More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1317 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1317  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 330 aa  657    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  43.71 
 
 		 337 aa  248  7e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  43.38 
 
 		 337 aa  246  4e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1572  DNA protecting protein DprA  41.3 
 
 		 333 aa  224  2e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  41.8 
 
 		 356 aa  209  8e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1609  DNA protecting protein DprA  52.88 
 
 		 264 aa  204  2e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.709828  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  39.59 
 
 		 375 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  39.32 
 
 		 360 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  39.94 
 
 		 374 aa  189  4e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  39.32 
 
 		 360 aa  189  5e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0966  DNA protecting protein DprA  41.51 
 
 		 442 aa  188  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  38.79 
 
 		 349 aa  188  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  35.01 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  39.53 
 
 		 359 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  42.45 
 
 		 362 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  36.55 
 
 		 352 aa  186  4e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1020  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  44.26 
 
 		 295 aa  186  4e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.274867  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  39.67 
 
 		 365 aa  186  5e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  38.1 
 
 		 364 aa  186  5e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  36.94 
 
 		 370 aa  185  7e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  33.73 
 
 		 356 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  39.07 
 
 		 363 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  35.58 
 
 		 367 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  36.88 
 
 		 358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  33.43 
 
 		 372 aa  184  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04053  DNA protecting protein DprA  35.02 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  38.21 
 
 		 385 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1348  DNA protecting protein DprA  37.16 
 
 		 361 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0122196  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  35.92 
 
 		 379 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  34.1 
 
 		 394 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  38.18 
 
 		 359 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  39.16 
 
 		 359 aa  179  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  34.8 
 
 		 366 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  36.49 
 
 		 377 aa  179  8e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  38.72 
 
 		 377 aa  179  8e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  37.63 
 
 		 365 aa  178  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  34.52 
 
 		 366 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  37.5 
 
 		 364 aa  178  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0638  DNA protecting protein DprA  41.38 
 
 		 375 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  36.39 
 
 		 369 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0660  DNA protecting protein DprA  41.38 
 
 		 375 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137383  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  42.11 
 
 		 362 aa  177  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  35.21 
 
 		 338 aa  177  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  36.82 
 
 		 372 aa  176  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0033  DNA protecting protein DprA  41.28 
 
 		 339 aa  177  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  33.64 
 
 		 425 aa  176  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 386 aa  175  8e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  37.38 
 
 		 364 aa  175  8e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  37.93 
 
 		 372 aa  175  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  35.5 
 
 		 361 aa  175  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  35.71 
 
 		 365 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  35.21 
 
 		 338 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3673  DNA protecting protein DprA  36.31 
 
 		 366 aa  174  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.917953  normal  0.236598 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1433  DNA protecting protein DprA  33.24 
 
 		 363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  33.22 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  35.95 
 
 		 366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  35.21 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  35.29 
 
 		 331 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  35.21 
 
 		 338 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1444  DNA processing protein  38.11 
 
 		 364 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2865  DNA processing protein DprA, putative  36.5 
 
 		 371 aa  173  5e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0771  DNA protecting protein DprA  39.11 
 
 		 553 aa  173  5e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0319665 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  36.36 
 
 		 369 aa  172  6.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  36.84 
 
 		 364 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1867  DNA protecting protein DprA  33.67 
 
 		 381 aa  172  7.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  38.16 
 
 		 382 aa  171  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3734  DNA protecting protein DprA  43.88 
 
 		 339 aa  171  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.242141  hitchhiker  0.0022522 
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  36.36 
 
 		 406 aa  170  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1931  DNA processing chain A  33.67 
 
 		 381 aa  171  2e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  35.12 
 
 		 360 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  36.77 
 
 		 366 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0026  DNA protecting protein DprA  35.92 
 
 		 340 aa  170  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  33.11 
 
 		 375 aa  170  3e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  34.92 
 
 		 386 aa  170  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1159  DNA protecting protein DprA  39.04 
 
 		 668 aa  170  4e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.20942 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3825  DNA protecting protein DprA  41.08 
 
 		 592 aa  169  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188675  normal  0.0366246 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  34.19 
 
 		 371 aa  169  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4323  DNA protecting protein DprA  45.13 
 
 		 418 aa  169  5e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  32.07 
 
 		 401 aa  169  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  36.27 
 
 		 402 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2419  DNA protecting protein DprA  42 
 
 		 426 aa  169  6e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1994  DNA protecting protein DprA  43.61 
 
 		 293 aa  169  7e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0025  DNA protecting protein DprA  31.96 
 
 		 379 aa  168  9e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  34.16 
 
 		 394 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  36.79 
 
 		 368 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  36.95 
 
 		 373 aa  168  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  32.62 
 
 		 336 aa  168  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3657  DNA protecting protein DprA  42.28 
 
 		 289 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00245639  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  33.57 
 
 		 366 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  35.35 
 
 		 374 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  33.45 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0157  DNA protecting protein DprA  35.34 
 
 		 372 aa  167  2e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.835588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  33.79 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0915  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  43.28 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483862 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2486  DNA protecting protein DprA  41.45 
 
 		 291 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000522014  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  32.56 
 
 		 368 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  34.59 
 
 		 362 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0345  SMF family protein  35.63 
 
 		 434 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3932  DNA processing Smf protein  40.24 
 
 		 289 aa  166  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000528379  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0045  DNA processing protein DprA, putative  35.09 
 
 		 338 aa  166  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.064372  normal  0.147365 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>