More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_20450 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_20450  predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein involved in DNA uptake  100 
 
 		 231 aa  467  1.0000000000000001e-131  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.549529  normal  0.263835 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10410  DNA protecting protein DprA  46.89 
 
 		 319 aa  176  2e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000307116  unclonable  0.00000000139433 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07040  DNA protecting protein DprA  42.58 
 
 		 328 aa  161  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.688401  normal  0.79238 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1408  DNA protecting protein DprA  43.54 
 
 		 305 aa  160  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.313803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0702  SMF family protein  38.7 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000212454  unclonable  0.0000000268506 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  39.79 
 
 		 360 aa  148  8e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  39.27 
 
 		 360 aa  146  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  40.61 
 
 		 425 aa  143  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  43.63 
 
 		 366 aa  141  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  40.49 
 
 		 389 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0018  DNA protecting protein DprA  37.56 
 
 		 442 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.256916 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  39.51 
 
 		 296 aa  139  4.999999999999999e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  39.07 
 
 		 385 aa  138  7e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  39.02 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1348  DNA protecting protein DprA  40.2 
 
 		 361 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0122196  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  41.15 
 
 		 366 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  44 
 
 		 356 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  40.28 
 
 		 370 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  37.37 
 
 		 369 aa  134  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  37.24 
 
 		 362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  39.72 
 
 		 365 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  39.29 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  35.2 
 
 		 352 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2080  DNA protecting protein DprA  41.46 
 
 		 229 aa  132  6e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  39.32 
 
 		 372 aa  131  6.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1159  DNA protecting protein DprA  40.31 
 
 		 668 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.20942 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  38.46 
 
 		 369 aa  131  9e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  40.62 
 
 		 375 aa  130  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  40.62 
 
 		 362 aa  130  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  40.84 
 
 		 374 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  35.38 
 
 		 383 aa  130  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  43.46 
 
 		 379 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  38.58 
 
 		 362 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  38.78 
 
 		 389 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00230  putative Rossmann fold nucleotide-binding protein  39.73 
 
 		 362 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0026  DNA protecting protein DprA  33.77 
 
 		 338 aa  128  6e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0069  DNA protecting protein DprA  39.89 
 
 		 365 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0131518  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  38.1 
 
 		 320 aa  128  9.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  35 
 
 		 399 aa  128  9.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  38.78 
 
 		 365 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  38.74 
 
 		 367 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  38.73 
 
 		 366 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0088  DNA protecting protein DprA  37.68 
 
 		 365 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  hitchhiker  0.00000226151 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1480  DNA protecting protein DprA  42.21 
 
 		 402 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173906  normal  0.04573 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1317  DNA protecting protein DprA  37.24 
 
 		 330 aa  126  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2511  DNA protecting protein DprA  41.18 
 
 		 386 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  39.71 
 
 		 394 aa  126  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1177  DNA protecting protein DprA  41.12 
 
 		 402 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  37.37 
 
 		 365 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  38.27 
 
 		 365 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0990  DNA protecting protein DprA  43.27 
 
 		 475 aa  126  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638055  normal  0.0748697 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3066  DNA protecting protein DprA  40.61 
 
 		 422 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  38.53 
 
 		 422 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09850  DNA protecting protein DprA  39.41 
 
 		 383 aa  125  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3673  DNA protecting protein DprA  40.3 
 
 		 366 aa  125  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.917953  normal  0.236598 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  36.22 
 
 		 395 aa  125  5e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  38.5 
 
 		 371 aa  125  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0671  SMF protein  40.38 
 
 		 394 aa  125  6e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  35.92 
 
 		 372 aa  125  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3183  DNA protecting protein DprA  40.31 
 
 		 422 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  38.27 
 
 		 394 aa  125  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  39.06 
 
 		 366 aa  125  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  38.74 
 
 		 336 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  38.46 
 
 		 399 aa  125  8.000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1006  DprA/SMF protein, putative DNA processing factor  38.31 
 
 		 280 aa  124  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.048542  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4510  DNA protecting protein DprA  39.36 
 
 		 373 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00273954  hitchhiker  0.000201451 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2486  DNA protecting protein DprA  38.54 
 
 		 291 aa  124  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000522014  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  39.27 
 
 		 359 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0022  DNA-processing protein smf chain A  39.9 
 
 		 362 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638184  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0412  DNA processing chain A  33.79 
 
 		 368 aa  124  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.232612  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3734  DNA protecting protein DprA  34.07 
 
 		 339 aa  124  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.242141  hitchhiker  0.0022522 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0127  DNA processing protein DprA, putative  36.97 
 
 		 433 aa  123  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  35.32 
 
 		 364 aa  123  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1572  DNA protecting protein DprA  37 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0025  DNA protecting protein DprA  32.11 
 
 		 379 aa  123  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3128  DNA protecting protein DprA  39.9 
 
 		 475 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  38.38 
 
 		 365 aa  123  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  39.27 
 
 		 402 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  39.27 
 
 		 401 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2514  DNA processing protein DprA, putative  39.9 
 
 		 475 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  40.43 
 
 		 366 aa  122  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23650  DNA protecting protein DprA  40 
 
 		 399 aa  122  6e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0566962  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  38.89 
 
 		 368 aa  122  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2191  DNA protecting protein DprA  33.77 
 
 		 384 aa  122  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0946717  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  39 
 
 		 364 aa  122  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  40.31 
 
 		 358 aa  121  8e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  39.59 
 
 		 448 aa  121  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1277  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  37.7 
 
 		 288 aa  121  8e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  37.68 
 
 		 401 aa  121  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  41.58 
 
 		 358 aa  121  9e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  36.87 
 
 		 421 aa  121  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  36.97 
 
 		 434 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0317  DNA protecting protein DprA  38.58 
 
 		 373 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.595486  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3967  DNA protecting protein DprA  36.73 
 
 		 373 aa  120  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0345  SMF family protein  36.79 
 
 		 434 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  36.97 
 
 		 434 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0883  putative DNA processing protein DprA  35.2 
 
 		 375 aa  121  9.999999999999999e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.430936  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  36.73 
 
 		 349 aa  120  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0922  DNA processing protein, Smf family  39.8 
 
 		 279 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  36.84 
 
 		 388 aa  120  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>