  207  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  38.64 
 
 		 337 aa  207  3e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  35.52 
 
 		 361 aa  206  6e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  38.31 
 
 		 337 aa  205  1e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  34.41 
 
 		 394 aa  204  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  33.69 
 
 		 373 aa  204  2e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  35.25 
 
 		 361 aa  204  3e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  35.36 
 
 		 401 aa  202  5e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  35.85 
 
 		 362 aa  202  9e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  35.85 
 
 		 369 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  40.89 
 
 		 377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1230  hypothetical protein  34.58 
 
 		 374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0232015 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  37.27 
 
 		 368 aa  200  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0026  DNA protecting protein DprA  37.12 
 
 		 340 aa  200  3e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0348  DNA protecting protein DprA  35.58 
 
 		 379 aa  200  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.083083 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  34.51 
 
 		 386 aa  200  3.9999999999999996e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  38.51 
 
 		 320 aa  199  5e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  36.05 
 
 		 365 aa  199  5e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  36.05 
 
 		 365 aa  199  5e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  34.57 
 
 		 385 aa  199  5e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  36.53 
 
 		 367 aa  199  6e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  39.8 
 
 		 338 aa  199  6e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0440  DNA protecting protein DprA  34.68 
 
 		 377 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.303838  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  35.99 
 
 		 365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  39.46 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  39.46 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  32.44 
 
 		 368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  39.32 
 
 		 338 aa  197  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  35.2 
 
 		 364 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  35.12 
 
 		 434 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0033  DNA protecting protein DprA  38.41 
 
 		 339 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  35.75 
 
 		 375 aa  196  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  35.92 
 
 		 379 aa  196  5.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3734  DNA protecting protein DprA  37.58 
 
 		 339 aa  196  6e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.242141  hitchhiker  0.0022522 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  35.12 
 
 		 434 aa  196  7e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  39.86 
 
 		 338 aa  196  7e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5115  DNA protecting protein DprA  34.45 
 
 		 382 aa  196  8.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  37.3 
 
 		 362 aa  195  9e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  39.86 
 
 		 338 aa  195  9e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  35.39 
 
 		 358 aa  195  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  33.86 
 
 		 399 aa  194  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2083  transcriptional regulator TrmB  41.87 
 
 		 337 aa  195  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  39.52 
 
 		 338 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  39.52 
 
 		 338 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  32.63 
 
 		 748 aa  193  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  33.15 
 
 		 349 aa  193  4e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  34.42 
 
 		 362 aa  193  5e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  34.32 
 
 		 364 aa  193  5e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  36.19 
 
 		 365 aa  192  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  34.3 
 
 		 399 aa  191  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  37.99 
 
 		 352 aa  191  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  34.6 
 
 		 369 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  33.78 
 
 		 372 aa  189  5e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0345  SMF family protein  34.85 
 
 		 434 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  29.69 
 
 		 374 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  33.5 
 
 		 387 aa  189  5.999999999999999e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  34.13 
 
 		 385 aa  189  7e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2808  DNA protecting protein DprA  34.4 
 
 		 434 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0141  DNA processing protein DprA, putative  34.4 
 
 		 396 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2350  DNA protecting protein DprA  34.4 
 
 		 434 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3128  DNA protecting protein DprA  32.41 
 
 		 475 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>