More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_07040 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_07040  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 328 aa  666    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.688401  normal  0.79238 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1408  DNA protecting protein DprA  57.28 
 
 		 305 aa  314  9.999999999999999e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.313803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10410  DNA protecting protein DprA  52.38 
 
 		 319 aa  301  1e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000307116  unclonable  0.00000000139433 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0702  SMF family protein  40.47 
 
 		 291 aa  194  2e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000212454  unclonable  0.0000000268506 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  43.5 
 
 		 374 aa  168  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  40.08 
 
 		 375 aa  167  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  38.78 
 
 		 359 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  36.36 
 
 		 362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  40.3 
 
 		 368 aa  163  3e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  39.38 
 
 		 337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  37.5 
 
 		 394 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  39.38 
 
 		 337 aa  162  6e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  34.35 
 
 		 366 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  39.8 
 
 		 361 aa  161  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20450  predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein involved in DNA uptake  42.58 
 
 		 231 aa  161  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.549529  normal  0.263835 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  42.86 
 
 		 370 aa  160  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  38.71 
 
 		 365 aa  159  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  37.87 
 
 		 364 aa  159  6e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  43.84 
 
 		 362 aa  159  6e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  46.6 
 
 		 371 aa  159  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  46.46 
 
 		 389 aa  159  8e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  39.12 
 
 		 359 aa  159  9e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  38.87 
 
 		 385 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  39.38 
 
 		 382 aa  156  6e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  40.78 
 
 		 362 aa  155  7e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  40.23 
 
 		 366 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  36.99 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  39.06 
 
 		 359 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0412  DNA protecting protein DprA  35.94 
 
 		 383 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0025  DNA protecting protein DprA  37.21 
 
 		 379 aa  152  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3315  DNA protecting protein DprA  40.76 
 
 		 397 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451996  normal  0.725027 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  41.23 
 
 		 389 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  43.78 
 
 		 399 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  39.91 
 
 		 356 aa  152  8e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3638  DNA protecting protein DprA  40.76 
 
 		 397 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  37.21 
 
 		 360 aa  152  8.999999999999999e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0069  DNA protecting protein DprA  45.85 
 
 		 365 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0131518  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  42.23 
 
 		 374 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  37.45 
 
 		 360 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  41.04 
 
 		 360 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  45.85 
 
 		 365 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  31.56 
 
 		 364 aa  150  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  47.15 
 
 		 364 aa  150  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0022  DNA-processing protein smf chain A  37.88 
 
 		 362 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638184  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  41.18 
 
 		 369 aa  149  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  37.79 
 
 		 358 aa  149  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00230  putative Rossmann fold nucleotide-binding protein  45.71 
 
 		 362 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  35.86 
 
 		 382 aa  149  7e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  41.87 
 
 		 409 aa  149  9e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  35.71 
 
 		 356 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  36.58 
 
 		 366 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  44.88 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0440  DNA protecting protein DprA  41.84 
 
 		 377 aa  147  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.303838  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  38.96 
 
 		 369 aa  147  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3673  DNA protecting protein DprA  38.28 
 
 		 366 aa  147  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.917953  normal  0.236598 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  37.94 
 
 		 361 aa  146  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  37.94 
 
 		 361 aa  146  5e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  44.34 
 
 		 421 aa  146  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  41.13 
 
 		 360 aa  146  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  49.19 
 
 		 385 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  39.92 
 
 		 366 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3515  DNA protecting protein DprA  40 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.567424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3670  DNA protecting protein DprA  36.46 
 
 		 374 aa  145  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.206561  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3768  DNA protecting protein DprA  36.46 
 
 		 374 aa  145  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00137702  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  38.49 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03136  hypothetical protein  36.46 
 
 		 374 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.393563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0428  DNA protecting protein DprA  36.46 
 
 		 374 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03087  hypothetical protein  36.46 
 
 		 374 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0428  DNA protecting protein DprA  36.46 
 
 		 374 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0030328  hitchhiker  0.00135165 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0357  DNA protecting protein DprA  36.61 
 
 		 377 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0657137  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3581  DNA protecting protein DprA  36.11 
 
 		 374 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0315496  normal  0.18869 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3967  DNA protecting protein DprA  35.4 
 
 		 373 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3479  DNA protecting protein DprA  36.46 
 
 		 374 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000661668  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  37.99 
 
 		 358 aa  144  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0088  DNA protecting protein DprA  43.75 
 
 		 365 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  hitchhiker  0.00000226151 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3717  DNA protecting protein DprA  34.73 
 
 		 374 aa  143  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00862167  decreased coverage  0.00279195 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  37.55 
 
 		 375 aa  143  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  36.52 
 
 		 399 aa  143  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3602  DNA protecting protein DprA  35.86 
 
 		 374 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.62233 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4608  DNA protecting protein DprA  41.71 
 
 		 374 aa  142  8e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0168836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3772  DNA protecting protein DprA  35.86 
 
 		 374 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0018  DNA protecting protein DprA  39.9 
 
 		 442 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.256916 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  43.07 
 
 		 308 aa  142  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3709  DNA protecting protein DprA  35.86 
 
 		 374 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.0813608 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  43.13 
 
 		 320 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  44.9 
 
 		 372 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3601  DNA protecting protein DprA  35.86 
 
 		 374 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000541333  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3313  DNA protecting protein DprA  44.06 
 
 		 391 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0474  DNA protecting protein DprA  41.5 
 
 		 403 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652717  normal  0.262413 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0157  DNA protecting protein DprA  38.86 
 
 		 372 aa  141  9.999999999999999e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.835588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  42.92 
 
 		 422 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3674  DNA protecting protein DprA  35.86 
 
 		 374 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  37.87 
 
 		 394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0314  DNA protecting protein DprA  36.86 
 
 		 392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  42.16 
 
 		 365 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  37.6 
 
 		 373 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  31.9 
 
 		 372 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1447  SMF protein  45.45 
 
 		 385 aa  140  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1277  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  41.84 
 
 		 288 aa  140  3e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  37.74 
 
 		 349 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>