More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3718 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 389 aa  787    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  41.29 
 
 		 361 aa  268  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  41.96 
 
 		 389 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  39.78 
 
 		 362 aa  252  6e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  40.72 
 
 		 359 aa  252  7e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  42.05 
 
 		 362 aa  252  1e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  40.94 
 
 		 374 aa  248  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  39.78 
 
 		 358 aa  248  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  42 
 
 		 366 aa  246  4e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  42.81 
 
 		 370 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  41.34 
 
 		 364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  38.34 
 
 		 371 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  38.8 
 
 		 364 aa  241  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  40.22 
 
 		 373 aa  241  2e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  40.77 
 
 		 365 aa  241  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  40.33 
 
 		 399 aa  240  2.9999999999999997e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  39.66 
 
 		 356 aa  239  5e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  40.5 
 
 		 373 aa  239  5e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  40.43 
 
 		 366 aa  238  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  40.11 
 
 		 360 aa  238  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  39.68 
 
 		 359 aa  238  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  36.39 
 
 		 409 aa  238  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  40.44 
 
 		 406 aa  237  3e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  39.01 
 
 		 385 aa  236  6e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  43.48 
 
 		 372 aa  235  9e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  41.96 
 
 		 359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  42.07 
 
 		 386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  39.78 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2088  DNA protecting protein DprA  42.89 
 
 		 384 aa  229  5e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.972888  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  39.11 
 
 		 364 aa  225  9e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  39.84 
 
 		 360 aa  223  4e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  39.08 
 
 		 395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  38.29 
 
 		 375 aa  219  7e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  45.6 
 
 		 320 aa  219  7.999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  38.75 
 
 		 374 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  37.82 
 
 		 367 aa  216  5e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  40.22 
 
 		 377 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  39.84 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  39.26 
 
 		 362 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  41.64 
 
 		 389 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  38.44 
 
 		 364 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  40.05 
 
 		 365 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  36.22 
 
 		 382 aa  213  7e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  43.39 
 
 		 336 aa  211  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  40.2 
 
 		 369 aa  211  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  38.2 
 
 		 365 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  40.31 
 
 		 368 aa  207  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  36.86 
 
 		 369 aa  207  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0018  DNA protecting protein DprA  46.91 
 
 		 442 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.256916 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  37.8 
 
 		 349 aa  207  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  42.24 
 
 		 434 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  38.94 
 
 		 374 aa  206  4e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  42.24 
 
 		 434 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  40.21 
 
 		 365 aa  206  4e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  38.36 
 
 		 385 aa  206  7e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  38.07 
 
 		 401 aa  205  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  37.57 
 
 		 377 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  38.33 
 
 		 375 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0883  putative DNA processing protein DprA  37.86 
 
 		 375 aa  204  2e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.430936  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  37.93 
 
 		 365 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3916  DNA protecting protein DprA  44.19 
 
 		 378 aa  202  9e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  40.68 
 
 		 383 aa  201  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  40.13 
 
 		 361 aa  201  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  43.64 
 
 		 379 aa  202  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  37.2 
 
 		 421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  40.26 
 
 		 394 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  36.56 
 
 		 372 aa  200  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  44.01 
 
 		 366 aa  200  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0602  DNA processing protein DprA, putative  39.06 
 
 		 393 aa  199  6e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2244  DNA processing protein DprA, putative  39.24 
 
 		 372 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441275  normal  0.282732 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1159  DNA protecting protein DprA  41.16 
 
 		 668 aa  199  7e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.20942 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2010  SMF protein  39.23 
 
 		 372 aa  199  7e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.272582 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2285  DNA processing protein DprA, putative  39.12 
 
 		 372 aa  199  7e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0141  DNA processing protein DprA, putative  42.24 
 
 		 396 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2273  DNA protecting protein DprA  42.24 
 
 		 396 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  35.78 
 
 		 356 aa  199  9e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  46.47 
 
 		 382 aa  199  9e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2350  DNA protecting protein DprA  42.16 
 
 		 434 aa  199  9e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  43.55 
 
 		 368 aa  199  9e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2808  DNA protecting protein DprA  42.16 
 
 		 434 aa  199  9e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  44.21 
 
 		 401 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0345  SMF family protein  42.16 
 
 		 434 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  41.08 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  38.57 
 
 		 365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  38.57 
 
 		 365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  45.2 
 
 		 402 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3772  DNA protecting protein DprA  38.38 
 
 		 374 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4608  DNA protecting protein DprA  42.52 
 
 		 374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0168836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1644  DNA protecting protein DprA  40.31 
 
 		 395 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.263138 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  39.81 
 
 		 361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3709  DNA protecting protein DprA  38.38 
 
 		 374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.0813608 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3601  DNA protecting protein DprA  38.38 
 
 		 374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000541333  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  42.07 
 
 		 388 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3674  DNA protecting protein DprA  38.38 
 
 		 374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  36.13 
 
 		 360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5115  DNA protecting protein DprA  37.04 
 
 		 382 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  37.91 
 
 		 399 aa  197  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3768  DNA protecting protein DprA  41.2 
 
 		 374 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00137702  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3602  DNA protecting protein DprA  38.38 
 
 		 374 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.62233 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  38.53 
 
 		 363 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>