More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0890 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  100 
 
 		 358 aa  710    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  72.68 
 
 		 356 aa  495  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  67.79 
 
 		 359 aa  489  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  60.34 
 
 		 359 aa  425  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  59.78 
 
 		 359 aa  421  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  58.38 
 
 		 371 aa  397  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  54.95 
 
 		 364 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  47.55 
 
 		 389 aa  322  6e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  48.35 
 
 		 386 aa  305  1.0000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  42.78 
 
 		 370 aa  297  2e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  46.48 
 
 		 361 aa  293  2e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  44.47 
 
 		 385 aa  280  3e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  45.07 
 
 		 366 aa  279  6e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  41.85 
 
 		 362 aa  278  9e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  46.78 
 
 		 336 aa  276  4e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  45.05 
 
 		 372 aa  273  3e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  39.34 
 
 		 374 aa  271  1e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  43.27 
 
 		 366 aa  270  4e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  47.4 
 
 		 365 aa  268  1e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  43.49 
 
 		 364 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  47.4 
 
 		 365 aa  268  1e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  46.29 
 
 		 385 aa  267  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  45.63 
 
 		 360 aa  267  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  44.48 
 
 		 379 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  41.69 
 
 		 373 aa  261  1e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  38.12 
 
 		 356 aa  261  2e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  37.64 
 
 		 409 aa  261  2e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  39.89 
 
 		 373 aa  260  3e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  43.01 
 
 		 374 aa  260  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  46.05 
 
 		 358 aa  259  4e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  44.17 
 
 		 388 aa  258  9e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  42.29 
 
 		 365 aa  257  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  45.24 
 
 		 360 aa  257  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  40.64 
 
 		 406 aa  256  3e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5115  DNA protecting protein DprA  44.35 
 
 		 382 aa  257  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  42.05 
 
 		 362 aa  256  4e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  38.48 
 
 		 369 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  41.23 
 
 		 369 aa  254  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  45 
 
 		 365 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  42.47 
 
 		 394 aa  252  7e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  44.04 
 
 		 368 aa  251  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  40.55 
 
 		 377 aa  250  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  45.61 
 
 		 372 aa  249  5e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  41.6 
 
 		 401 aa  248  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  44.29 
 
 		 367 aa  248  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  40.22 
 
 		 389 aa  248  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  39.58 
 
 		 364 aa  247  2e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  45.53 
 
 		 364 aa  247  3e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  40.05 
 
 		 395 aa  246  4e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  44.62 
 
 		 375 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  39.83 
 
 		 382 aa  245  9.999999999999999e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  42.09 
 
 		 399 aa  242  6e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  43.01 
 
 		 379 aa  242  7e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  37.25 
 
 		 349 aa  242  9e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  39.36 
 
 		 448 aa  241  9e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1610  DNA protecting protein DprA  39.62 
 
 		 370 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  47.54 
 
 		 320 aa  240  2e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  44.38 
 
 		 362 aa  241  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0097  DNA protecting protein DprA  44.79 
 
 		 387 aa  241  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  39.2 
 
 		 361 aa  240  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  40 
 
 		 382 aa  239  4e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  40 
 
 		 365 aa  239  4e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  42.96 
 
 		 363 aa  239  5e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  42.74 
 
 		 389 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  43.94 
 
 		 402 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  41.71 
 
 		 386 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  41.1 
 
 		 399 aa  239  6.999999999999999e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  47.08 
 
 		 401 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 386 aa  237  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1447  SMF protein  38.58 
 
 		 385 aa  237  3e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  37.47 
 
 		 372 aa  236  4e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  41.27 
 
 		 408 aa  236  4e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  39.01 
 
 		 421 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  39.18 
 
 		 375 aa  235  9e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  41.09 
 
 		 399 aa  234  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0383  DNA protecting protein DprA  37.91 
 
 		 381 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.2777  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  42.94 
 
 		 365 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1041  DNA protecting protein DprA  45.87 
 
 		 338 aa  233  3e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.367593  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  39.83 
 
 		 368 aa  233  4.0000000000000004e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  38.35 
 
 		 361 aa  232  6e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0415  DNA protecting protein DprA  37.3 
 
 		 382 aa  232  6e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  39.54 
 
 		 422 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  35.29 
 
 		 368 aa  232  9e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  40.45 
 
 		 425 aa  232  9e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0412  DNA protecting protein DprA  44.15 
 
 		 383 aa  231  1e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  41.71 
 
 		 369 aa  232  1e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  39.73 
 
 		 375 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  40.95 
 
 		 377 aa  230  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0348  DNA protecting protein DprA  41.71 
 
 		 379 aa  231  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.083083 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1433  DNA protecting protein DprA  35.44 
 
 		 363 aa  230  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  41.81 
 
 		 365 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2083  transcriptional regulator TrmB  43.52 
 
 		 337 aa  229  7e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  32.69 
 
 		 360 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  34.9 
 
 		 748 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  44.06 
 
 		 331 aa  226  4e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3183  DNA protecting protein DprA  38.87 
 
 		 422 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3567  DNA processing protein DprA, putative  42.7 
 
 		 371 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  44.77 
 
 		 308 aa  225  1e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  32.13 
 
 		 360 aa  225  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  38.87 
 
 		 422 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>