More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1006 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1006  DprA/SMF protein, putative DNA processing factor  100 
 
 		 280 aa  571  1.0000000000000001e-162  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.048542  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0922  DNA processing protein, Smf family  72.4 
 
 		 279 aa  428  1e-119  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1305  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  60.93 
 
 		 282 aa  362  4e-99  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.203251  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  47.77 
 
 		 349 aa  205  6e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1101  DNA protecting protein DprA  43.7 
 
 		 294 aa  205  6e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00287455  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0778  DNA protecting protein DprA  49.28 
 
 		 291 aa  203  2e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000253647  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  44.69 
 
 		 320 aa  200  3e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  47.14 
 
 		 394 aa  199  5e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  44.49 
 
 		 362 aa  198  7e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  49.26 
 
 		 425 aa  194  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  44.91 
 
 		 377 aa  193  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  44.3 
 
 		 365 aa  194  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1020  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  43.72 
 
 		 295 aa  193  2e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.274867  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  48.82 
 
 		 374 aa  192  4e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  46.67 
 
 		 336 aa  192  4e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  50 
 
 		 370 aa  192  5e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  46.26 
 
 		 364 aa  192  6e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  44.49 
 
 		 372 aa  192  8e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  46.15 
 
 		 358 aa  191  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  42.42 
 
 		 337 aa  191  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  48.08 
 
 		 366 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  41.99 
 
 		 337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  41.25 
 
 		 361 aa  189  5.999999999999999e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  45.19 
 
 		 368 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  41.25 
 
 		 361 aa  188  7e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  45.67 
 
 		 401 aa  188  8e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  42.86 
 
 		 405 aa  187  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0915  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  47.52 
 
 		 281 aa  188  1e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483862 
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  43.29 
 
 		 406 aa  187  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  46.34 
 
 		 383 aa  187  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1277  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  46.34 
 
 		 288 aa  187  2e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  37.86 
 
 		 375 aa  186  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  42.32 
 
 		 362 aa  186  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  46.41 
 
 		 364 aa  185  6e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  42.98 
 
 		 367 aa  185  7e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  41.41 
 
 		 338 aa  185  8e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  41.53 
 
 		 356 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3593  SMF family nucleotide-binding protein  45.19 
 
 		 289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.46698  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1209  DNA processing protein DprA, putative  44.17 
 
 		 360 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  41.41 
 
 		 338 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  41.41 
 
 		 338 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1994  DNA protecting protein DprA  40.55 
 
 		 293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00024  DNA protecting protein DprA  44.6 
 
 		 369 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525554  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3932  DNA processing Smf protein  45.19 
 
 		 289 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000528379  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  37.98 
 
 		 359 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3657  DNA protecting protein DprA  45.12 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00245639  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  40.87 
 
 		 338 aa  183  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  39.37 
 
 		 359 aa  183  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3881  DNA processing Smf protein  44.19 
 
 		 289 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000554633  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  45 
 
 		 399 aa  182  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0771  DNA protecting protein DprA  43.44 
 
 		 553 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0319665 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  42.86 
 
 		 373 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0033  DNA protecting protein DprA  45.81 
 
 		 339 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  42.36 
 
 		 369 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3575  SMF family nucleotide-binding protein  45.19 
 
 		 289 aa  182  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00451445  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1311  DNA processing Smf protein  45.19 
 
 		 289 aa  182  6e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3846  DNA processing Smf protein  45.19 
 
 		 289 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  39.91 
 
 		 389 aa  182  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  46.31 
 
 		 366 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3876  Smf family DNA processing protein  43.72 
 
 		 289 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000864886  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2080  DNA protecting protein DprA  48.53 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  44.02 
 
 		 379 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  37.78 
 
 		 409 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  41.56 
 
 		 373 aa  181  1e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2486  DNA protecting protein DprA  46.41 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000522014  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  44.06 
 
 		 352 aa  181  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  43.75 
 
 		 402 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  43.75 
 
 		 401 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  44.21 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1159  DNA protecting protein DprA  43.78 
 
 		 668 aa  180  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.20942 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  44.88 
 
 		 372 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  43.63 
 
 		 434 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  43.81 
 
 		 361 aa  179  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  43.84 
 
 		 331 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  40.09 
 
 		 338 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1572  DNA protecting protein DprA  41.35 
 
 		 333 aa  179  4.999999999999999e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4323  DNA protecting protein DprA  41.43 
 
 		 418 aa  179  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  47 
 
 		 365 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  43.27 
 
 		 364 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2338  DNA processing protein DprA, putative  41.88 
 
 		 382 aa  179  5.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  39.65 
 
 		 338 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  39.52 
 
 		 379 aa  179  5.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  39.13 
 
 		 388 aa  178  7e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0097  DNA protecting protein DprA  46.01 
 
 		 387 aa  178  7e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  42.42 
 
 		 386 aa  178  9e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0141  DNA processing protein DprA, putative  39.18 
 
 		 396 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  40.87 
 
 		 372 aa  177  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2350  DNA protecting protein DprA  39.18 
 
 		 434 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2808  DNA protecting protein DprA  39.18 
 
 		 434 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2273  DNA protecting protein DprA  39.18 
 
 		 396 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  43.14 
 
 		 434 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0348  DNA protecting protein DprA  46.63 
 
 		 379 aa  177  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.083083 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  42.16 
 
 		 377 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  46.15 
 
 		 359 aa  178  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  39.65 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0026  DNA protecting protein DprA  40 
 
 		 340 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3734  DNA protecting protein DprA  43.27 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.242141  hitchhiker  0.0022522 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0345  SMF family protein  43.14 
 
 		 434 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  39.65 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  45.54 
 
 		 365 aa  177  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>