More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0678 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0678  putative DNA uptake protein  100 
 
 		 514 aa  1056    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0637  DNA protecting protein DprA  49.07 
 
 		 514 aa  322  7e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.3144 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2511  DNA protecting protein DprA  42.86 
 
 		 386 aa  168  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1548  DNA protecting protein DprA  43.43 
 
 		 391 aa  162  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.20886 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2472  DNA protecting protein DprA  43.64 
 
 		 394 aa  160  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156193  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2211  DNA protecting protein DprA  38.32 
 
 		 402 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000321708 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1177  DNA protecting protein DprA  37.45 
 
 		 402 aa  153  8e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3415  DNA protecting protein DprA  43.33 
 
 		 387 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09260  DNA protecting protein DprA  35.74 
 
 		 424 aa  146  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.180441  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1000  DNA protecting protein DprA  37.8 
 
 		 395 aa  145  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390395  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0990  DNA protecting protein DprA  41.18 
 
 		 475 aa  144  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638055  normal  0.0748697 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  35.34 
 
 		 362 aa  143  9e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1858  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  39.22 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  hitchhiker  0.00651172 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0671  SMF protein  39.83 
 
 		 394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0018  DNA protecting protein DprA  36.47 
 
 		 442 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.256916 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2191  DNA protecting protein DprA  45.85 
 
 		 384 aa  140  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0946717  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1480  DNA protecting protein DprA  38.62 
 
 		 402 aa  139  8.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173906  normal  0.04573 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3246  DNA protecting protein DprA  34.33 
 
 		 378 aa  136  8e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.261915  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  35.82 
 
 		 377 aa  135  9.999999999999999e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  38.97 
 
 		 368 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2268  DNA protecting protein DprA  35.16 
 
 		 349 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  34.87 
 
 		 399 aa  134  5e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  37.55 
 
 		 369 aa  133  6e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0357  DNA protecting protein DprA  32.48 
 
 		 377 aa  133  6.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0657137  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  36.59 
 
 		 389 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  38.27 
 
 		 379 aa  133  7.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3121  DNA protecting protein DprA  39.82 
 
 		 423 aa  133  9e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0011897  normal  0.148234 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  38.31 
 
 		 365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  37.78 
 
 		 365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09850  DNA protecting protein DprA  40.17 
 
 		 383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0412  DNA processing chain A  36.06 
 
 		 368 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.232612  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1209  DNA protecting protein DprA  37.66 
 
 		 452 aa  131  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  33.13 
 
 		 394 aa  131  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  40.74 
 
 		 379 aa  131  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  39.81 
 
 		 372 aa  131  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2383  DNA protecting protein DprA  38.36 
 
 		 370 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  37.33 
 
 		 349 aa  131  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  40 
 
 		 356 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  34.11 
 
 		 352 aa  130  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5401  SMF family protein  36.16 
 
 		 310 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.219936  normal  0.277255 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2097  DNA protecting protein DprA  38.16 
 
 		 374 aa  130  6e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  37.1 
 
 		 370 aa  130  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  39.37 
 
 		 385 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1317  DNA protecting protein DprA  35.34 
 
 		 330 aa  129  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  36.99 
 
 		 374 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  39.23 
 
 		 385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4138  DNA protecting protein DprA  44.09 
 
 		 388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  37.4 
 
 		 365 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  29.57 
 
 		 362 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2471  Smf/DprA family protein  37.76 
 
 		 371 aa  129  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  38.14 
 
 		 364 aa  128  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  36.4 
 
 		 388 aa  127  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1318  DNA protecting protein DprA  38.07 
 
 		 444 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2377  DNA protecting protein DprA  33.78 
 
 		 421 aa  127  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1409  DNA protecting protein DprA  39.3 
 
 		 395 aa  127  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.79779  normal  0.0660954 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  36.91 
 
 		 366 aa  127  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  40.2 
 
 		 402 aa  127  5e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  41.98 
 
 		 366 aa  127  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  33.45 
 
 		 363 aa  126  7e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  37.33 
 
 		 366 aa  126  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2204  transcriptional regulator, TrmB  39.25 
 
 		 379 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382652 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2083  transcriptional regulator TrmB  37.62 
 
 		 337 aa  126  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  36.51 
 
 		 296 aa  126  1e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  42.19 
 
 		 366 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  40 
 
 		 359 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3734  DNA protecting protein DprA  36.73 
 
 		 339 aa  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.242141  hitchhiker  0.0022522 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23650  DNA protecting protein DprA  35.77 
 
 		 399 aa  125  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0566962  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0602  DNA processing protein DprA, putative  38.77 
 
 		 393 aa  124  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  34.29 
 
 		 369 aa  124  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  40.45 
 
 		 362 aa  125  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  35.48 
 
 		 308 aa  125  3e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  37.31 
 
 		 383 aa  124  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10090  DNA protecting protein DprA  42.98 
 
 		 428 aa  124  4e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  36.54 
 
 		 377 aa  124  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  38.25 
 
 		 395 aa  124  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  39.34 
 
 		 366 aa  124  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0915  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  39.11 
 
 		 281 aa  124  4e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483862 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04053  DNA protecting protein DprA  39.63 
 
 		 311 aa  123  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  35.74 
 
 		 368 aa  123  8e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  35.51 
 
 		 382 aa  123  9e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  40 
 
 		 359 aa  123  9e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0317  DNA protecting protein DprA  32.53 
 
 		 373 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.595486  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  35.53 
 
 		 374 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  35.1 
 
 		 331 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3881  DNA protecting protein DprA  32.53 
 
 		 373 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000308128  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  34.29 
 
 		 409 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  35.91 
 
 		 434 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2135  DNA processing protein  32.03 
 
 		 405 aa  122  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.497205 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0345  SMF family protein  35.91 
 
 		 434 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  38.39 
 
 		 358 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3584  DNA processing protein DprA, putative  37.97 
 
 		 446 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  36.44 
 
 		 336 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0141  DNA processing protein DprA, putative  35.91 
 
 		 396 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  35.52 
 
 		 434 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2463  DNA processing protein DprA, putative  33.79 
 
 		 407 aa  121  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.327666 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  35.48 
 
 		 394 aa  121  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1348  DNA protecting protein DprA  40.48 
 
 		 361 aa  121  3e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0122196  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2350  DNA protecting protein DprA  35.91 
 
 		 434 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  36.48 
 
 		 359 aa  121  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2808  DNA protecting protein DprA  35.91 
 
 		 434 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>