More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1158 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1158  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 408 aa  783    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134749  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3584  DNA processing protein DprA, putative  62.87 
 
 		 446 aa  410  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0671  SMF protein  49.69 
 
 		 394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3415  DNA protecting protein DprA  50 
 
 		 387 aa  269  7e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1318  DNA protecting protein DprA  43.76 
 
 		 444 aa  265  8.999999999999999e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1209  DNA protecting protein DprA  46.02 
 
 		 452 aa  265  8.999999999999999e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0990  DNA protecting protein DprA  48.41 
 
 		 475 aa  262  8.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638055  normal  0.0748697 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3996  DNA protecting protein DprA  48.03 
 
 		 422 aa  260  3e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09850  DNA protecting protein DprA  46.24 
 
 		 383 aa  256  4e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1858  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  48.09 
 
 		 396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  hitchhiker  0.00651172 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1548  DNA protecting protein DprA  45.27 
 
 		 391 aa  250  3e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.20886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1967  DNA protecting protein DprA  46.59 
 
 		 376 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1987  DNA processing protein DprA, putative  46.59 
 
 		 376 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2033  DNA protecting protein DprA  46.59 
 
 		 376 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.677839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4138  DNA protecting protein DprA  43.39 
 
 		 388 aa  243  6e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2204  transcriptional regulator, TrmB  46.42 
 
 		 379 aa  241  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382652 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2268  DNA protecting protein DprA  50.84 
 
 		 349 aa  238  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1524  DNA protecting protein DprA  44.05 
 
 		 600 aa  236  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  hitchhiker  0.00583447 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0233  DNA protecting protein DprA  50.64 
 
 		 400 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1177  DNA protecting protein DprA  45.4 
 
 		 402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2097  DNA protecting protein DprA  47.04 
 
 		 374 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3246  DNA protecting protein DprA  44.68 
 
 		 378 aa  229  8e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.261915  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1409  DNA protecting protein DprA  44.13 
 
 		 395 aa  227  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.79779  normal  0.0660954 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12910  hypothetical protein  46.17 
 
 		 389 aa  226  4e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000201466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2472  DNA protecting protein DprA  47.04 
 
 		 394 aa  226  4e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156193  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2191  DNA protecting protein DprA  48.69 
 
 		 384 aa  226  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0946717  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2211  DNA protecting protein DprA  48.81 
 
 		 402 aa  225  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000321708 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3121  DNA protecting protein DprA  41.51 
 
 		 423 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0011897  normal  0.148234 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1643  DNA protecting protein DprA  44.65 
 
 		 388 aa  216  7e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0293529  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1480  DNA protecting protein DprA  46.57 
 
 		 402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173906  normal  0.04573 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23650  DNA protecting protein DprA  43.05 
 
 		 399 aa  213  7e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0566962  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11160  DNA protecting protein DprA  43.94 
 
 		 371 aa  210  3e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0892181  normal  0.950847 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2511  DNA protecting protein DprA  41.49 
 
 		 386 aa  202  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5401  SMF family protein  47.28 
 
 		 310 aa  188  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.219936  normal  0.277255 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09260  DNA protecting protein DprA  40.46 
 
 		 424 aa  182  8.000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.180441  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1000  DNA protecting protein DprA  36.34 
 
 		 395 aa  178  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10090  DNA protecting protein DprA  45.13 
 
 		 428 aa  171  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  38.44 
 
 		 386 aa  166  9e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  40 
 
 		 394 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  41.36 
 
 		 375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  37.79 
 
 		 366 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  40.3 
 
 		 421 aa  159  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  40.23 
 
 		 422 aa  159  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3825  DNA protecting protein DprA  41.26 
 
 		 592 aa  158  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188675  normal  0.0366246 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0033  DNA protecting protein DprA  40.51 
 
 		 339 aa  157  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0045  DNA processing protein DprA, putative  37.18 
 
 		 338 aa  155  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.064372  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3673  DNA protecting protein DprA  44.49 
 
 		 366 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.917953  normal  0.236598 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  33.56 
 
 		 362 aa  154  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  41.6 
 
 		 389 aa  152  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  38.7 
 
 		 336 aa  151  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  37.93 
 
 		 382 aa  150  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  50.56 
 
 		 361 aa  151  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  45.92 
 
 		 374 aa  150  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  34.23 
 
 		 331 aa  150  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  42.86 
 
 		 389 aa  150  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  39.93 
 
 		 365 aa  149  7e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  34.1 
 
 		 409 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1644  DNA protecting protein DprA  36.66 
 
 		 395 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.263138 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  46.19 
 
 		 434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3183  DNA protecting protein DprA  47 
 
 		 422 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  36.8 
 
 		 370 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2808  DNA protecting protein DprA  46.19 
 
 		 434 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2350  DNA protecting protein DprA  46.19 
 
 		 434 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1209  DNA processing protein DprA, putative  37.07 
 
 		 360 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  46.19 
 
 		 434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3128  DNA protecting protein DprA  46.5 
 
 		 475 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  39.26 
 
 		 405 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3066  DNA protecting protein DprA  47 
 
 		 422 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0141  DNA processing protein DprA, putative  46.19 
 
 		 396 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0345  SMF family protein  46.19 
 
 		 434 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2273  DNA protecting protein DprA  46.19 
 
 		 396 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  38.52 
 
 		 367 aa  147  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0127  DNA processing protein DprA, putative  46.39 
 
 		 433 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2338  DNA processing protein DprA, putative  36.91 
 
 		 382 aa  146  6e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  40.08 
 
 		 366 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  40.36 
 
 		 372 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  40.36 
 
 		 408 aa  146  7.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  43.43 
 
 		 362 aa  145  9e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  46 
 
 		 422 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2514  DNA processing protein DprA, putative  46 
 
 		 475 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0348  DNA protecting protein DprA  45.54 
 
 		 379 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.083083 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  33.67 
 
 		 338 aa  145  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  43.53 
 
 		 387 aa  144  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  37.85 
 
 		 375 aa  144  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  40.23 
 
 		 360 aa  144  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  37.59 
 
 		 377 aa  144  3e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  35.37 
 
 		 364 aa  144  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  32.34 
 
 		 352 aa  144  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  47.8 
 
 		 379 aa  144  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  36.73 
 
 		 369 aa  144  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  40.77 
 
 		 375 aa  143  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  46 
 
 		 448 aa  143  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  40.43 
 
 		 358 aa  143  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  43.62 
 
 		 377 aa  143  5e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4323  DNA protecting protein DprA  42.22 
 
 		 418 aa  143  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1867  DNA protecting protein DprA  34.41 
 
 		 381 aa  142  8e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1931  DNA processing chain A  35.14 
 
 		 381 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  38.81 
 
 		 320 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0637  DNA protecting protein DprA  38.86 
 
 		 514 aa  142  9.999999999999999e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.3144 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  36.45 
 
 		 375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>