More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1396 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1396  DNA processing protein DprA, putative  100 
 
 		 368 aa  691    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.649924  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  41.72 
 
 		 366 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  43.35 
 
 		 360 aa  230  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  46.02 
 
 		 359 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  38.86 
 
 		 370 aa  225  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  43.04 
 
 		 360 aa  225  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  49.82 
 
 		 358 aa  224  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  46.92 
 
 		 371 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  47.47 
 
 		 364 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  46.27 
 
 		 394 aa  219  5e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  43.75 
 
 		 361 aa  219  5e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  44.11 
 
 		 366 aa  218  8.999999999999998e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  38.1 
 
 		 364 aa  216  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  40.82 
 
 		 369 aa  215  8e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  48.6 
 
 		 356 aa  215  9e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  42.03 
 
 		 386 aa  213  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  37.54 
 
 		 373 aa  211  1e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  39.22 
 
 		 374 aa  211  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  40.88 
 
 		 389 aa  207  3e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  43.01 
 
 		 375 aa  206  5e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  44.95 
 
 		 359 aa  205  8e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  44.25 
 
 		 359 aa  206  8e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  37.42 
 
 		 406 aa  205  1e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  40.69 
 
 		 374 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  36.73 
 
 		 372 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  40.57 
 
 		 399 aa  204  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  37.24 
 
 		 361 aa  203  4e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  41.22 
 
 		 336 aa  203  5e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  34.69 
 
 		 409 aa  203  5e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  41.03 
 
 		 331 aa  202  6e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  38.54 
 
 		 361 aa  202  8e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  37.11 
 
 		 382 aa  202  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  36.91 
 
 		 373 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  38.18 
 
 		 362 aa  200  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  43.08 
 
 		 399 aa  200  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  40.9 
 
 		 365 aa  200  3.9999999999999996e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  37.98 
 
 		 362 aa  199  5e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  39.02 
 
 		 368 aa  199  7e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  38.01 
 
 		 337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1348  DNA protecting protein DprA  41.73 
 
 		 361 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0122196  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  38.01 
 
 		 337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  39.65 
 
 		 338 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  39.65 
 
 		 338 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  39.65 
 
 		 338 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0660  DNA protecting protein DprA  38.24 
 
 		 375 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137383  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  48.48 
 
 		 362 aa  196  7e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  41.74 
 
 		 399 aa  195  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  35.73 
 
 		 369 aa  194  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  39.65 
 
 		 296 aa  193  3e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  44.56 
 
 		 388 aa  193  3e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  39.43 
 
 		 375 aa  193  4e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  37.47 
 
 		 369 aa  193  4e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2083  transcriptional regulator TrmB  45.45 
 
 		 337 aa  192  5e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  39.3 
 
 		 308 aa  193  5e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  41.13 
 
 		 365 aa  192  6e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0638  DNA protecting protein DprA  37.96 
 
 		 375 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  43.45 
 
 		 408 aa  192  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5115  DNA protecting protein DprA  44.07 
 
 		 382 aa  192  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  40.2 
 
 		 389 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  42.19 
 
 		 389 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  40.34 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  34.98 
 
 		 364 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  41.91 
 
 		 385 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0026  DNA protecting protein DprA  39.65 
 
 		 340 aa  189  9e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  39.81 
 
 		 366 aa  188  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  36.88 
 
 		 369 aa  188  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  38.69 
 
 		 422 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  39.04 
 
 		 368 aa  186  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  37.9 
 
 		 360 aa  186  4e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 386 aa  186  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3307  DNA protecting protein DprA  36.44 
 
 		 374 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3862  DNA processing protein DprA, putative  38.89 
 
 		 409 aa  186  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  41.47 
 
 		 401 aa  186  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  39.93 
 
 		 338 aa  186  7e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1572  DNA protecting protein DprA  35.5 
 
 		 333 aa  186  7e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2933  DNA protecting protein DprA  35.24 
 
 		 380 aa  186  8e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.608648  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  37.91 
 
 		 365 aa  186  8e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  39.58 
 
 		 338 aa  185  9e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  41.86 
 
 		 364 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  40.34 
 
 		 448 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  39.93 
 
 		 338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  42.95 
 
 		 379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  39.93 
 
 		 338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  40.69 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  43.1 
 
 		 386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  36.61 
 
 		 362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  43.06 
 
 		 368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0966  DNA protecting protein DprA  41.69 
 
 		 442 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  42.38 
 
 		 402 aa  184  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  40.41 
 
 		 372 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  37.1 
 
 		 360 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  39.67 
 
 		 366 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  39.48 
 
 		 421 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  42.41 
 
 		 377 aa  182  6e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1867  DNA protecting protein DprA  42.51 
 
 		 381 aa  182  9.000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0440  DNA protecting protein DprA  39.35 
 
 		 377 aa  182  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.303838  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  35.81 
 
 		 369 aa  181  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2471  Smf/DprA family protein  40.61 
 
 		 371 aa  182  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  41.64 
 
 		 422 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1931  DNA processing chain A  42.51 
 
 		 381 aa  181  2e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>