More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1985 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 385 aa  750    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0415  DNA protecting protein DprA  41.02 
 
 		 382 aa  277  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  45.58 
 
 		 359 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  42.62 
 
 		 406 aa  268  1e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  45.3 
 
 		 359 aa  264  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  46.29 
 
 		 358 aa  263  4e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  46.46 
 
 		 362 aa  262  8e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  44.51 
 
 		 360 aa  260  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  43.11 
 
 		 366 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0412  DNA protecting protein DprA  41.55 
 
 		 383 aa  261  2e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  41.78 
 
 		 373 aa  259  4e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  44.73 
 
 		 359 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  47.29 
 
 		 356 aa  257  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  41.93 
 
 		 373 aa  256  6e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  41.46 
 
 		 382 aa  255  9e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  43.05 
 
 		 361 aa  254  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  43.56 
 
 		 371 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  43.78 
 
 		 374 aa  253  5.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  45.61 
 
 		 360 aa  252  7e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  43.92 
 
 		 368 aa  251  1e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  42.32 
 
 		 389 aa  251  1e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1447  SMF protein  40.21 
 
 		 385 aa  251  2e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2383  DNA protecting protein DprA  42.02 
 
 		 370 aa  251  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0314  DNA protecting protein DprA  42.32 
 
 		 392 aa  250  4e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  44.26 
 
 		 364 aa  248  1e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0383  DNA protecting protein DprA  39.62 
 
 		 381 aa  248  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.2777  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  43.87 
 
 		 379 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  42.11 
 
 		 372 aa  247  3e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  44.26 
 
 		 364 aa  246  6e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  43.96 
 
 		 386 aa  245  9e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  37.09 
 
 		 370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  38.24 
 
 		 409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1610  DNA protecting protein DprA  41.99 
 
 		 370 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  44.38 
 
 		 365 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  44.38 
 
 		 365 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  40.87 
 
 		 365 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  42.7 
 
 		 375 aa  241  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  42.86 
 
 		 401 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  42.55 
 
 		 366 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  40.75 
 
 		 385 aa  240  2.9999999999999997e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  42.78 
 
 		 369 aa  239  5e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  42.82 
 
 		 408 aa  238  9e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  39.26 
 
 		 364 aa  237  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  45.3 
 
 		 358 aa  237  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1433  DNA protecting protein DprA  37.99 
 
 		 363 aa  235  9e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  41.86 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  43.01 
 
 		 402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  41.28 
 
 		 364 aa  232  9e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  45.89 
 
 		 394 aa  232  9e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  37.25 
 
 		 349 aa  232  1e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  39.79 
 
 		 399 aa  231  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  42.47 
 
 		 365 aa  231  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  40.17 
 
 		 361 aa  230  3e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1444  DNA processing protein  37.75 
 
 		 364 aa  230  3e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  38.74 
 
 		 375 aa  230  4e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  45.33 
 
 		 365 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  39.89 
 
 		 361 aa  229  7e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  42.3 
 
 		 388 aa  228  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  45.18 
 
 		 320 aa  228  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  43.71 
 
 		 336 aa  227  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  42.52 
 
 		 401 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  44.48 
 
 		 368 aa  226  4e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  40.31 
 
 		 402 aa  226  4e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  41.5 
 
 		 399 aa  226  5.0000000000000005e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  44.99 
 
 		 375 aa  226  7e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  41.3 
 
 		 389 aa  226  7e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  35.77 
 
 		 369 aa  225  1e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  44.38 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  38.39 
 
 		 448 aa  223  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  39.19 
 
 		 369 aa  223  6e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  35.95 
 
 		 372 aa  222  8e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0214  DNA protecting protein DprA  36.46 
 
 		 372 aa  221  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000401852  normal  0.0161041 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  38.63 
 
 		 421 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  38.5 
 
 		 422 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3128  DNA protecting protein DprA  39.25 
 
 		 475 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 386 aa  220  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  35.1 
 
 		 362 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  36.81 
 
 		 362 aa  219  6e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  41.71 
 
 		 379 aa  219  7.999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6935  DNA protecting protein DprA  33.96 
 
 		 378 aa  219  8.999999999999998e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.482636 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  42.41 
 
 		 386 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  43.46 
 
 		 377 aa  217  2e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  35.41 
 
 		 374 aa  217  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2514  DNA processing protein DprA, putative  39 
 
 		 475 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0638  DNA protecting protein DprA  39.63 
 
 		 375 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  39.67 
 
 		 369 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  46.1 
 
 		 308 aa  217  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2083  transcriptional regulator TrmB  40.86 
 
 		 337 aa  217  2.9999999999999998e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  46.1 
 
 		 296 aa  216  4e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  39.02 
 
 		 395 aa  216  4e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1230  hypothetical protein  36.01 
 
 		 374 aa  216  4e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0232015 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3066  DNA protecting protein DprA  38.94 
 
 		 422 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  35.85 
 
 		 368 aa  216  7e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2345  DNA processing protein DprA, putative  42.15 
 
 		 358 aa  215  9e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  39.31 
 
 		 382 aa  215  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0660  DNA protecting protein DprA  39.63 
 
 		 375 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137383  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  43.51 
 
 		 368 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  41.64 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3567  DNA processing protein DprA, putative  44.09 
 
 		 371 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5115  DNA protecting protein DprA  41.41 
 
 		 382 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>