More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_09260 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_09260  DNA protecting protein DprA  100 
 
 
424 aa  807    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.180441  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2472  DNA protecting protein DprA  47.9 
 
 
394 aa  308  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156193  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2211  DNA protecting protein DprA  48.65 
 
 
402 aa  306  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000321708 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2511  DNA protecting protein DprA  49.63 
 
 
386 aa  286  5e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23650  DNA protecting protein DprA  46.8 
 
 
399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0566962  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1177  DNA protecting protein DprA  46.32 
 
 
402 aa  266  4e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1480  DNA protecting protein DprA  46.93 
 
 
402 aa  256  4e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173906  normal  0.04573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1858  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  45.72 
 
 
396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  hitchhiker  0.00651172 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1548  DNA protecting protein DprA  44.31 
 
 
391 aa  242  9e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.20886 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0990  DNA protecting protein DprA  44.96 
 
 
475 aa  239  5e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638055  normal  0.0748697 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2097  DNA protecting protein DprA  41.95 
 
 
374 aa  233  6e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2204  transcriptional regulator, TrmB  46.36 
 
 
379 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.382652 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1409  DNA protecting protein DprA  44.71 
 
 
395 aa  223  6e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.79779  normal  0.0660954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1524  DNA protecting protein DprA  43.06 
 
 
600 aa  219  7e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  hitchhiker  0.00583447 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3415  DNA protecting protein DprA  42.26 
 
 
387 aa  216  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0671  SMF protein  43.65 
 
 
394 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3121  DNA protecting protein DprA  38.95 
 
 
423 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0011897  normal  0.148234 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1000  DNA protecting protein DprA  38.36 
 
 
395 aa  211  3e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390395  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1967  DNA protecting protein DprA  46.97 
 
 
376 aa  209  7e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1987  DNA processing protein DprA, putative  46.97 
 
 
376 aa  209  8e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09850  DNA protecting protein DprA  44.74 
 
 
383 aa  209  8e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2033  DNA protecting protein DprA  46.97 
 
 
376 aa  209  8e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.677839  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4138  DNA protecting protein DprA  41.83 
 
 
388 aa  206  9e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10090  DNA protecting protein DprA  43.41 
 
 
428 aa  204  3e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3246  DNA protecting protein DprA  40.88 
 
 
378 aa  193  5e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.261915  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12910  hypothetical protein  45.59 
 
 
389 aa  188  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000201466  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1318  DNA protecting protein DprA  40.67 
 
 
444 aa  188  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1643  DNA protecting protein DprA  38.7 
 
 
388 aa  187  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0293529  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3996  DNA protecting protein DprA  41.74 
 
 
422 aa  186  6e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1209  DNA protecting protein DprA  39.12 
 
 
452 aa  182  8.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2268  DNA protecting protein DprA  38.84 
 
 
349 aa  176  5e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11160  DNA protecting protein DprA  41.26 
 
 
371 aa  174  2.9999999999999996e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0892181  normal  0.950847 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0233  DNA protecting protein DprA  44.13 
 
 
400 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5401  SMF family protein  44.1 
 
 
310 aa  171  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.219936  normal  0.277255 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3584  DNA processing protein DprA, putative  40.64 
 
 
446 aa  170  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1158  DNA protecting protein DprA  40.46 
 
 
408 aa  169  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134749  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2191  DNA protecting protein DprA  40.62 
 
 
384 aa  166  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0946717  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_002950  PG0295  DNA processing protein DprA, putative  36.11 
 
 
374 aa  166  8e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.332984 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0637  DNA protecting protein DprA  37.74 
 
 
514 aa  164  4.0000000000000004e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.3144 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  44.16 
 
 
385 aa  151  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2383  DNA protecting protein DprA  38.04 
 
 
370 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0678  putative DNA uptake protein  37.98 
 
 
514 aa  145  9e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  32.59 
 
 
370 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  43.15 
 
 
360 aa  144  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  35.74 
 
 
377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  40.28 
 
 
434 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  40.08 
 
 
358 aa  139  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1230  hypothetical protein  30.14 
 
 
374 aa  138  2e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0232015 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  40.28 
 
 
434 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0345  SMF family protein  41.38 
 
 
434 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  39.66 
 
 
361 aa  136  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  43.32 
 
 
405 aa  136  6.0000000000000005e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0141  DNA processing protein DprA, putative  41 
 
 
396 aa  136  9e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2273  DNA protecting protein DprA  41 
 
 
396 aa  136  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2350  DNA protecting protein DprA  41 
 
 
434 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1433  DNA protecting protein DprA  30.79 
 
 
363 aa  135  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  30.42 
 
 
372 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2345  DNA processing protein DprA, putative  37.69 
 
 
358 aa  135  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2808  DNA protecting protein DprA  41 
 
 
434 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  35.02 
 
 
389 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6935  DNA protecting protein DprA  29.07 
 
 
378 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.482636 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  38.03 
 
 
372 aa  135  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  45.7 
 
 
365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  37.45 
 
 
373 aa  134  3e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  44 
 
 
408 aa  134  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  33.75 
 
 
349 aa  134  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  33.93 
 
 
364 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  42.73 
 
 
362 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  33.51 
 
 
375 aa  133  5e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  37.58 
 
 
364 aa  133  6e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0127  DNA processing protein DprA, putative  41.25 
 
 
433 aa  133  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  38.57 
 
 
448 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  31.87 
 
 
366 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  35.91 
 
 
386 aa  133  7.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  39.86 
 
 
360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  35.23 
 
 
367 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  28.85 
 
 
364 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1317  DNA protecting protein DprA  30.37 
 
 
330 aa  130  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  35.79 
 
 
336 aa  131  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  38.02 
 
 
375 aa  131  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  40.15 
 
 
422 aa  131  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1447  SMF protein  34.98 
 
 
385 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  31.78 
 
 
368 aa  130  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  34.38 
 
 
402 aa  130  5.0000000000000004e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  40.35 
 
 
421 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  32.91 
 
 
365 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  39.44 
 
 
362 aa  129  8.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0835  DNA protecting protein DprA  41.82 
 
 
405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07040  DNA protecting protein DprA  42.13 
 
 
328 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.688401  normal  0.79238 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  34.48 
 
 
359 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  33.79 
 
 
363 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  41.67 
 
 
356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  40.35 
 
 
389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0663  DNA protecting protein DprA  31.25 
 
 
364 aa  127  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.802271  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  36.41 
 
 
374 aa  127  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  33.82 
 
 
360 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  35.69 
 
 
371 aa  127  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  40.16 
 
 
366 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  32.43 
 
 
409 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0018  DNA protecting protein DprA  36.24 
 
 
442 aa  127  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.256916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>