More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0180 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 382 aa  769    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  42.21 
 
 		 359 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  42.22 
 
 		 359 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  41.67 
 
 		 359 aa  249  4e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  41.48 
 
 		 371 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  40.22 
 
 		 356 aa  242  9e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  37.24 
 
 		 409 aa  239  5e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  42.26 
 
 		 375 aa  239  8e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  40.82 
 
 		 394 aa  238  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  39.61 
 
 		 366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  37.6 
 
 		 370 aa  233  6e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  39.39 
 
 		 358 aa  229  6e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  42.12 
 
 		 375 aa  228  2e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  40 
 
 		 364 aa  225  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  37.16 
 
 		 389 aa  223  4e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  37.39 
 
 		 374 aa  219  6e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  38.95 
 
 		 361 aa  216  7e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  39.08 
 
 		 406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  38.24 
 
 		 367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  37.39 
 
 		 362 aa  213  2.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  39.74 
 
 		 336 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  36.66 
 
 		 365 aa  211  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  36.39 
 
 		 402 aa  211  2e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  34.93 
 
 		 372 aa  210  4e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  43.69 
 
 		 385 aa  210  4e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1610  DNA protecting protein DprA  35.41 
 
 		 370 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  38.68 
 
 		 388 aa  208  1e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  42.34 
 
 		 373 aa  208  1e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  41.97 
 
 		 373 aa  207  2e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  37.09 
 
 		 361 aa  206  7e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  38.17 
 
 		 364 aa  206  7e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  38.08 
 
 		 366 aa  206  8e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  37.09 
 
 		 361 aa  205  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  36.9 
 
 		 374 aa  205  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  38.16 
 
 		 360 aa  205  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  41.18 
 
 		 379 aa  203  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  40.14 
 
 		 399 aa  203  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  39.09 
 
 		 362 aa  202  6e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  35.75 
 
 		 385 aa  202  6e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  38.66 
 
 		 360 aa  202  7e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3307  DNA protecting protein DprA  34.83 
 
 		 374 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  37.62 
 
 		 408 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  43.48 
 
 		 364 aa  200  3e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  38.86 
 
 		 386 aa  200  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  46.47 
 
 		 389 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  42.86 
 
 		 356 aa  199  7.999999999999999e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  40.37 
 
 		 362 aa  199  9e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  36.39 
 
 		 368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0638  DNA protecting protein DprA  34.54 
 
 		 375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  39.67 
 
 		 377 aa  197  3e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0660  DNA protecting protein DprA  34.54 
 
 		 375 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137383  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  40.44 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0314  DNA protecting protein DprA  40.13 
 
 		 392 aa  194  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  37.05 
 
 		 379 aa  194  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  35.28 
 
 		 365 aa  194  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  36.59 
 
 		 375 aa  193  4e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  36.13 
 
 		 377 aa  193  5e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0663  DNA protecting protein DprA  33.96 
 
 		 364 aa  193  5e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.802271  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0383  DNA protecting protein DprA  35.25 
 
 		 381 aa  192  6e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.2777  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  39.6 
 
 		 320 aa  192  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1356  DNA protecting protein DprA  38 
 
 		 378 aa  192  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  41.95 
 
 		 337 aa  192  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  40 
 
 		 401 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  40 
 
 		 389 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  37.79 
 
 		 296 aa  191  2e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6935  DNA protecting protein DprA  32.05 
 
 		 378 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.482636 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  34.38 
 
 		 395 aa  191  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  39.23 
 
 		 401 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  41.95 
 
 		 337 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  36.59 
 
 		 399 aa  190  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0021  SMF protein  39.87 
 
 		 372 aa  190  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  37.46 
 
 		 308 aa  190  4e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  36.79 
 
 		 349 aa  189  5e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  41.74 
 
 		 363 aa  189  5e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  37.04 
 
 		 364 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1931  DNA processing chain A  35.69 
 
 		 381 aa  189  5.999999999999999e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  43.72 
 
 		 421 aa  189  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1867  DNA protecting protein DprA  35.69 
 
 		 381 aa  189  7e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  38.56 
 
 		 399 aa  188  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  44.59 
 
 		 422 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  34.03 
 
 		 369 aa  188  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  40 
 
 		 402 aa  188  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  45.78 
 
 		 434 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2083  transcriptional regulator TrmB  36.49 
 
 		 337 aa  187  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  40.74 
 
 		 448 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0348  DNA protecting protein DprA  37.11 
 
 		 379 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.083083 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1209  DNA processing protein DprA, putative  39.86 
 
 		 360 aa  188  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0412  DNA protecting protein DprA  33.33 
 
 		 383 aa  187  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  45.78 
 
 		 434 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0602  DNA processing protein DprA, putative  47.62 
 
 		 393 aa  187  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2350  DNA protecting protein DprA  45.78 
 
 		 434 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0127  DNA processing protein DprA, putative  45.33 
 
 		 433 aa  187  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2808  DNA protecting protein DprA  45.78 
 
 		 434 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  37.58 
 
 		 365 aa  187  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0141  DNA processing protein DprA, putative  45.78 
 
 		 396 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0345  SMF family protein  45.78 
 
 		 434 aa  187  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1041  DNA protecting protein DprA  36.62 
 
 		 338 aa  186  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.367593  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2273  DNA protecting protein DprA  45.78 
 
 		 396 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0097  DNA protecting protein DprA  41.11 
 
 		 387 aa  186  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  38.31 
 
 		 365 aa  186  6e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>