More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1277 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1277  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  100 
 
 		 288 aa  589  1e-167  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1020  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  51.9 
 
 		 295 aa  227  2e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.274867  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0778  DNA protecting protein DprA  42.21 
 
 		 291 aa  214  9.999999999999999e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000253647  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  43.98 
 
 		 362 aa  199  3.9999999999999996e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1305  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  41.6 
 
 		 282 aa  196  4.0000000000000005e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.203251  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  44.25 
 
 		 338 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2486  DNA protecting protein DprA  45.87 
 
 		 291 aa  195  6e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000522014  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  43.81 
 
 		 338 aa  195  7e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  43.81 
 
 		 338 aa  195  7e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  43.81 
 
 		 338 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3932  DNA processing Smf protein  42.98 
 
 		 289 aa  193  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000528379  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3593  SMF family nucleotide-binding protein  42.13 
 
 		 289 aa  192  7e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.46698  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0026  DNA protecting protein DprA  44.69 
 
 		 340 aa  191  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1311  DNA processing Smf protein  42.55 
 
 		 289 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3881  DNA processing Smf protein  42.55 
 
 		 289 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000554633  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  37.37 
 
 		 367 aa  190  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3846  DNA processing Smf protein  42.13 
 
 		 289 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  39.08 
 
 		 364 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  38.99 
 
 		 349 aa  189  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  44.93 
 
 		 362 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3575  SMF family nucleotide-binding protein  42.13 
 
 		 289 aa  189  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00451445  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0922  DNA processing protein, Smf family  45.85 
 
 		 279 aa  189  4e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  42.48 
 
 		 338 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  43.69 
 
 		 361 aa  189  5.999999999999999e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  42.92 
 
 		 362 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  41.53 
 
 		 365 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  42.62 
 
 		 368 aa  188  7e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  38.41 
 
 		 366 aa  188  8e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  44.3 
 
 		 361 aa  187  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3876  Smf family DNA processing protein  41.28 
 
 		 289 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000864886  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1006  DprA/SMF protein, putative DNA processing factor  46.34 
 
 		 280 aa  187  2e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.048542  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  41.78 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3657  DNA protecting protein DprA  43.3 
 
 		 289 aa  187  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00245639  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  42.92 
 
 		 338 aa  186  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  43.88 
 
 		 361 aa  186  5e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  42.48 
 
 		 338 aa  185  6e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  42.48 
 
 		 338 aa  185  6e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1101  DNA protecting protein DprA  46.6 
 
 		 294 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00287455  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0026  DNA protecting protein DprA  42.92 
 
 		 338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  38.4 
 
 		 356 aa  183  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  43.12 
 
 		 365 aa  183  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  37.86 
 
 		 370 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  44.23 
 
 		 369 aa  182  5.0000000000000004e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0915  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  39.07 
 
 		 281 aa  182  5.0000000000000004e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483862 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  39.51 
 
 		 366 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  43.46 
 
 		 352 aa  181  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  45.19 
 
 		 406 aa  180  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0033  DNA protecting protein DprA  43.3 
 
 		 339 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  44.71 
 
 		 373 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  44.55 
 
 		 409 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  42.03 
 
 		 360 aa  179  4e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3734  DNA protecting protein DprA  44.71 
 
 		 339 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.242141  hitchhiker  0.0022522 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  41.35 
 
 		 364 aa  178  8e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  44.71 
 
 		 373 aa  178  1e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  42.99 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04053  DNA protecting protein DprA  41.18 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1609  DNA protecting protein DprA  43.32 
 
 		 264 aa  176  3e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.709828  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  40.64 
 
 		 394 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  41.55 
 
 		 360 aa  176  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  33.56 
 
 		 371 aa  176  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0022  DNA-processing protein smf chain A  41.38 
 
 		 362 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638184  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  46.57 
 
 		 374 aa  176  5e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  43.63 
 
 		 379 aa  176  5e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  41.55 
 
 		 331 aa  175  8e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  39.84 
 
 		 356 aa  175  9e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  38.81 
 
 		 358 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  42.61 
 
 		 377 aa  174  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  34.15 
 
 		 395 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  41.35 
 
 		 401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  42.31 
 
 		 401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  42.47 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0314  DNA protecting protein DprA  41.63 
 
 		 392 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  40.97 
 
 		 369 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  40.53 
 
 		 369 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  39.47 
 
 		 337 aa  172  5e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  43.96 
 
 		 368 aa  172  5e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  35.54 
 
 		 425 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0660  DNA protecting protein DprA  42.92 
 
 		 375 aa  171  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137383  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  40.87 
 
 		 402 aa  171  9e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  40.8 
 
 		 360 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  41.15 
 
 		 389 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  34.6 
 
 		 375 aa  171  1e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  39.04 
 
 		 337 aa  171  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0045  DNA processing protein DprA, putative  40.89 
 
 		 338 aa  171  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.064372  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  37.06 
 
 		 382 aa  170  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  44.29 
 
 		 372 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  42.55 
 
 		 385 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0638  DNA protecting protein DprA  42.47 
 
 		 375 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  39.81 
 
 		 389 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  42.13 
 
 		 375 aa  169  4e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  40.08 
 
 		 368 aa  169  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0412  DNA protecting protein DprA  42.98 
 
 		 383 aa  167  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1994  DNA protecting protein DprA  41.92 
 
 		 293 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  40.42 
 
 		 365 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  40.64 
 
 		 399 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  38.8 
 
 		 374 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  40.42 
 
 		 365 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  41.44 
 
 		 358 aa  166  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0127  DNA processing protein DprA, putative  41.46 
 
 		 433 aa  166  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  42.29 
 
 		 359 aa  166  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>