More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1377 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 366 aa  737    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  36.16 
 
 		 349 aa  214  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  42.7 
 
 		 337 aa  205  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  36.83 
 
 		 361 aa  204  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  42.7 
 
 		 337 aa  203  4e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  38.57 
 
 		 368 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  36.41 
 
 		 359 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  38.57 
 
 		 748 aa  199  7e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  37.9 
 
 		 356 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  34.32 
 
 		 385 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3673  DNA protecting protein DprA  50.23 
 
 		 366 aa  195  9e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.917953  normal  0.236598 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1348  DNA protecting protein DprA  43.21 
 
 		 361 aa  194  1e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0122196  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  37.06 
 
 		 358 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  36.52 
 
 		 365 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  38.46 
 
 		 369 aa  193  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  33.6 
 
 		 372 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  42.97 
 
 		 405 aa  192  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  36.52 
 
 		 370 aa  191  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  36.07 
 
 		 360 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  37.82 
 
 		 371 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  40.34 
 
 		 406 aa  189  7e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  44.88 
 
 		 374 aa  189  9e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  36.07 
 
 		 360 aa  188  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  31.71 
 
 		 362 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  42.51 
 
 		 356 aa  187  2e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1572  DNA protecting protein DprA  36.52 
 
 		 333 aa  187  3e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  37.87 
 
 		 388 aa  187  3e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  39.66 
 
 		 373 aa  187  3e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  40.18 
 
 		 425 aa  186  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  42.59 
 
 		 364 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  38.89 
 
 		 359 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  34.79 
 
 		 373 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  35.34 
 
 		 386 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  34.15 
 
 		 366 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0660  DNA protecting protein DprA  37.68 
 
 		 375 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137383  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0180  DNA protecting protein DprA  34.66 
 
 		 382 aa  183  4.0000000000000006e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  41.34 
 
 		 375 aa  182  6e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  34.41 
 
 		 389 aa  182  7e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  42.86 
 
 		 362 aa  182  8.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  39.51 
 
 		 379 aa  182  8.000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0638  DNA protecting protein DprA  37.32 
 
 		 375 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2723  DNA protecting protein DprA  30.06 
 
 		 369 aa  182  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.36752  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  35.86 
 
 		 366 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  40.69 
 
 		 368 aa  182  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  34.84 
 
 		 360 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  35.59 
 
 		 362 aa  179  4.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  34.71 
 
 		 364 aa  179  8e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  41.74 
 
 		 364 aa  179  8e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  35.6 
 
 		 375 aa  178  1e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1609  DNA protecting protein DprA  39.53 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.709828  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  37.78 
 
 		 359 aa  176  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  42.16 
 
 		 363 aa  176  5e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  38.26 
 
 		 365 aa  176  6e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  40.79 
 
 		 448 aa  176  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  36.89 
 
 		 360 aa  176  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  36.89 
 
 		 394 aa  176  8e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  35.2 
 
 		 336 aa  176  8e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3932  DNA processing Smf protein  35.38 
 
 		 289 aa  175  9e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000528379  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  35.66 
 
 		 389 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2088  DNA protecting protein DprA  37.67 
 
 		 384 aa  175  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.972888  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1610  DNA protecting protein DprA  32.61 
 
 		 370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1317  DNA protecting protein DprA  35.95 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0915  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  34.49 
 
 		 281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483862 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2083  transcriptional regulator TrmB  38.41 
 
 		 337 aa  174  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  44.06 
 
 		 369 aa  173  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  39.08 
 
 		 385 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3657  DNA protecting protein DprA  39.91 
 
 		 289 aa  173  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00245639  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1311  DNA processing Smf protein  34.62 
 
 		 289 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302749  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3575  SMF family nucleotide-binding protein  35 
 
 		 289 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00451445  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0778  DNA protecting protein DprA  44.06 
 
 		 291 aa  172  7.999999999999999e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000253647  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1101  DNA protecting protein DprA  40.71 
 
 		 294 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00287455  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  33.93 
 
 		 409 aa  172  9e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3593  SMF family nucleotide-binding protein  35 
 
 		 289 aa  172  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.46698  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  43.49 
 
 		 372 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3881  DNA processing Smf protein  35.38 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000554633  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  35.71 
 
 		 364 aa  171  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  39.93 
 
 		 401 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  44.04 
 
 		 389 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  38.75 
 
 		 421 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2345  DNA processing protein DprA, putative  37.46 
 
 		 358 aa  171  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2080  DNA protecting protein DprA  42.92 
 
 		 229 aa  171  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  37.89 
 
 		 320 aa  170  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0157  DNA protecting protein DprA  37.59 
 
 		 372 aa  170  3e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.835588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  37.1 
 
 		 422 aa  170  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3846  DNA processing Smf protein  34.62 
 
 		 289 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3876  Smf family DNA processing protein  33.09 
 
 		 289 aa  169  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000864886  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  40.07 
 
 		 422 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  34.07 
 
 		 374 aa  169  7e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  35.53 
 
 		 379 aa  169  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2486  DNA protecting protein DprA  39.45 
 
 		 291 aa  168  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000522014  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2933  DNA protecting protein DprA  37.13 
 
 		 380 aa  167  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.608648  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3066  DNA protecting protein DprA  39.86 
 
 		 422 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  38.61 
 
 		 401 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1931  DNA processing chain A  37.59 
 
 		 381 aa  166  4e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  39.7 
 
 		 366 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1867  DNA protecting protein DprA  37.59 
 
 		 381 aa  166  8e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3128  DNA protecting protein DprA  39.79 
 
 		 475 aa  166  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2182  DNA protecting protein DprA  32.65 
 
 		 365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00480655  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1396  DNA processing protein DprA, putative  39.08 
 
 		 368 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.649924  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  37.93 
 
 		 387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>