More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1348 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_1348  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 361 aa  706    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0122196  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  38.68 
 
 		 356 aa  211  1e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  41.05 
 
 		 337 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  41.05 
 
 		 337 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  41.36 
 
 		 364 aa  195  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  43.21 
 
 		 366 aa  194  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  40.27 
 
 		 366 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  41.22 
 
 		 371 aa  193  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  42.76 
 
 		 375 aa  190  4e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  41 
 
 		 359 aa  189  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  41.24 
 
 		 361 aa  182  7e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1317  DNA protecting protein DprA  37.16 
 
 		 330 aa  182  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  40.88 
 
 		 365 aa  179  7e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  40.84 
 
 		 365 aa  179  7e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  36.18 
 
 		 362 aa  179  8e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  37.25 
 
 		 359 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1396  DNA processing protein DprA, putative  40.92 
 
 		 368 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.649924  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  47.42 
 
 		 356 aa  177  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  47.66 
 
 		 358 aa  176  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  41.67 
 
 		 394 aa  176  5e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2083  transcriptional regulator TrmB  39.22 
 
 		 337 aa  176  8e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  38.21 
 
 		 359 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  32.55 
 
 		 382 aa  173  5e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  37.72 
 
 		 364 aa  172  9e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  41.55 
 
 		 377 aa  171  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  36.18 
 
 		 370 aa  172  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  36.64 
 
 		 349 aa  168  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  34.45 
 
 		 369 aa  167  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1041  DNA protecting protein DprA  38.1 
 
 		 338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.367593  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  36.81 
 
 		 360 aa  166  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  33.89 
 
 		 364 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3673  DNA protecting protein DprA  41.55 
 
 		 366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.917953  normal  0.236598 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  36.91 
 
 		 374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  35.37 
 
 		 369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  45.85 
 
 		 401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  37.89 
 
 		 366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  41.82 
 
 		 365 aa  164  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  42.73 
 
 		 336 aa  164  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  38.7 
 
 		 368 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0671  SMF protein  38.75 
 
 		 394 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  46.27 
 
 		 402 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1766  SMF protein  42.27 
 
 		 286 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.273008 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  46.27 
 
 		 401 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0660  DNA protecting protein DprA  44.67 
 
 		 375 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137383  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0638  DNA protecting protein DprA  44.67 
 
 		 375 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  36.71 
 
 		 395 aa  162  9e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  40.27 
 
 		 386 aa  162  9e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  42.79 
 
 		 362 aa  161  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  38.31 
 
 		 748 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  37.04 
 
 		 367 aa  160  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2080  DNA protecting protein DprA  47.96 
 
 		 229 aa  160  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  34.03 
 
 		 368 aa  160  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  39.45 
 
 		 374 aa  160  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  45.96 
 
 		 372 aa  159  5e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  43.66 
 
 		 385 aa  159  7e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  33.53 
 
 		 385 aa  159  9e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  38.19 
 
 		 388 aa  158  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  41.81 
 
 		 372 aa  158  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  45.77 
 
 		 379 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  37.8 
 
 		 362 aa  158  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  34.97 
 
 		 360 aa  158  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1447  SMF protein  31.81 
 
 		 385 aa  158  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  31.48 
 
 		 363 aa  157  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  41.91 
 
 		 389 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  36.18 
 
 		 375 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  35.45 
 
 		 379 aa  158  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2345  DNA processing protein DprA, putative  44.86 
 
 		 358 aa  157  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  35.44 
 
 		 399 aa  157  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  42.79 
 
 		 389 aa  157  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  42.72 
 
 		 331 aa  156  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  34.89 
 
 		 361 aa  156  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3066  DNA protecting protein DprA  46.27 
 
 		 422 aa  156  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0127  DNA processing protein DprA, putative  45.27 
 
 		 433 aa  156  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0966  DNA protecting protein DprA  42.13 
 
 		 442 aa  156  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  37.72 
 
 		 369 aa  156  7e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3128  DNA protecting protein DprA  44.25 
 
 		 475 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  40.43 
 
 		 320 aa  155  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3734  DNA protecting protein DprA  43.16 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.242141  hitchhiker  0.0022522 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  39.51 
 
 		 366 aa  155  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  40.3 
 
 		 362 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  44.71 
 
 		 422 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  45.77 
 
 		 405 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  42.45 
 
 		 389 aa  154  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1020  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  38.46 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.274867  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  45.27 
 
 		 434 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  37.07 
 
 		 369 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09850  DNA protecting protein DprA  39.62 
 
 		 383 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  46.63 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0141  DNA processing protein DprA, putative  46.63 
 
 		 396 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0345  SMF family protein  46.63 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2350  DNA protecting protein DprA  46.63 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2273  DNA protecting protein DprA  46.63 
 
 		 396 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2514  DNA processing protein DprA, putative  43.81 
 
 		 475 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2419  DNA protecting protein DprA  36.32 
 
 		 426 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3183  DNA protecting protein DprA  45.27 
 
 		 422 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2808  DNA protecting protein DprA  46.63 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  37.86 
 
 		 364 aa  153  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  40.89 
 
 		 422 aa  153  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  41.67 
 
 		 448 aa  153  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  43.4 
 
 		 394 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>