More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0233 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0233  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 400 aa  772    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0671  SMF protein  57.03 
 
 		 394 aa  355  1e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1858  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  52.43 
 
 		 396 aa  319  6e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  hitchhiker  0.00651172 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0990  DNA protecting protein DprA  58.63 
 
 		 475 aa  298  1e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638055  normal  0.0748697 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3415  DNA protecting protein DprA  50.39 
 
 		 387 aa  295  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09850  DNA protecting protein DprA  53.42 
 
 		 383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1548  DNA protecting protein DprA  48.59 
 
 		 391 aa  252  9.000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.20886 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1409  DNA protecting protein DprA  48.72 
 
 		 395 aa  231  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.79779  normal  0.0660954 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1209  DNA protecting protein DprA  42.69 
 
 		 452 aa  228  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1158  DNA protecting protein DprA  49.69 
 
 		 408 aa  226  8e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134749  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3996  DNA protecting protein DprA  51.11 
 
 		 422 aa  225  9e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1318  DNA protecting protein DprA  43.5 
 
 		 444 aa  224  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3584  DNA processing protein DprA, putative  47.58 
 
 		 446 aa  215  9e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1987  DNA processing protein DprA, putative  45.01 
 
 		 376 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2033  DNA protecting protein DprA  45.01 
 
 		 376 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.677839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1177  DNA protecting protein DprA  42.71 
 
 		 402 aa  210  4e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1967  DNA protecting protein DprA  45.01 
 
 		 376 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3246  DNA protecting protein DprA  49.36 
 
 		 378 aa  209  5e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.261915  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2191  DNA protecting protein DprA  47.27 
 
 		 384 aa  209  6e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0946717  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2268  DNA protecting protein DprA  43.79 
 
 		 349 aa  209  7e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2097  DNA protecting protein DprA  42.09 
 
 		 374 aa  205  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4138  DNA protecting protein DprA  47.19 
 
 		 388 aa  204  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1524  DNA protecting protein DprA  42.64 
 
 		 600 aa  203  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  hitchhiker  0.00583447 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3121  DNA protecting protein DprA  41.67 
 
 		 423 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0011897  normal  0.148234 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1480  DNA protecting protein DprA  45.17 
 
 		 402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173906  normal  0.04573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2204  transcriptional regulator, TrmB  47.37 
 
 		 379 aa  193  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382652 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11160  DNA protecting protein DprA  41.97 
 
 		 371 aa  187  3e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0892181  normal  0.950847 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1643  DNA protecting protein DprA  43.09 
 
 		 388 aa  186  6e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0293529  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5401  SMF family protein  49.77 
 
 		 310 aa  184  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.219936  normal  0.277255 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2511  DNA protecting protein DprA  44.61 
 
 		 386 aa  184  3e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2472  DNA protecting protein DprA  45.49 
 
 		 394 aa  182  9.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156193  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12910  hypothetical protein  47.7 
 
 		 389 aa  181  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000201466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09260  DNA protecting protein DprA  42.41 
 
 		 424 aa  179  1e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.180441  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2211  DNA protecting protein DprA  44.57 
 
 		 402 aa  177  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000321708 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10090  DNA protecting protein DprA  48.75 
 
 		 428 aa  176  9e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23650  DNA protecting protein DprA  42.72 
 
 		 399 aa  170  5e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0566962  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1000  DNA protecting protein DprA  43.27 
 
 		 395 aa  162  8.000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  40.26 
 
 		 361 aa  161  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  45.5 
 
 		 386 aa  155  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  32.06 
 
 		 362 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  36.15 
 
 		 338 aa  150  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  39.8 
 
 		 394 aa  150  5e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  35.96 
 
 		 338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  42.15 
 
 		 434 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  35.62 
 
 		 338 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  35.62 
 
 		 338 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  44.7 
 
 		 375 aa  147  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  35.55 
 
 		 338 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  35.55 
 
 		 338 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  35.22 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  41.76 
 
 		 434 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  35.55 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0026  DNA protecting protein DprA  35.27 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  45.09 
 
 		 448 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  39.23 
 
 		 389 aa  143  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  45.66 
 
 		 356 aa  143  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  36.51 
 
 		 368 aa  143  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2350  DNA protecting protein DprA  43.84 
 
 		 434 aa  143  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0141  DNA processing protein DprA, putative  43.84 
 
 		 396 aa  143  6e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0345  SMF family protein  43.84 
 
 		 434 aa  143  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2808  DNA protecting protein DprA  43.84 
 
 		 434 aa  143  6e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2273  DNA protecting protein DprA  43.84 
 
 		 396 aa  143  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  33.67 
 
 		 370 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  46.31 
 
 		 422 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1230  hypothetical protein  37.61 
 
 		 374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0232015 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  43.29 
 
 		 360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3128  DNA protecting protein DprA  44.2 
 
 		 475 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  42.47 
 
 		 422 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  39.02 
 
 		 362 aa  140  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  34.49 
 
 		 366 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0127  DNA processing protein DprA, putative  42.92 
 
 		 433 aa  139  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  37.61 
 
 		 382 aa  139  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3066  DNA protecting protein DprA  44.25 
 
 		 422 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2514  DNA processing protein DprA, putative  43.75 
 
 		 475 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  34.72 
 
 		 331 aa  139  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0637  DNA protecting protein DprA  38.05 
 
 		 514 aa  138  1e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.3144 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  46.15 
 
 		 375 aa  138  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  41.1 
 
 		 421 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  43.09 
 
 		 377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  36.18 
 
 		 368 aa  136  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0026  DNA protecting protein DprA  34.13 
 
 		 340 aa  136  5e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  41.56 
 
 		 358 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  41.24 
 
 		 336 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3183  DNA protecting protein DprA  42.92 
 
 		 422 aa  136  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  41.15 
 
 		 364 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  32.87 
 
 		 362 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0357  DNA protecting protein DprA  37.88 
 
 		 377 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0657137  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  44.29 
 
 		 387 aa  135  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  34.43 
 
 		 374 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  43.75 
 
 		 399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  42.94 
 
 		 374 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  40.72 
 
 		 385 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  40.85 
 
 		 372 aa  135  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  37.7 
 
 		 365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  39.64 
 
 		 373 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0033  DNA protecting protein DprA  38.2 
 
 		 339 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3734  DNA protecting protein DprA  34.45 
 
 		 339 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.242141  hitchhiker  0.0022522 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0383  DNA protecting protein DprA  33.13 
 
 		 381 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.2777  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6742  SMF family protein  41.28 
 
 		 302 aa  133  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0382369  normal  0.0640366 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2383  DNA protecting protein DprA  41.15 
 
 		 370 aa  133  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>