More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2191 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2191  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 384 aa  744    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0946717  normal  0.901386 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1318  DNA protecting protein DprA  52.36 
 
 		 444 aa  333  4e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1209  DNA protecting protein DprA  51.44 
 
 		 452 aa  328  7e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3415  DNA protecting protein DprA  47.26 
 
 		 387 aa  281  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3996  DNA protecting protein DprA  48.19 
 
 		 422 aa  277  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0990  DNA protecting protein DprA  45.71 
 
 		 475 aa  261  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638055  normal  0.0748697 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1548  DNA protecting protein DprA  52.13 
 
 		 391 aa  254  3e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.20886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1858  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  43.5 
 
 		 396 aa  253  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  hitchhiker  0.00651172 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09850  DNA protecting protein DprA  49.32 
 
 		 383 aa  248  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5401  SMF family protein  47.56 
 
 		 310 aa  247  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.219936  normal  0.277255 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4138  DNA protecting protein DprA  41.97 
 
 		 388 aa  238  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1524  DNA protecting protein DprA  46.69 
 
 		 600 aa  235  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0174562  hitchhiker  0.00583447 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0671  SMF protein  48.24 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2204  transcriptional regulator, TrmB  47.57 
 
 		 379 aa  228  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382652 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1480  DNA protecting protein DprA  45.36 
 
 		 402 aa  227  3e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173906  normal  0.04573 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1409  DNA protecting protein DprA  47.04 
 
 		 395 aa  227  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.79779  normal  0.0660954 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1967  DNA protecting protein DprA  46.13 
 
 		 376 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1987  DNA processing protein DprA, putative  46.13 
 
 		 376 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2268  DNA protecting protein DprA  48.16 
 
 		 349 aa  224  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2033  DNA protecting protein DprA  46.13 
 
 		 376 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.677839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3246  DNA protecting protein DprA  45.6 
 
 		 378 aa  224  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.261915  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3584  DNA processing protein DprA, putative  47.87 
 
 		 446 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0233  DNA protecting protein DprA  41.9 
 
 		 400 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1158  DNA protecting protein DprA  44.41 
 
 		 408 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134749  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3121  DNA protecting protein DprA  39.7 
 
 		 423 aa  211  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0011897  normal  0.148234 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1643  DNA protecting protein DprA  41.33 
 
 		 388 aa  206  7e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0293529  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11160  DNA protecting protein DprA  42.35 
 
 		 371 aa  205  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0892181  normal  0.950847 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1177  DNA protecting protein DprA  44.12 
 
 		 402 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2511  DNA protecting protein DprA  41.42 
 
 		 386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2097  DNA protecting protein DprA  38.72 
 
 		 374 aa  196  7e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12910  hypothetical protein  41.24 
 
 		 389 aa  195  9e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000201466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10090  DNA protecting protein DprA  42.26 
 
 		 428 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2472  DNA protecting protein DprA  43.21 
 
 		 394 aa  190  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.156193  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23650  DNA protecting protein DprA  43.52 
 
 		 399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0566962  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2211  DNA protecting protein DprA  43.53 
 
 		 402 aa  181  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000321708 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1000  DNA protecting protein DprA  37.31 
 
 		 395 aa  168  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09260  DNA protecting protein DprA  40.62 
 
 		 424 aa  166  8e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.180441  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  39.83 
 
 		 374 aa  160  5e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  39.45 
 
 		 358 aa  159  6e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  45.41 
 
 		 394 aa  159  8e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0637  DNA protecting protein DprA  42.73 
 
 		 514 aa  158  1e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.3144 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  33.9 
 
 		 362 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  41.83 
 
 		 359 aa  156  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  46.12 
 
 		 365 aa  152  8.999999999999999e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  44.71 
 
 		 356 aa  151  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  42.39 
 
 		 434 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0127  DNA processing protein DprA, putative  43.04 
 
 		 433 aa  151  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0141  DNA processing protein DprA, putative  42.39 
 
 		 396 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  39.13 
 
 		 377 aa  150  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2273  DNA protecting protein DprA  42.39 
 
 		 396 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  42.39 
 
 		 434 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0345  SMF family protein  42.39 
 
 		 434 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2808  DNA protecting protein DprA  42.39 
 
 		 434 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2350  DNA protecting protein DprA  42.39 
 
 		 434 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1290  DNA protecting protein DprA  36.86 
 
 		 363 aa  150  5e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00929772  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  38.51 
 
 		 359 aa  150  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  41.85 
 
 		 361 aa  149  9e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  40.47 
 
 		 385 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  43.27 
 
 		 365 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  41.75 
 
 		 366 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  42.98 
 
 		 389 aa  146  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  39.57 
 
 		 366 aa  146  6e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  33.21 
 
 		 352 aa  146  6e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3673  DNA protecting protein DprA  46.15 
 
 		 366 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.917953  normal  0.236598 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  35.92 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  42.59 
 
 		 405 aa  144  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  41.6 
 
 		 377 aa  143  5e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1317  DNA protecting protein DprA  39.9 
 
 		 330 aa  143  5e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0839  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  40 
 
 		 362 aa  143  6e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00754519  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  35.97 
 
 		 371 aa  143  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0026  DNA protecting protein DprA  36.6 
 
 		 338 aa  142  7e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  37.39 
 
 		 386 aa  143  7e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  35.44 
 
 		 360 aa  142  8e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  36.18 
 
 		 374 aa  142  9e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  34.69 
 
 		 336 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  42.98 
 
 		 385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1159  DNA protecting protein DprA  42.31 
 
 		 668 aa  140  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.20942 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  41.05 
 
 		 399 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  36 
 
 		 379 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  39.8 
 
 		 364 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0678  putative DNA uptake protein  45.85 
 
 		 514 aa  140  4.999999999999999e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0771  DNA protecting protein DprA  45.36 
 
 		 553 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0319665 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  44.68 
 
 		 375 aa  139  6e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  38.05 
 
 		 359 aa  139  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1572  DNA protecting protein DprA  28.57 
 
 		 333 aa  140  6e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  44.32 
 
 		 395 aa  139  7e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  45.18 
 
 		 360 aa  139  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  31.76 
 
 		 370 aa  139  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0443  DNA protecting protein DprA  37.3 
 
 		 375 aa  138  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0740883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  31.79 
 
 		 409 aa  139  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  41.33 
 
 		 389 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  47.21 
 
 		 360 aa  138  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  41.92 
 
 		 399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  37.55 
 
 		 422 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  30.92 
 
 		 337 aa  137  4e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  39.44 
 
 		 320 aa  137  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  37.93 
 
 		 425 aa  136  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  30.92 
 
 		 337 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  39.78 
 
 		 364 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  34.65 
 
 		 372 aa  135  8e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>