More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0671 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0671  SMF protein  100 
 
 		 394 aa  773    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0990  DNA protecting protein DprA  50.86 
 
 		 475 aa  341  1e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638055  normal  0.0748697 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3415  DNA protecting protein DprA  53.23 
 
 		 387 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0233  DNA protecting protein DprA  56.96 
 
 		 400 aa  336  5e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1858  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  50.13 
 
 		 396 aa  324  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  hitchhiker  0.00651172 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1548  DNA protecting protein DprA  49.49 
 
 		 391 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.20886 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09850  DNA protecting protein DprA  50.78 
 
 		 383 aa  268  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1158  DNA protecting protein DprA  49.69 
 
 		 408 aa  259  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134749  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1524  DNA protecting protein DprA  44.7 
 
 		 600 aa  259  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  hitchhiker  0.00583447 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3584  DNA processing protein DprA, putative  48.79 
 
 		 446 aa  259  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1409  DNA protecting protein DprA  48.28 
 
 		 395 aa  258  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.79779  normal  0.0660954 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3996  DNA protecting protein DprA  51.25 
 
 		 422 aa  251  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1318  DNA protecting protein DprA  42.03 
 
 		 444 aa  248  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1480  DNA protecting protein DprA  47.91 
 
 		 402 aa  246  4e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173906  normal  0.04573 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2211  DNA protecting protein DprA  50.34 
 
 		 402 aa  240  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000321708 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1177  DNA protecting protein DprA  42.63 
 
 		 402 aa  240  4e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2472  DNA protecting protein DprA  43.44 
 
 		 394 aa  238  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156193  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2097  DNA protecting protein DprA  47.28 
 
 		 374 aa  238  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1209  DNA protecting protein DprA  40.2 
 
 		 452 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3246  DNA protecting protein DprA  45.84 
 
 		 378 aa  234  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.261915  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2511  DNA protecting protein DprA  44.03 
 
 		 386 aa  231  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10090  DNA protecting protein DprA  46.77 
 
 		 428 aa  231  1e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2191  DNA protecting protein DprA  48.24 
 
 		 384 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0946717  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3121  DNA protecting protein DprA  41.59 
 
 		 423 aa  228  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0011897  normal  0.148234 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11160  DNA protecting protein DprA  45.74 
 
 		 371 aa  227  3e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0892181  normal  0.950847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1987  DNA processing protein DprA, putative  43.72 
 
 		 376 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2033  DNA protecting protein DprA  43.72 
 
 		 376 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.677839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4138  DNA protecting protein DprA  46.39 
 
 		 388 aa  226  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1967  DNA protecting protein DprA  43.72 
 
 		 376 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23650  DNA protecting protein DprA  42.89 
 
 		 399 aa  224  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0566962  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2204  transcriptional regulator, TrmB  45.45 
 
 		 379 aa  223  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382652 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2268  DNA protecting protein DprA  51.02 
 
 		 349 aa  216  5e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1000  DNA protecting protein DprA  41.21 
 
 		 395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09260  DNA protecting protein DprA  43.73 
 
 		 424 aa  213  2.9999999999999995e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.180441  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12910  hypothetical protein  43.67 
 
 		 389 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000201466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5401  SMF family protein  49.58 
 
 		 310 aa  209  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.219936  normal  0.277255 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1643  DNA protecting protein DprA  43.79 
 
 		 388 aa  199  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0293529  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  37.08 
 
 		 361 aa  180  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  47.22 
 
 		 358 aa  172  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  34.85 
 
 		 370 aa  168  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  46.12 
 
 		 386 aa  168  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  43.72 
 
 		 356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  44.11 
 
 		 448 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  33.99 
 
 		 364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  41.85 
 
 		 434 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  41.85 
 
 		 434 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1348  DNA protecting protein DprA  38.75 
 
 		 361 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0122196  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  46.96 
 
 		 422 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0026  DNA protecting protein DprA  42.25 
 
 		 338 aa  162  9e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  35.58 
 
 		 365 aa  161  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3128  DNA protecting protein DprA  45.8 
 
 		 475 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0127  DNA processing protein DprA, putative  46.49 
 
 		 433 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  40.3 
 
 		 360 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2080  DNA protecting protein DprA  46.45 
 
 		 229 aa  160  4e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2350  DNA protecting protein DprA  46.49 
 
 		 434 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0345  SMF family protein  46.49 
 
 		 434 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2808  DNA protecting protein DprA  46.49 
 
 		 434 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  36.86 
 
 		 338 aa  159  6e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0141  DNA processing protein DprA, putative  46.49 
 
 		 396 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2273  DNA protecting protein DprA  46.49 
 
 		 396 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  40.08 
 
 		 389 aa  159  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2514  DNA processing protein DprA, putative  45.38 
 
 		 475 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  30.27 
 
 		 360 aa  159  9e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  38.19 
 
 		 382 aa  158  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2383  DNA protecting protein DprA  38.26 
 
 		 370 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  41.94 
 
 		 368 aa  159  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  38.22 
 
 		 362 aa  159  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  40.35 
 
 		 385 aa  158  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  41.94 
 
 		 359 aa  157  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  30.27 
 
 		 360 aa  157  4e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3066  DNA protecting protein DprA  44.54 
 
 		 422 aa  156  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  33.93 
 
 		 389 aa  156  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  36.36 
 
 		 362 aa  155  9e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  34.78 
 
 		 356 aa  155  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  36.91 
 
 		 368 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  35.84 
 
 		 338 aa  155  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  41.2 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3183  DNA protecting protein DprA  43.67 
 
 		 422 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  40.44 
 
 		 371 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  38.05 
 
 		 375 aa  154  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  35.49 
 
 		 338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  35.14 
 
 		 395 aa  154  4e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  36.96 
 
 		 394 aa  154  4e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0637  DNA protecting protein DprA  39.19 
 
 		 514 aa  153  4e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.3144 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  40 
 
 		 421 aa  153  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  43.5 
 
 		 366 aa  153  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  35.49 
 
 		 338 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  41.3 
 
 		 389 aa  152  7e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0045  DNA processing protein DprA, putative  38.31 
 
 		 338 aa  152  8e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.064372  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  34.35 
 
 		 366 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  35.57 
 
 		 338 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  41.56 
 
 		 422 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  38.31 
 
 		 375 aa  152  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  35.91 
 
 		 338 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  40.89 
 
 		 372 aa  151  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1317  DNA protecting protein DprA  40.1 
 
 		 330 aa  151  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  39.86 
 
 		 365 aa  151  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  42.11 
 
 		 367 aa  151  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3673  DNA protecting protein DprA  41.38 
 
 		 366 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.917953  normal  0.236598 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  31.95 
 
 		 374 aa  150  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>