More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1433 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1433  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 363 aa  745    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6935  DNA protecting protein DprA  49.73 
 
 		 378 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.482636 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2383  DNA protecting protein DprA  46.26 
 
 		 370 aa  337  1.9999999999999998e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0995  DNA protecting protein DprA  46.26 
 
 		 366 aa  335  5e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1444  DNA processing protein  47.22 
 
 		 364 aa  318  9e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0663  DNA protecting protein DprA  44.72 
 
 		 364 aa  317  2e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.802271  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03515  Smf protein DNA processing chain A  43.8 
 
 		 366 aa  308  1.0000000000000001e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0214  DNA protecting protein DprA  41.8 
 
 		 372 aa  301  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000401852  normal  0.0161041 
 
 
-
 
NC_002950  PG0295  DNA processing protein DprA, putative  43.68 
 
 		 374 aa  298  8e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.332984 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1230  hypothetical protein  44.11 
 
 		 374 aa  292  6e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0232015 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  37.99 
 
 		 385 aa  231  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  35.44 
 
 		 358 aa  225  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  36.01 
 
 		 356 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  36.73 
 
 		 409 aa  217  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  36.78 
 
 		 374 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  37.9 
 
 		 361 aa  211  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  35.28 
 
 		 372 aa  211  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0415  DNA protecting protein DprA  33.7 
 
 		 382 aa  209  5e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  34.54 
 
 		 382 aa  208  1e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  35.83 
 
 		 371 aa  208  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  37.36 
 
 		 362 aa  206  4e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  33.98 
 
 		 370 aa  205  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  35.29 
 
 		 359 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  36.15 
 
 		 394 aa  203  4e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  34.33 
 
 		 389 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  34.53 
 
 		 368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  33.43 
 
 		 362 aa  196  6e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  33.42 
 
 		 364 aa  194  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  34.54 
 
 		 364 aa  193  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0412  DNA protecting protein DprA  34.05 
 
 		 383 aa  193  4e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  38.18 
 
 		 364 aa  192  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  33.24 
 
 		 349 aa  191  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  35.55 
 
 		 337 aa  191  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  35.55 
 
 		 337 aa  191  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  34.47 
 
 		 748 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  32.98 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  34.09 
 
 		 359 aa  189  7e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  32.5 
 
 		 360 aa  189  7e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  34.83 
 
 		 373 aa  189  8e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  32.5 
 
 		 360 aa  189  8e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  34.21 
 
 		 364 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  34.38 
 
 		 359 aa  187  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  33.78 
 
 		 389 aa  187  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  33.7 
 
 		 356 aa  187  3e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  35.29 
 
 		 373 aa  186  5e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  34.55 
 
 		 406 aa  186  6e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  34.69 
 
 		 375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  30.73 
 
 		 395 aa  183  3e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  33.33 
 
 		 365 aa  184  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3862  DNA processing protein DprA, putative  30.48 
 
 		 409 aa  184  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0383  DNA protecting protein DprA  33.33 
 
 		 381 aa  184  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.2777  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  38.52 
 
 		 365 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1447  SMF protein  34.29 
 
 		 385 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  34.68 
 
 		 320 aa  182  7e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  33.33 
 
 		 374 aa  182  7e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  37.39 
 
 		 362 aa  182  8.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  32.53 
 
 		 385 aa  182  9.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  30.41 
 
 		 448 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  32.04 
 
 		 368 aa  182  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  34.01 
 
 		 366 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  33.61 
 
 		 372 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1610  DNA protecting protein DprA  32.97 
 
 		 370 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  32.16 
 
 		 401 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  35.56 
 
 		 358 aa  179  5.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0157  DNA protecting protein DprA  31.71 
 
 		 372 aa  179  5.999999999999999e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.835588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  33.15 
 
 		 365 aa  179  7e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  31.51 
 
 		 375 aa  178  1e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  32.09 
 
 		 360 aa  178  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  32.46 
 
 		 336 aa  178  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  33.71 
 
 		 375 aa  177  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  31 
 
 		 386 aa  176  4e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0097  DNA protecting protein DprA  34.22 
 
 		 387 aa  176  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  30.16 
 
 		 388 aa  176  6e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  33.7 
 
 		 369 aa  176  6e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  31.77 
 
 		 369 aa  176  7e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  31.65 
 
 		 379 aa  175  9e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  33.88 
 
 		 372 aa  175  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  34.72 
 
 		 367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  32.6 
 
 		 365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  30.57 
 
 		 379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  32.6 
 
 		 365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1317  DNA protecting protein DprA  33.24 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  31 
 
 		 386 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0314  DNA protecting protein DprA  31.72 
 
 		 392 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0771  DNA protecting protein DprA  32.22 
 
 		 553 aa  172  9e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0319665 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  36.62 
 
 		 401 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4729  DNA processing chain A (DprA/Smf)  36.06 
 
 		 372 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  36.27 
 
 		 402 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2933  DNA protecting protein DprA  34.32 
 
 		 380 aa  171  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.608648  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3183  DNA protecting protein DprA  30 
 
 		 422 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  30.88 
 
 		 369 aa  171  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3066  DNA protecting protein DprA  35.81 
 
 		 422 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2010  SMF protein  34.84 
 
 		 372 aa  170  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.272582 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1572  DNA protecting protein DprA  38.46 
 
 		 333 aa  170  4e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  29.92 
 
 		 386 aa  169  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  34.8 
 
 		 365 aa  169  6e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2083  transcriptional regulator TrmB  35.23 
 
 		 337 aa  168  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  30.17 
 
 		 422 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3128  DNA protecting protein DprA  29.93 
 
 		 475 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3307  DNA protecting protein DprA  33.97 
 
 		 374 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>