More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3246 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3246  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 378 aa  728    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.261915  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0990  DNA protecting protein DprA  49.1 
 
 		 475 aa  296  4e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638055  normal  0.0748697 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2268  DNA protecting protein DprA  57.44 
 
 		 349 aa  285  9e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1858  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  46.95 
 
 		 396 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  hitchhiker  0.00651172 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1548  DNA protecting protein DprA  46.51 
 
 		 391 aa  253  3e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.20886 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3415  DNA protecting protein DprA  45.57 
 
 		 387 aa  250  4e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09850  DNA protecting protein DprA  45.82 
 
 		 383 aa  244  9.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0671  SMF protein  45.84 
 
 		 394 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1409  DNA protecting protein DprA  47.61 
 
 		 395 aa  240  4e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.79779  normal  0.0660954 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2097  DNA protecting protein DprA  47.34 
 
 		 374 aa  231  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4138  DNA protecting protein DprA  46.73 
 
 		 388 aa  228  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3996  DNA protecting protein DprA  44.47 
 
 		 422 aa  228  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1318  DNA protecting protein DprA  43.26 
 
 		 444 aa  227  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1524  DNA protecting protein DprA  47.01 
 
 		 600 aa  227  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  hitchhiker  0.00583447 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1209  DNA protecting protein DprA  43.38 
 
 		 452 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2191  DNA protecting protein DprA  45.6 
 
 		 384 aa  226  6e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0946717  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1967  DNA protecting protein DprA  44.63 
 
 		 376 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1987  DNA processing protein DprA, putative  44.63 
 
 		 376 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2033  DNA protecting protein DprA  44.63 
 
 		 376 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.677839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2204  transcriptional regulator, TrmB  47.85 
 
 		 379 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382652 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3584  DNA processing protein DprA, putative  50 
 
 		 446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1158  DNA protecting protein DprA  44.68 
 
 		 408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134749  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2511  DNA protecting protein DprA  47.81 
 
 		 386 aa  218  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0233  DNA protecting protein DprA  49.36 
 
 		 400 aa  216  8e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2211  DNA protecting protein DprA  46.33 
 
 		 402 aa  215  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000321708 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11160  DNA protecting protein DprA  42.75 
 
 		 371 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0892181  normal  0.950847 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1480  DNA protecting protein DprA  43.43 
 
 		 402 aa  213  5.999999999999999e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173906  normal  0.04573 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2472  DNA protecting protein DprA  45.69 
 
 		 394 aa  209  5e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156193  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10090  DNA protecting protein DprA  45.5 
 
 		 428 aa  206  5e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23650  DNA protecting protein DprA  44.04 
 
 		 399 aa  205  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0566962  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12910  hypothetical protein  45.3 
 
 		 389 aa  204  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000201466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1177  DNA protecting protein DprA  44.76 
 
 		 402 aa  203  5e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5401  SMF family protein  43.28 
 
 		 310 aa  199  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.219936  normal  0.277255 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3121  DNA protecting protein DprA  40.36 
 
 		 423 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0011897  normal  0.148234 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09260  DNA protecting protein DprA  40.5 
 
 		 424 aa  191  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.180441  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  40.91 
 
 		 361 aa  188  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1643  DNA protecting protein DprA  44.16 
 
 		 388 aa  183  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0293529  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1000  DNA protecting protein DprA  44.44 
 
 		 395 aa  177  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  34.81 
 
 		 370 aa  178  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  36.46 
 
 		 389 aa  173  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4789  SMF family protein  50.45 
 
 		 252 aa  170  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.800057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  37.69 
 
 		 367 aa  167  4e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0637  DNA protecting protein DprA  36.76 
 
 		 514 aa  162  1e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.3144 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  28.99 
 
 		 409 aa  158  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  30.4 
 
 		 349 aa  158  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  44.93 
 
 		 377 aa  158  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  33.76 
 
 		 362 aa  155  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  40.27 
 
 		 360 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  45.7 
 
 		 358 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  36.5 
 
 		 389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  42.92 
 
 		 375 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  38.94 
 
 		 364 aa  153  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  35.18 
 
 		 365 aa  153  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  36.22 
 
 		 386 aa  153  5.9999999999999996e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  43.35 
 
 		 366 aa  152  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  36.76 
 
 		 394 aa  151  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  32.6 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  39.45 
 
 		 369 aa  150  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  34.62 
 
 		 368 aa  150  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  39.93 
 
 		 375 aa  150  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  33.44 
 
 		 382 aa  149  8e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  31.18 
 
 		 368 aa  149  9e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1230  hypothetical protein  31.29 
 
 		 374 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0232015 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  32.25 
 
 		 374 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  29.38 
 
 		 364 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  47.34 
 
 		 389 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  41.95 
 
 		 385 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  43.81 
 
 		 362 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  39.79 
 
 		 360 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  41.98 
 
 		 379 aa  147  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  40.34 
 
 		 371 aa  146  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  44.17 
 
 		 356 aa  146  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  47.3 
 
 		 448 aa  146  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  32.54 
 
 		 748 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3128  DNA protecting protein DprA  47.49 
 
 		 475 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  39.92 
 
 		 366 aa  145  9e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  33.33 
 
 		 362 aa  145  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  39.91 
 
 		 331 aa  145  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  52 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  40.78 
 
 		 364 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1317  DNA protecting protein DprA  36.84 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0295  DNA processing protein DprA, putative  33.44 
 
 		 374 aa  144  3e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.332984 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  45.18 
 
 		 379 aa  144  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  38.83 
 
 		 372 aa  144  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2514  DNA processing protein DprA, putative  47.03 
 
 		 475 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  40.77 
 
 		 365 aa  144  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3066  DNA protecting protein DprA  47.75 
 
 		 422 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  28.16 
 
 		 360 aa  142  7e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  35.59 
 
 		 369 aa  142  8e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  40 
 
 		 399 aa  142  8e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3183  DNA protecting protein DprA  46.85 
 
 		 422 aa  142  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0995  DNA protecting protein DprA  30.29 
 
 		 366 aa  142  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1348  DNA protecting protein DprA  41.73 
 
 		 361 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0122196  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  30.45 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0678  putative DNA uptake protein  37.8 
 
 		 514 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  39.17 
 
 		 359 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1447  SMF protein  33.24 
 
 		 385 aa  140  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 373 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  45.66 
 
 		 422 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  42.99 
 
 		 336 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>