More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1159 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1159  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 668 aa  1319    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.20942 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0771  DNA protecting protein DprA  62.79 
 
 		 553 aa  365  2e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0319665 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0966  DNA protecting protein DprA  59.27 
 
 		 442 aa  344  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  56.33 
 
 		 425 aa  333  7.000000000000001e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  51.39 
 
 		 395 aa  279  1e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  48.97 
 
 		 367 aa  262  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  48.95 
 
 		 386 aa  236  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  40.64 
 
 		 362 aa  223  9e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  39.93 
 
 		 370 aa  213  7.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  45.04 
 
 		 365 aa  213  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  47.02 
 
 		 366 aa  212  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  41.92 
 
 		 361 aa  211  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  53.77 
 
 		 320 aa  210  7e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  44.17 
 
 		 359 aa  210  7e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  47.52 
 
 		 356 aa  210  8e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  41.19 
 
 		 364 aa  210  8e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  44.21 
 
 		 359 aa  209  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  44.44 
 
 		 372 aa  206  8e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  39.87 
 
 		 377 aa  205  2e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  38.65 
 
 		 362 aa  205  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  44.15 
 
 		 377 aa  206  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  45.14 
 
 		 365 aa  204  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  44.29 
 
 		 358 aa  205  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  45.95 
 
 		 379 aa  204  3e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  45.22 
 
 		 394 aa  204  5e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  48.09 
 
 		 338 aa  204  5e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  42.28 
 
 		 371 aa  204  5e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  48.09 
 
 		 338 aa  204  6e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  50.24 
 
 		 361 aa  203  7e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  42.51 
 
 		 389 aa  203  8e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  48.09 
 
 		 338 aa  203  8e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  44.6 
 
 		 372 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  40.07 
 
 		 399 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  46.48 
 
 		 366 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  47.66 
 
 		 338 aa  201  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  47.04 
 
 		 365 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  43.55 
 
 		 375 aa  201  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  42.51 
 
 		 385 aa  201  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  44.18 
 
 		 401 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  46.34 
 
 		 365 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  40.61 
 
 		 366 aa  201  5e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  41.99 
 
 		 361 aa  201  5e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  48.29 
 
 		 352 aa  200  6e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  41.96 
 
 		 359 aa  200  7.999999999999999e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  48 
 
 		 389 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  41.16 
 
 		 389 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  44.74 
 
 		 399 aa  199  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  46.19 
 
 		 331 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  44.88 
 
 		 421 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  44.24 
 
 		 375 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0026  DNA protecting protein DprA  46.38 
 
 		 340 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  51.53 
 
 		 368 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  39.07 
 
 		 349 aa  198  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3734  DNA protecting protein DprA  49.52 
 
 		 339 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.242141  hitchhiker  0.0022522 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  46.81 
 
 		 338 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  47.62 
 
 		 368 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  46.38 
 
 		 338 aa  197  6e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  48.33 
 
 		 422 aa  197  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  46.81 
 
 		 338 aa  197  7e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  46.81 
 
 		 338 aa  197  7e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  51.67 
 
 		 379 aa  196  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  50 
 
 		 394 aa  196  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  50.24 
 
 		 336 aa  196  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  43.15 
 
 		 401 aa  194  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  35.23 
 
 		 356 aa  193  8e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  35.84 
 
 		 369 aa  192  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  49.76 
 
 		 402 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  42.8 
 
 		 364 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0127  DNA processing protein DprA, putative  52.97 
 
 		 433 aa  193  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0088  DNA protecting protein DprA  52.38 
 
 		 365 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  hitchhiker  0.00000226151 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1305  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  42.99 
 
 		 282 aa  191  2.9999999999999997e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.203251  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0033  DNA protecting protein DprA  49.75 
 
 		 339 aa  191  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0069  DNA protecting protein DprA  51.43 
 
 		 365 aa  191  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0131518  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  44.14 
 
 		 365 aa  190  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3194  SMF protein  41.9 
 
 		 374 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  44.14 
 
 		 365 aa  190  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0922  DNA processing protein, Smf family  45.37 
 
 		 279 aa  190  8e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  39.1 
 
 		 406 aa  190  9e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  44.84 
 
 		 368 aa  190  9e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  37.5 
 
 		 373 aa  189  1e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  45.58 
 
 		 448 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  52.48 
 
 		 434 aa  189  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2338  DNA processing protein DprA, putative  41.2 
 
 		 382 aa  189  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  38.75 
 
 		 373 aa  188  3e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  36.68 
 
 		 365 aa  188  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  44.86 
 
 		 375 aa  188  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  52.48 
 
 		 434 aa  188  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2808  DNA protecting protein DprA  52.48 
 
 		 434 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2350  DNA protecting protein DprA  52.48 
 
 		 434 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0141  DNA processing protein DprA, putative  52.48 
 
 		 396 aa  188  4e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2273  DNA protecting protein DprA  52.48 
 
 		 396 aa  188  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0345  SMF family protein  52.48 
 
 		 434 aa  187  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0021  SMF protein  43.71 
 
 		 372 aa  187  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0730  DNA protecting protein DprA  43.63 
 
 		 373 aa  187  8e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  42.11 
 
 		 387 aa  186  8e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  44.53 
 
 		 405 aa  186  9e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  36.45 
 
 		 383 aa  186  9e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2080  DNA protecting protein DprA  47.32 
 
 		 229 aa  186  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  45.37 
 
 		 308 aa  186  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0026  DNA protecting protein DprA  47.85 
 
 		 338 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>